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        ChIP实验中最关键的结果是什么?什么样的富集倍数被认为是阳性的结果?

        相关实验:芯片技术

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        迟C迟

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        1 个回答

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        有帮助

        染色质免疫共沉淀(ChIP)实验本身其实就是一个通过免疫沉淀反应验证蛋白与DNA相互作用的实验。因此结果一般包括两个数据:免疫沉淀的效率(富集效率), 蛋白与DNA结合能力(富集倍数)。但是这两个结果本身都是一个相对值,因为富集效率就是断裂后的染色质分成两部分,一部分进行免疫沉淀,一部分作为对照不进行免疫沉淀,然后两者进行比较,得到一个百分比。富集倍数就是取两个抗体进行免疫沉淀,一个是特异性的抗体,另一个是阴性抗体(和特异性抗体同种属的lgG)验证抗体是否有非特异性的结合,然后将这两个抗体获得的DNA进行比较,得到一个比值。因此无论是富集效率还是富集倍数其实都只是一个相对的结果,没有特定的数值,富集倍数的高低往往取决于蛋白质靶点的丰度,相对于低丰度的靶点,高丰度靶点有可能产生高的富集。一些实验室将相对于IgG对照的5倍富集设为成功实验的最低阈值。不过,最好将结果与已发表的结果比较,而不是固守设定值。

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