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科研学霸天团,48小时有问必答
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问
western提取出来的蛋白质保存方法?
府宅
蛋白样品放到-80℃也并不完全保险,虽然能存放久一些,但是最好不要冻融超过两次。蛋白浓度测定后,可以加入loading buffer 煮样,煮后可根据实验需要分装成小管,下次实验前拿出小管再次煮样即可。
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问
提高电泳分辨率的途径有哪些?
bqejjh123
聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高电泳的分辨率。
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问
westernblot加样的顺序是什么?
dxy_gwrp7ndq
上样顺序一般是让与抗体有反应的样品和没有反应的样品间隔开,这样条带之间反差比较明显。
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问
WB中内参的意义是什么?
dxy_gwrp7ndq
1. 是看提取蛋白质量的好坏。如果做western的时候,内参照蛋白有条带,而目的蛋白没有,说明蛋白的提取和转膜等步骤没有问题,是目的蛋白的抗体质量不好或者是稀释倍数不对。2. 是比较客观的说明目的蛋白的表达情况,消除上样量等的误差。不同的标本之间由于蛋白提取的量有差别,可能强阳性的表达跑出来的带很弱。因此设立内参照,比较不同标本之间的表达情况。
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问
WB中BCA法标准曲线怎么做?
邓豆豆逗
找一个已知准确浓度的蛋白(一般试剂盒的话里面是有的),自己也可以用bsa配,然后稀释一个浓度梯度,比如2,1.5,1,0.8,0.6,0.4,0.2,0.1,0ug/ul,然后每个样至少三个复孔,做出来的od值和浓度做一个散点图,添加趋势线得到公式,然后再将样本的od值带入公式求得浓度就行了
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问
免疫组化时染色比较弱 拍图不好看 怎么调整?
dxywode
小心处理组织样本,尽量保持组织细胞结构的完整性。如果组织的穿透力差,则要制备较薄的切片。调整好固定液的理想pH、固定时间和温度。可考虑用单抗(不是多抗),避免交叉反应。如果非特异性结合太强,则适当减少抗体的孵育时间。
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问
做WB曝光后目的蛋白位置出现2个相邻条带,但是抗体说明书上没有提过会有2条带情况,原因可能是什么呢?
邓豆豆逗
可以先看一下抗体官网的一些效果图,是否做出来有两条带的现象,其次查一下相关文献,看这个蛋白是否有剪切体或一些修饰之类的,还有可能是蛋白降解了,这时候可以找一个阳性对照一起做,如果阳性对照是单条带,就考虑是样本的原因了
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问
怎样提高WB实验蛋白定量与上样量的效率及准确性?
bamboopiggy
这个,只能说 勤能补拙,多做,经验丰富了就好了。一般情况下,在做标曲的时候,加样要准确,标曲出来的R^2值,接近0.99最好。样品稀释时,枪尖要和枪match,吸液时,枪尖别下的太深。上样时,同样注意枪尖和枪的match程度,以及枪的准确性。
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问
蛋白质的等电点是否与蛋白质的质量有关?
天一湖医者
蛋白质是两性电解质,其等电点和它所含的酸性氨基酸和碱性氨基酸的数量比例有关。各种蛋白质因氨基酸残基组成不同,等电点也不一样。
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问
磷酸化的抗体为什么总是杂不好
bamboopiggy
我牛奶和bsa都用过,这个其实是要看你的抗体好不好用,如果抗体好用,怎么杂怎么出。如果抗体不好用,一般都杂不好。此外,可以考虑在收样的lysis里面加点磷酸酶抑制剂。实在杂的难看,就换家公司买抗体,磷酸化的抗体,一般cst的还是不错的。
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问
请问梯度胶好用吗?可以同时收集到20kDa和150kDa分子量的蛋白吗?
dxy_gwrp7ndq
使用梯度胶,小分子量蛋白运动至在胶浓度更高的底部(正极),同时大分子量蛋白在顶部有更好的分离。如下图:选择最佳的丙烯酰胺凝胶浓度达到高效的蛋白分离
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问
纯化后的蛋白质怎样保存?
dxy_gwrp7ndq
1. 低温低温下保存蛋白质是极其必要的。低温意味着更低的能量,低温下蛋白质分子热运动较低,其内部的成键不容易断裂。另外,在低温下,微生物不容易生长,可能存在的蛋白酶的活性也会很低,这些更容易保证蛋白质的活性。2. 分装蛋白质有时候是需要冷冻保存的,但我们使用蛋白质时却是在室温或者更高的温度。冻融这一过程会对蛋白质造成不可逆的损伤。因此我们需要尽量减少冻融的次数。纯化后的蛋白质,进行分装保存,每次需
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问
如何避免蛋白质谱实验中的二次污染问题
府宅
在质谱分析中,最常见的蛋白质污染物包括角蛋白和血清白蛋白。其他质谱(MS)蛋白污染物还包括酪蛋白和大肠杆菌蛋白质。在实验中,可以通过以下方法避免将上述蛋白质污染物引入样品:1. 保持实验室清洁、减少灰尘和空气流动;2. 使用一次性过滤吸头;3. 定期清洗电泳、染色、微量离心机等设备,避免通过接触或气溶胶引入污染物颗粒;4. 穿戴洁净的实验服和手套。
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问
蛋白纯化实验前需要先做好哪些准备?
dxy_gwrp7ndq
对于微生物,应注意它的生长期,在微生物的对数生长期,酶和核酸的含量较高,可以获得高产量,以微生物为材料时有两种情况: (1)得用微生物菌体分泌到培养基中的代谢产物和胞外酶等; (2)利用菌体含有的生化物质,如蛋白质、核酸和胞内酶等。植物材料必须经过去壳,脱脂并注意植物品种和生长发育状况不同,其中所含生物大分子的量变化很大,另外与季节性关系密切。对动物组织,必须选择有效成份含量丰富的脏器组织为原材料
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问
MTT实验时怎样避免血清干扰的问题?
bamboopiggy
血清不会影响mtt的结果啊,因为你加完mtt以后,要吸出,然后加dmso溶解甲臢,不存在血清影响的问题。如果你用cck8也没事,会对cck8造成影响的是氧化剂,不是血清。
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问
怎样有效减少His标签蛋白纯化效果不理想的问题?
迟C迟
1、His标签在中性或碱性条件(pH7~8)下,与Ni2+有更强的结合力,与Tris-HCl缓冲液相比,在磷酸缓冲液中His标签表现出与Ni2+更强的结合力。2、HisTrap HP和HisTrap FF的蛋白结合载量都是至少40mg (His) 6重组蛋白。大家可以根据填料的结合载量选择预装柱和填料的规格。3、如果目标蛋白中的咪唑需要去除,可以根据样品体积选择适合的上机脱盐柱(HiTrap De
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问
凝胶过滤层析过程中发现分辨率不高的常见原因有哪些?
府宅
1.加样要尽量快速、均匀。另外加样量对实验结果也可能造成较大的影响,加样过多,会造成洗脱峰的重叠,影响分离效果;加样过少,提纯后各组分量少、浓度较低,实验效率低。加样量的多少要根据具体的实验要求而定:凝胶柱较大,当然加样量就可以较大;样品中各组分分子量差异较大,加样量也可以较大;一般分级分离时加样体积约为凝胶柱床体积的1%-5%左右,而分组分离时加样体积可以较大,一般约为凝胶柱床体积的10%-25
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问
Strep tag(strep标签)有哪些特点?
天一湖医者
1.适合从真核或原核表达体系中纯化strep 标签蛋白2. Strep-Tag II 为8 个氨基酸(W-S-H-P-Q-F-E-K),不会影响标签 蛋白的功能结构。3. Strep-tag 可以和His 标签蛋白联合使用,进行两步纯化获得超高纯度蛋白。
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问
Rt-pcr怎么样提高cDNA 的合成产量?
府宅
1.PCR反应体系的组成,如酶离子的浓度等也会显著影响 ;2.PCR条件,如引物的退火温度选择对提高PCR试验的灵敏度和产量也非常关键;3.如果PCR产量较低的话,你也可以通过二次PCR来提高产量,即把第一次的PCR产物适当稀释,再以它作为模班进行PCR,同时你也可以通过TOUCH-DOWN PCR来提高PCR的特异性和产量。
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问
miRNA相关试验如何开展呢?
dxywode
miRNA已成为研究的大热门,也是近年来国自然申请标书中的香饽饽。关于miRNA的研究,基本脱离不了以下几步:1、初步小样本测序或者芯片或者panel,这个筛选,当然,一般还会伴随mRNA的差异筛选 2、大样本PCR验证 3、功能研究(细胞和动物模型)
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