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PRM/MRM 靶标定量技术
应用领域:
1.可应用于蛋白质/多肽标志物验证、蛋白质翻译后修饰的定性定量研究和蛋白质/多肽药代动力学、临床诊断、违禁药物检查、食品化妆品等工业质量控制、环境检测、农业植物学研究。
技术优点:
1.PRM/MRM技术是目前所有质谱检测方式中灵敏度、重现性和准确度最高的定量技术,定量范围可达到5个数量级,定量重现性CV<10%, 相对误差<15%。
2.与经典的Westernblot、ELISA 技术相比,不需要使用抗体,获得更为准确和重现的定量验证结果。
3.在一个小时检测时间内可同时实现50个蛋白质的定量检测。
4.PRM可直接检测二级所有离子,减少了子离子的挑选和优化过程。
可选仪器:
0QTRAP5500, QE, QE-Plus, QE-HF, Fusion, Lumos
分析流程:
样品经胰酶酶切后,在质谱检测
窗口中设置靶向检测列表,采用
PRM/MRM方法进行质谱数据采集。
定量数据采用Skyline软件处理。
样品要求:
蛋白提取物:≥50μg
细胞:≥106
组织:动物组织≥1 mg,植物组织≥10 mg
体液:血清≥5μL,脑脊液≥10μL
参考文献:
1 Kim HJ, Lin, Lee HJ, Li M, Liebler DC. Quantitative profiling of protein tyrosine kinases in human cancer cell lines by multiplexed parallel reaction monitoring assays. Mol Cell Proteomics. 2015 Dec 2. pii: mcp.O115.056713.
2 Majovsky P, Naumann C, Lee CW, Lassowskat , Trujillo M, Dissmeyer N, Hoehenwarter W. Targeted proteomics analysis of protein degradation in plant signaling on an LTQ-Orbitrap mass spectrometer. J Proteome Res. 2014 Oct 3;13(10):4246-58.
3 Zhao Y, Jia W, Wang J, Ying W, Zhang Y, Qian X. Fragmentation and site-specific quantification of core fucosylated glycoprotein by multiple reaction monitoring-mass spectrometry. Anal Chem. 2011 Nov 15;83(22):8802-9.
4赵焱,应万涛,钱小红等. 质谱MRM技术在蛋白质组学研究中的应用. 生命的化学. 2008, 28(2):210-213
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文献和实验蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。 平行反应监测PRM相对定量技术的优势 相比于传统SRM/MRM只检测目标离子对的模式, 平行反应监测PRM相对定量技术将采集二级信息所用的四级杆质量分析器替换为更高分辨、更高质量精度的分析器,实现了从目标离子对检测到全部目标离子碎片检测的转化。因此,平行反应监测PRM相对定量技术不仅具有SRM/MRM的靶向定量分析能力,还同时具备了定性能力。 1. 质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏
共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白组学分析、SILAC/Dimethyl标记定量蛋白组分析、SWATH定量蛋白组学、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白组学分析。下面介绍两种比较常见的定量蛋白质组学技术。 iTRAQ定量蛋白质组学分析 iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation) 技术是由美国应用生物系统公司ABI研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用4种或8种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,而后进
,更多保留样本最原始信息; c.对于低丰度多肽的覆盖程度更高; d.不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。 标记定量与非标记定量技术的比较 百泰派克生物提供基于质谱的蛋白质定量服务,包括iTRAQ/TMT, Label-Free, SILAC, MRM/PRM及SWATH定量蛋白组学服务,欢迎垂询!
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