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转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子，也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异顺序结合，这些特异性的序列被称为顺式因子，转录因子的DNA结合域和顺式因子实现相互结合，从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段，其原理简述如下：
1、构建一个将靶启动子的特定片段插入到萤光素酶表达序列前方的报告基因质粒，如pGL3-basic等。
2、将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子，则萤光素酶基因就会表达，萤光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。
3、 加入特定的萤光素酶底物，萤光素酶与底物反应，产生萤光素，通过检测荧光的强度可以测定萤光素酶的活性，从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
客户提供需要研究的转录因子，我们可以提供预测其靶基因的策略以及后续验证服务。
1、构建一个将靶启动子的特定片段插入到萤光素酶表达序列前方的报告基因质粒，如pGL3-basic等。
2、将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子，则萤光素酶基因就会表达，萤光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。
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文献和实验相关实验
1、双荧光素酶实验原理； 2、验证转录因子与启动子互作； 3、验证miRNA与mRNA互作
如何寻找一个基因的启动子并预测转录因子在其上的结合位点是一个不小的工程，原因有二：1. 网络上有海量的寻找启动子的教程，各执一词，常常会让小白不知所措；2. 同理，转录因子的数据库也有很多，而且不少已经鲜有维护，数据陈旧，使用起来很不方便。有没有一个数据库能完美地一次解决这两个问题呢？有的！今天给大家介绍的 LASAGNA-Search 2.0 便是一款十分让你省心的在线分析数据库。一、首先，打开数据库的网址：http://biogrid-lasagna.engr.uconn.edu
基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富，拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了，拿到启动子序列以后，下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢？生物信息学方法预测？你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子，还要做实验一个一个验证。凝胶迁移（EMSA），染色质免疫共沉淀（ChIP）？只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子，而且还需要相应探针/抗体，对于大量筛选无能为力。美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列
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双荧光素酶验证转录因子与启动子结合位点
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