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μCaler® Total Solution for SAR

S-CoV-2
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  • 中国南京
  • 2026年01月09日
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      1

    • 英文名

      μCaler® Total Solution for SARS-CoV-2

    • 供应商

      纳昂达(南京)

    • 保存条件

      -20℃

    μCaler® Hybrid Capture Reagents 是专为小 Panel 的靶向富集而优化设计,搭配 μCaler® NanoBlockers 及基于创新型方案设计的 μCaler® Panel 构成完整的液相杂交捕获体系,能够在单日内完成捕获文库构建的全流程。
    μCaler® SARS-Cov-2 Panel 是依赖于 μCaler® 探针设计方案基于 Wuhan-Hu-1/2019 (MN908947) 参考基因组设计,覆盖全部 29.9 Kb 基因组区域,可用于对新冠毒株的精准分型、变异追踪以及新毒株的鉴别。

    方案流程

    workflow

     

    方案特色

    ● 简化流程,操作更便捷

    ● 颠覆式创新型快速杂交捕获方案,单日内完成捕获文库构建的全流程

    ● 小 Panel 具有稳定出色的捕获表现

     

    方案表现

     

    细胞传代毒株的捕获表现和全基因组覆盖度

    图1

     

    图 1. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对细胞传代新冠变异毒株 (Omicron BA.1.1) 的捕获表现及病毒全基因组的覆盖度。RNA 样本利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库, 并以 μCaler® SARS-CoV-2 Panel 搭配 μCaler® Hybrid Capture Reagents 和 μCaler® NanoBlockers (forIllumina®) 组成完整的杂交捕获方案,测序模式:MiniSeq SE 100,测序数据以 IRMA 分析。A. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对细胞系新冠变异毒株的基础捕获表现;B. 新冠病毒全基因组覆盖度。

     

    口咽拭子样本的捕获表现和全基因组覆盖度
    图2

     

    图 2. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对口咽拭子样本的捕获表现及病毒全基因组的覆盖度。RNA 样本利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库, 并以 μCaler® SARS-CoV-2 Panel 搭配 μCaler® Hybrid Capture Reagents 和 μCaler® NanoBlockers (for Illumina®) 组成完整的杂交捕获方案,测序模式:MiniSeqPE 150,测序数据以 IRMA 分析。A. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对口咽拭子样本的基础捕获表现;B. 新冠病毒全基因组覆盖度。

     

    SARS-CoV-2 基因分型和变异图谱分析
    图3

     

    图 3. μCaler® SARS-CoV-2 Panel 对口咽拭子采集的新冠病毒样本的基因分型和变异图谱分析。使用 IRMA 软件对新冠病毒全基因组序列进行组装,利用 Nextclade 在 线分析,以 Wuhan-Hu-1/2019 (MN908947) 为参考基因组进行比对,对毒株进行分型和变异图谱分析。A. 核苷酸序列变异图谱;B. S 蛋白氨基酸变异图谱。

    仅限研究使用,不用于临床诊断。

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    图标文献和实验
    相关实验
    • TransWell Chemotaxis

      in 37°C equilibrated C-Buffer at a concentration of 1 X 106 cells / 100 μl (see Hint #5 ). 7. Return the Transwell® filter inserts from Step #2 to the wells containing the chemoattractant dilutions. Add 100 μl of the cell suspension

    • in vivo RNAi Protocols

      . no.Q33140) or run on agarose E-gels.   After quantification, use 750 ng of total RNA for first strand synthesis using Superscript® III RT kit and QPCR analysis performed using  SYBR® GreenER™ qPCR Super Mix

    • Isolation of micro-RNA (miRNA)

      Tris-HCl (pH 7.5), or TE buffer. Note If the DEPC-treated water has a pH 2. If using a 500-μl cuvette, place 5 μl of the RNA solution into 495 μl of the diluent. Place a piece of Parafilm® over the top of the cuvette and mix the sample

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