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μCaler® Total Solution for Met

hylation
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  • #1105201 (16 rxn)/#1105202(96 rxn)
  • 中国南京
  • 2025年12月29日
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    • 英文名

      μCaler® Total Solution for Methylation

    • 供应商

      纳昂达(南京)

    • 保存条件

      -20℃

    μCaler® 靶向甲基化测序全流程解决方案,搭载独家专利的 μCaler® 液相杂交捕获系统,可在单日内完成全部流程,操作简单便捷。该解决方案捕获转化后的甲基化文库,采用专利型探针设计方案,可覆盖所有甲基化状态的靶标;此外,针对甲基化优化的杂交捕获体系,不仅适配于 mini Panel 的靶向富集,更适用于 AT-rich 等特殊区域的捕获。

    μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 是针对小 Panel 的靶向富集及多种类型的预文库的杂交捕获而优化设计,搭配 μCaler® NanoBlockers 及基于创新型方案设计的 μCaler® Panel 构成完整的液相杂交捕获体系,能够在单日内完成捕获文库构建的全流程。

    方案推荐

    方案流程

     

     

    方案特色

    • 精准检测大规模 CpG 位点:一次性检测多种癌症的多个基因的 CpG 位点,实现精准联合检测
    • 精确定量甲基化水平:
    高精度覆盖 0-100% 不同甲基化状态样本的精准定量
    • 高速便捷操作:
    实验流程简化,操作便捷,单日内完成全部流程
    • 稳定高效捕获:
    避免数据量不一致,确保捕获测序结果的稳定性,降低返工风险
    • 更低测序成本:
    采用混杂模式,简化杂交捕获数量,降低测序成本,提升经济效益

     

    方案表现

    精准检测大规模 CpG 位点

    图1

    图 1. 含不同规模 CpG 位点的定制 Panel 的 μCaler® 靶向甲基化测序表现人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 和 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 构建预文库,以 μCaler® Methyl Cervical Cancer Panel (MCC) 和 μCaler® Methyl Multiple Cancer Panel (MMC) 完成杂交捕获,Illumina® Novaseq 6000,PE 150 测序,每个样本随机选取 1 Mb reads pair 用于数据分析。A. MCC 捕获表现;B. MCC CpG 位点的覆盖深度;C. MMC 捕获表现;D. MMC CpG 位点的覆盖深度。

    注:MCC 覆盖区域约 1.4 Kb,包含 125 个 CpG 位点; MMC 覆盖区域约 3.6 Kb,包含 336 个 CpG 位点。

    精确定量甲基化水平

    图2 A
    图2 B
    图2 C
    图2 D
    图2 E
    图 2. 模拟样本经不同方法检测的甲基化水平利用 50 ng 不同甲基化水平的模拟样本构建预文库,500 ng/预文库投入,以 MMC 完成杂交捕获。A-E. 分别为 0%,2%,10%,50% 和 100% 不同甲基化水平模拟样本的检测结果。
    注:样本为人甲基化阳性对照 (Methylated DNA, Zymo, D5014-2) 与阴性对照 (Non-Methylated DNA, Zymo, D5014-1),按不同比例混合以模拟不同甲基化水平。μCaler:μCaler® 靶向甲基化测序; Pyro:焦磷酸测序。

    高速便捷操作

    流程图

    稳定高效捕获

    图3

    图 3. μCaler® 靶向甲基化测序对小 Panel 的捕获表现。 利用人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 构建预文库,500 ng/预文库投入,分别以 MBT、MMC 和 MPC 完成杂交捕获。A. 捕获数据的比对率和中靶率;B. 靶区域 CpG 位点覆盖度;C. C 碱基的转化率;D. CpG 位点的甲基化水平。

    注:MBT 覆盖区域约 1.2 Kb,包含 159 个 CpG 位点;MPC 覆盖区域约 6.2 Kb,包含 620 个 CpG 位点。

    更低测序成本

    图4

    图 4. 不同混合杂交方式下的 μCaler® 靶向甲基化测序的捕获表现利用人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 构建预文库,500 ng/预文库投入,以 MCC 完成杂交捕获。A. 靶区域 CpG 位点覆盖度;B. CpG 位点的甲基化水平。

    真实样本应用示例

    图5-A
    图5-B
    图5-C
    图 5. 不同技术路线对临床真实样本的检测结果比较。 A. 高甲基化水平样本 (Tumor) 的检测结果;B. 低甲基化水平样本 (Normal) 的检测结果;C. 7 号染色体 (Chr 7) 相关 CpG 位点甲基化水平。
    注:μCaler® 靶向甲基化测序以 MBT 完成杂交捕获。

    本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。

    类别 产品 详情 货号
    甲基化建库模块 NadPrep® Methyl Library Preparation Module, 24 rxn 24 rxn 1002501
    NadPrep® Methyl Library Preparation Module, 96 rxn 96 rxn 1002502
    BS 转化模块 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 24 rxn 24 rxn 1002701
    NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 96 rxn 96 rxn 1002702
    甲基化截短型双端唯一 接头模块 NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set A1 (with 10 nt Index), 24 rxn UDI 1-12 1003371
    NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set B1 (with 10 nt Index), 96 rxn UDI 1-24 1003381
    NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set B2 (with 10 nt Index), 96 rxn UDI 25-48 1003382
    封阻序列 μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 16 rxn 16 rxn 1106102
    μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 96 rxn 96 rxn 1106101
    杂交试剂 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 16 rxn 16 rxn 1105202
    μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 96 rxn 96 rxn 1105201

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