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使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。
蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。若待检测目的蛋白明确,选择Western blot鉴定;若不明确,则可选择质谱鉴定。
实验流程图片:
百致生物现提供RNA pull down检测技术服务, 使用特异性二抗进行检测,能有效避免抗体重链对结果的信号干扰。
服务流程:
客户提供
RNA序列或者RNA序列构建的质粒(种属);
相同种属的细胞样品;
最终交付
1、基因合成测序报告;
2、构建含目的基因的质粒、菌液,测序报告;
3、体外转录模版的sense&antisense引物、模版电泳图;
4、RNA Pull-down蛋白SDS-PAGE银染;
5、质谱鉴定报告;
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文献和实验Genome‐Wide Location Analysis by Pull Down of In Vivo Biotinylated Transcription Factors
provides a detailed protocol for genome?wide location analysis of in vivo biotinylated transcription factors by streptavidin pull?down followed by high?throughput sequencing (bioChIP?seq). Curr. Protoc. Mol. Biol. 92:21.20.1?21.20.15. © 2010 by John Wiley
, however, it is fine to use regular DNA-style TBE agarose gels. In either case, the RNA should initially be denatured (steps 2-3) and RNAse free reagents should be used. Procedure Add 2 µL RNA (up to 20 µg) to 18 µL 1x Reaction Buffer.
Northern protocol(RULES FOR RNA WORK)
1. Wear gloves at all time including filling pipet tip in racks, filling jars with Eppendorf tubes, and weighing chemicals to prepare solutions. 2. Pull weighing paper or weighing boat from middle of pile. Tap chemicals
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