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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
1
- 英文名:
μCaler® Total Solution for Methylation
- 供应商:
纳昂达(南京)
- 保存条件:
-20℃
μCaler® 靶向甲基化测序全流程解决方案,搭载独家专利的 μCaler® 液相杂交捕获系统,可在单日内完成全部流程,操作简单便捷。该解决方案捕获转化后的甲基化文库,采用专利型探针设计方案,可覆盖所有甲基化状态的靶标;此外,针对甲基化优化的杂交捕获体系,不仅适配于 mini Panel 的靶向富集,更适用于 AT-rich 等特殊区域的捕获。
μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 是针对小 Panel 的靶向富集及多种类型的预文库的杂交捕获而优化设计,搭配 μCaler® NanoBlockers 及基于创新型方案设计的 μCaler® Panel 构成完整的液相杂交捕获体系,能够在单日内完成捕获文库构建的全流程。
方案推荐

方案特色
• 精准检测大规模 CpG 位点:一次性检测多种癌症的多个基因的 CpG 位点,实现精准联合检测
• 精确定量甲基化水平:高精度覆盖 0-100% 不同甲基化状态样本的精准定量
• 高速便捷操作:实验流程简化,操作便捷,单日内完成全部流程
• 稳定高效捕获:避免数据量不一致,确保捕获测序结果的稳定性,降低返工风险
• 更低测序成本:采用混杂模式,简化杂交捕获数量,降低测序成本,提升经济效益
方案表现
精准检测大规模 CpG 位点

图 1. 含不同规模 CpG 位点的定制 Panel 的 μCaler® 靶向甲基化测序表现。人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 和 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 构建预文库,以 μCaler® Methyl Cervical Cancer Panel (MCC) 和 μCaler® Methyl Multiple Cancer Panel (MMC) 完成杂交捕获,Illumina® Novaseq 6000,PE 150 测序,每个样本随机选取 1 Mb reads pair 用于数据分析。A. MCC 捕获表现;B. MCC CpG 位点的覆盖深度;C. MMC 捕获表现;D. MMC CpG 位点的覆盖深度。
注:MCC 覆盖区域约 1.4 Kb,包含 125 个 CpG 位点; MMC 覆盖区域约 3.6 Kb,包含 336 个 CpG 位点。
精确定量甲基化水平





注:样本为人甲基化阳性对照 (Methylated DNA, Zymo, D5014-2) 与阴性对照 (Non-Methylated DNA, Zymo, D5014-1),按不同比例混合以模拟不同甲基化水平。μCaler:μCaler® 靶向甲基化测序; Pyro:焦磷酸测序。
高速便捷操作

稳定高效捕获

图 3. μCaler® 靶向甲基化测序对小 Panel 的捕获表现。 利用人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 构建预文库,500 ng/预文库投入,分别以 MBT、MMC 和 MPC 完成杂交捕获。A. 捕获数据的比对率和中靶率;B. 靶区域 CpG 位点覆盖度;C. C 碱基的转化率;D. CpG 位点的甲基化水平。
注:MBT 覆盖区域约 1.2 Kb,包含 159 个 CpG 位点;MPC 覆盖区域约 6.2 Kb,包含 620 个 CpG 位点。更低测序成本

图 4. 不同混合杂交方式下的 μCaler® 靶向甲基化测序的捕获表现。利用人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 构建预文库,500 ng/预文库投入,以 MCC 完成杂交捕获。A. 靶区域 CpG 位点覆盖度;B. CpG 位点的甲基化水平。
真实样本应用示例



注:μCaler® 靶向甲基化测序以 MBT 完成杂交捕获。
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
| 甲基化建库模块 | NadPrep® Methyl Library Preparation Module, 24 rxn | 24 rxn | 1002501 |
| NadPrep® Methyl Library Preparation Module, 96 rxn | 96 rxn | 1002502 | |
| BS 转化模块 | NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 24 rxn | 24 rxn | 1002701 |
| NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 96 rxn | 96 rxn | 1002702 | |
| 甲基化截短型双端唯一 接头模块 | NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set A1 (with 10 nt Index), 24 rxn | UDI 1-12 | 1003371 |
| NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set B1 (with 10 nt Index), 96 rxn | UDI 1-24 | 1003381 | |
| NadPrep® Methyl Stubby Adpater (UDI) Module Set B2 (with 10 nt Index), 96 rxn | UDI 25-48 | 1003382 | |
| 封阻序列 | μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 16 rxn | 16 rxn | 1106102 |
| μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 96 rxn | 96 rxn | 1106101 | |
| 杂交试剂 | μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 16 rxn | 16 rxn | 1105202 |
| μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 96 rxn | 96 rxn | 1105201 |
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文献和实验Typical modification sites: RGG box or RXR sequence motifs R-arginine, G-glycine, X-any aminoacid. Enzymes catalysing protein arginine methylation: PRMT1 from rat and the human homologue HRMT1L2, human PRMT2 (HRMT1L1), rat and human PRMT
Typical modification sites: RGG box or RXR sequence motifs R-arginine, G-glycine, X-any aminoacid. Enzymes catalysing protein arginine methylation: PRMT1 from rat and the human homologue HRMT1L2, human PRMT2 (HRMT1L1), rat and human PRMT
Bisulfite Modification for Analysis of DNA Methylation
an important role in the control of gene function. This procedure, called bisulfite genomic sequencing, is a principal method for the analysis of DNA methylation in various biological phenomena, including human diseases such as cancer. This unit describes










