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上海中科新生命生物科技有限公司
- 服务名称:
标准PRM和PRM-plus
· 产品定义
PRM(平行反应监测, parallel reaction monitoring)是一种基于LC-MS/MS的靶向蛋白质分析技术,能够对目标蛋白、目标肽段(包括发生翻译后修饰的肽段)进行高选择性、高特异性、高重复性和高准确性检测,从而实现对目标蛋白/肽段的相对或绝对定量分析。
PRM技术分析原理
· 技术路线
· 技术优势
1. 适用性广:无物种限制;通量高:可一次性检测多达100个目标蛋白质,节省样本集实验成本;
2. 定量能力强:灵敏度可达ppm级别,线性范围可达5-6个数量级;特异性高:可精细区分亚型、修饰位点
3. 突变位点等精细序列差异;克服标记定量技术在样本数量的上限制,灵活方便。
· 数据分析
· 推荐组合产品
蛋白组+PRM/PRM plus
· 推荐应用领域
1. 蛋白质组结果验证
2. 对目标蛋白质/肽段进行相对或者绝对定量检测
3. 疾病标志物靶向检测
4. 靶向药物的开发
5. 生物通路特定信号研究
· 送样建议(特殊样本可)
· 参考文献
1. KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. (IF 16.016) 【客户文献】
利用蛋白质组学和PRM探索了三甲基氯化锡(TMT)引起神经毒性的分子机制
2. Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.
TMT蛋白质组+PRM靶向验证-人脑组织+脑脊液-通过对大规模群体进行蛋白质组学检测,并采用WGCNA分析挖掘AD关键蛋白模块(包括能量代谢),揭示能量代谢紊乱对阿尔茨海默病早期功能障碍的重要影响
3.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.
蛋白质组学+PRM靶向蛋白组学-人血浆-通过“筛选-验证”的思路,挖掘了大量HBV-ACLF相关候选标志物,开发了慢加急性肝衰竭ACLF临床治疗中诊断及预后血浆蛋白标志物组合的研究
4.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.
PRM靶向蛋白组学-斑马鱼胰腺\肝脏-确定了RABL3突变作为癌症家族基因检测的靶点,并揭示了在发育和癌症中RAS活性失调的机制
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文献和实验1. KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. (IF 16.016) 【客户文献】
利用蛋白质组学和PRM探索了三甲基氯化锡(TMT)引起神经毒性的分子机制
2. Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.
TMT蛋白质组+PRM靶向验证-人脑组织+脑脊液-通过对大规模群体进行蛋白质组学检测,并采用WGCNA分析挖掘AD关键蛋白模块(包括能量代谢),揭示能量代谢紊乱对阿尔茨海默病早期功能障碍的重要影响
3.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.
蛋白质组学+PRM靶向蛋白组学-人血浆-通过“筛选-验证”的思路,挖掘了大量HBV-ACLF相关候选标志物,开发了慢加急性肝衰竭ACLF临床治疗中诊断及预后血浆蛋白标志物组合的研究
4.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.
PRM靶向蛋白组学-斑马鱼胰腺\肝脏-确定了RABL3突变作为癌症家族基因检测的靶点,并揭示了在发育和癌症中RAS活性失调的机制
平行反应监测( Parallel Reaction Monitor-ing, PRM)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。PRM技术首先利用四级杆质量分析器(如Orbitrap系列)的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子;随后在collision cell中对母离子进行碎裂;最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。可对复杂样本中的目标
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
冷冻 23 年的睾丸组织,仍能产生有活力的精子!新研究为这些患者带来福音……
表达变化相似。长期冷冻的样品在未分化的精子中显示出增强的干细胞信号传导,并且圆形精子细胞较少。对长期冷冻和短期冷冻的 DEGs 进行细胞类型特异性通路分析显示,SSC 群体中最显著的变化包括经典的 SSC 自我更新通路,如 GDNF 家族配体受体相互作用、MAPK 信号通路和癌症信号通路上调。 在不同处理组中,两个表达差异最显著的基因是 Prm1 和 Tnp1。这些基因在圆形精子细胞中表现出高度显著的差异,Prm1 在新鲜移植和短冷冻中分别比移植长冷冻高 2.0 倍和 2.3 倍。同样,Tnp
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