μCaler® EMS Panel v1.0

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  • #1101501(16rxn) #1101502(96rxn)
  • 中国南京
  • 2025年12月29日
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    • 英文名

      μCaler® EMS Panel v1.0

    • 供应商

      纳昂达(南京)

    • 保存条件

      -20℃

     

    μCaler® EMS Panel v1.0 (Early Methylation for Screening) 精选了经 NMPA 和 FDA 批准的位点,同时囊括了文献和专利报道中具有重要意义的位点,共计 2097 个 CpG 位点。覆盖 9 大高发癌种,包括肺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌、乳腺癌、膀胱癌、前列腺癌、宫颈癌、卵巢癌,涉及 76 个与致癌和肿瘤抑制相关的甲基化候选基因。探针设计涵盖基因组约 20 Kb 区域,为全面且精准的甲基化早筛提供支持。

     

    基因列表

     

    癌种 Biomarker
    肺癌 (Lung Cancer) SCT、HOXA7、RASSF1、SHOX2、PTGER4
    结直肠癌 (Colorectal Carcinoma) NDRG4、BCAT1、Septin9、BMP3、TFPI2、SDC2、SFRP2
    胃癌 (Gastric Cancer) Septin9、RNF180、TCF4、RPRM、SDC2、TERT
    肝癌 (Liver Cancer) SCN4B、BDH1、HOXA10、PLAC8、BMPR1A、TEPP、SPACA6、MIXL1、TSC22D1
    乳腺癌 (Breast Cancer) CDO1、PITX2、GSTP1、GP5、APC
    膀胱癌 (Carcinoma Cancer) SOX1、GALR1、DMRTA2、EVX2、SOX17、DCHS2、TWIST1、TBX5、HOXA11、SIM2、LHX2
    前列腺癌 (Prostatic Cancer) CCND2、CDH1、MCAM、PENK、PITX2、PTGS2、RARB、LINC02028、SLCO3A1、HES5、TPM4、FHAD1、SOX1-OT、IGFBP3、ZNF154、FEZF2、APC
    宫颈癌 (Cervical Cancer) SOX1、PAX1、JAM3、TAFA4、ASTN1、DLX1、ITGA4、RXFP3、SOX17
    卵巢癌 (Ovarian Cancer) PCDHB18P、CDO1、HOXA9、LYPD5、CDH13、FOXD3、ZNF671、HOXA11、FBXO32、OPCML、BLACAT1、LRRC41、GNE、FAIM2、CAPN2、SIM2

     

    产品特色

    • 多癌种检测:一次性覆盖 9 大癌种多基因的 CpG 位点。
    • 多样本兼容性:适用于 gDNA、cfDNA 和不同等级的 FFPE 样本。
    • 精准定量甲基化水平:实现对肿瘤及癌旁组织甲基化水平的准确定量。
    • 高效捕获技术:结合 μCaler® Total Solution for Methylation,确保数据质量均一,捕获效率和稳定性更高。
    • 可靠性高:采用独家专利型探针设计,全面检测甲基化状态,提供可靠的结果。
    • 稳定交付周期:自有核酸工厂,现货交付,保障交货周期的稳定性。
    • 灵活定制:针对特定单一/多癌种,支持定制包含不同基因及不同规模 CpG 位点的 Panel 单独使用或者 Spike-in。

     

     

    产品表现

    兼容不同样本类型

    fig1

    图 1. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于 gDNA 及 cfDNA 样本时的捕获表现。A. gDNA 样本;B. cfDNA 样本;C. Fold 80 base penalty;D. gDNA 样本靶区域 CpG total depth (去重后)。使用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 分别对样本进行预文库构建,gDNA 使用 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module (BS) 进行甲基化文库转化,cfDNA 分别使用 BS 和酶学 (EM) 两种方式进行甲基化文库转化,500 ng/预文库投入,以 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler® EMS Panel v1.0 完成杂交捕获。
    注:gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471),投入量 50 ng;cfDNA 样本为血浆 cfDNA,投入量 20 ng。

    fig1

    图 2. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于不同等级 FFPE 样本时的捕获表现。A. 捕获表现;B. Fold 80 base penalty。使用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 分别对样本进行预文库构建,衔接 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 进行甲基化文库转化,500 ng/预文库投入,以 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler® EMS Panel v1.0 完成杂交捕获。
    注:FFPE 为临床肺癌样本,投入量 50 ng。样本分级标准:FFPE B:15 Kb 左右有主带,但存在中度弥散;FFPE C:条带主要分布在 200-2500 bp,呈弥散状;FFPE D:条带主要分布在 100-1000 bp,呈弥散状。

    临床样本检测表现

    结直肠癌

    图1A
    图1B
    图1C
    图 3. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的捕获表现。A. 中靶率 & 比对率;B. CpG 覆盖度;C. Fold 80 base penalty。
    注:CRC: Colorectal Cancer。
    fig1

    图 4. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 结直肠癌配对样本 CpG 甲基化水平;B. 结直肠癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
    注:CRC: Colorectal Cancer;Pt: Peritumoral tissue。

    卵巢癌

    fig1

    图 5. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于临床卵巢癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 卵巢癌配对样本 CpG 甲基化水平;B. 卵巢癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
    注: OVCA: Ovarian Cancer;Pt: Peritumoral tissue 。

    肺癌

    图1A
    图1B
    图1C
    图 6. μCaler® EMS Panel v1.0 应用于临床肺癌组织时的甲基化水平检出情况。A. 肺癌样本 CpG 甲基化水平;B. 肺癌样本 CpG 深度; C. 肺癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
    注:LC: Lung Cancer。

    本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。

    产品 货号
    μCaler® EMS+ Panel v1.0, 16 rxn 1101501
    μCaler®  EMS+ Panel v1.0, 96 rxn 1101502


    本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。

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