验证CCL3/4和Mφ积聚在Thy-1N中的表达
检测CCL3/4产生和Mφ积聚在Thy-1N体内和体外的变化。
通过qPCR、ELISA检测CCL3/4 mRNA和蛋白水平(Thy-1N大鼠肾组织和亚裂解性C5b-9刺激的GMCs),以及CD68免疫组化染色评估肾组织中Mφ数量。
Sublytic C5b-9 Induces CCL3/4 Production and Macrophage Accumulation in Thy-1N Rats via PKC-α/p65/IRF-8 Axis.
包含体内Thy-1N大鼠模型、体外GMC和Mφ细胞实验、患者肾组织样本,并涵盖功能验证、机制验证(启动子、ChIP)和体内基因敲低验证。
Thy-1N大鼠模型 大鼠肾小球系膜细胞(GMCs,HBZY-1) 大鼠肺泡巨噬细胞系(NR8383) MsPGN患者肾组织样本
Thy-1N诱导:大鼠单次静脉注射Thy-1抗体(0.75ml/100g) 亚裂解性C5b-9刺激:GMCs与5% Thy-1抗体和4% NHS共孵育 体内敲低:LV-shRNA经肾动脉注射,4天后诱导肾炎,n=5/组 关键检测指标:CCL3/4表达、CD68阳性Mφ数、肾小球细胞数、蛋白尿 统计方法:t检验或单因素方差分析,p<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测CCL3/4产生和Mφ积聚在Thy-1N体内和体外的变化。
通过qPCR、ELISA检测CCL3/4 mRNA和蛋白水平(Thy-1N大鼠肾组织和亚裂解性C5b-9刺激的GMCs),以及CD68免疫组化染色评估肾组织中Mφ数量。
确定IRF-8是否在上调CCL3/4表达中起关键作用。
在GMCs中过表达或敲低IRF-8,检测CCL3/4表达水平;同时通过荧光素酶报告实验和ChIP验证IRF-8与CCL3启动子的结合。
探究PKC-α和p65的活化是否调节IRF-8表达及CCL3/4产生。
使用PKC-α和p65的抑制剂、过表达(WT、活性突变体、失活突变体)和敲低实验,检测IRF-8表达和信号通路磷酸化水平。
验证降低PKC-α、p65、IRF-8或CCL3/4表达是否能减轻Thy-1N的病理变化。
通过肾动脉灌注LV-shRNA敲低肾脏基因,诱导Thy-1N,检测CCL3/4、Mφ积聚、GMC增殖和蛋白尿的变化。
检测人MsPGN肾组织中PKC-α/p65/IRF-8/CCL3/4表达和Mφ积聚。
对MsPGN患者(n=20)和对照(n=22)肾组织进行免疫组化染色,定量分析p-PKC-α、p-p65、IRF-8、CCL3/4和CD68的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗t-ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 |
| 抗p-ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗t-p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| 抗p-p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 4511 | |
| 抗t-JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9258 | |
| 抗p-JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| 抗t-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗p-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗t-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 抗p-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| HRP标记的抗兔IgG(轻链特异性) | Cell Signaling Technology | 93702 | |
| 抗t-PKC-α抗体 | Abcam | ab32376 | |
| 抗p-PKC-α抗体 | Abcam | ab32502 | |
| IHC | 抗CD68抗体 | Abcam | ab31630 |
| 抗CD68抗体 | Abcam | ab955 | |
| IHC/ELISA | 抗CCL3抗体 | Abclone | A7568 |
| 抗CCL4抗体 | Abclone | A1671 | |
| Western blot | 抗CCR1抗体 | Abclone | A18341 |
| 抗CCR5抗体 | Abclone | A20261 | |
| 抗IRF-8抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365042 | |
| IHC | 抗p-p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-136548 |
| Western blot | 抗β-actin抗体 | Bioworld Technology | BS6007M |
| HRP标记的抗兔IgG | Bioworld Technology | BS13278 | |
| HRP标记的抗鼠IgG | Bioworld Technology | BS12478 | |
| 细胞处理 | CCL3中和抗体 | R&D Systems | MAB66252 |
| CCL4中和抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA1-29036 | |
| 抗体标记 | 生物素偶联试剂盒 | Abcam | ab201795 |
| 链霉亲和素-HRP | Abcam | ab7403 | |
| ChIP | EZ-ChIP染色质免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 信号通路抑制 | U0126(ERK1/2抑制剂) | MedChemExpress | -- |
| SB203580(p38 MAPK抑制剂) | MedChemExpress | -- | |
| SP600125(JNK抑制剂) | MedChemExpress | -- | |
| 双吲哚马来酰亚胺I(PKC-α抑制剂) | MedChemExpress | -- | |
| BAY 11-7082(NF-κB-p65抑制剂) | MedChemExpress | -- | |
| Stattic(STAT3抑制剂) | MedChemExpress | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | -- |
| Thy-1N诱导 | Thy-1抗体 | 文中未明确说明 | -- |
| 补体来源 | 正常人血清 | -- | -- |
| 热灭活人血清 | -- | -- | |
| 人C6缺陷血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 补体C6 | Sino Biological Inc. | -- | |
| 细胞培养 | MEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| TRIzol试剂 | -- | -- | |
| RT-PCR | Hifair® Ⅱ第一链cDNA合成试剂盒 | Yeasen | -- |
| HiScript逆转录酶 | Vazyme | -- | |
| HiScript II Q RT SuperMix | Vazyme | -- | |
| PCR | 2×Taq预混液 | Vazyme | -- |
| qPCR | AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | -- |
| Hieff® qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | -- | |
| ABI StepOnePlus实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | CCL3 ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| CCL4 ELISA试剂盒 | Elabscience | -- | |
| 质粒构建 | pIRES2-EGFP载体 | Clontech | -- |
| T4 DNA连接酶 | -- | -- | |
| General Biosystems(质粒构建服务) | General Biosystems | -- | |
| shRNA质粒构建 | pGPU6-GFP载体 | GenePharma | -- |
| 细胞转染 | Invitrogen Neon™转染系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫印迹检测 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| ECL检测系统 | -- | -- | |
| GE Amersham Imager 600成像仪 | GE Healthcare | -- | |
| Transwell实验 | Transwell上室 | Corning | -- |
| IHC | 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- |
| DAB底物 | -- | -- | |
| 体内基因敲低 | 慢病毒shPKC-α | GenePharma | -- |
| 慢病毒shp65 | GenePharma | -- | |
| 慢病毒shIRF-8 | GenePharma | -- | |
| 慢病毒shCCL3 | GenePharma | -- | |
| 慢病毒shCCL4 | GenePharma | -- | |
| 慢病毒对照shRNA | GenePharma | -- | |
| 动物实验 | 雄性SD大鼠 | 南京医科大学动物核心设施 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Thy-1N大鼠模型诱导 | 大鼠体重、Thy-1抗体剂量、注射途径、对照组处理、取材时间点 阅读提示:Materials and Methods - Thy-1N induction |
| 亚裂解性C5b-9刺激 | Thy-1抗体浓度、NHS浓度、处理时间、分组对照(HIS、C6DS、C6补充) 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture and sublytic C5b-9 stimulation |
| 细胞培养与处理 | GMC培养条件(MEM+10% FBS)、Mφ培养条件(DMEM+10% FBS)、转染条件 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture and sublytic C5b-9 stimulation 和 Cellular transfection |
| 基因敲低与过表达 | shRNA序列、质粒名称(pIRES2、pGPU6)、转染细胞类型、观察时间 阅读提示:Materials and Methods - shRNA plasmid construction 和 Cellular transfection |
| 机制实验 | 启动子片段、突变位点、ChIP抗体、检测区域 阅读提示:Materials and Methods - Luciferase reporter assay 和 Chromatin immunoprecipitation (ChIP) |
| 体内基因敲低 | LV-shRNA注射途径、注射时间(诱导前4天)、分组设计、样本量(n=5/组/时间点) 阅读提示:Materials and Methods - Lentiviral (LV) shRNA packing and in vivo experiments |
| 病理检测 | 肾组织切片厚度、染色方法(H&E、IHC、EM)、计数方法 阅读提示:Materials and Methods - Proliferative change examination 和 Immunohistochemistry (IHC) staining |
| 统计方法 | 数据表示(均数±标准误)、统计检验(t检验、单因素方差分析)、显著性水平p<0.05 阅读提示:Materials and Methods - Statistical analysis |