筛选协同药物
鉴定与STING激动剂diABZI协同杀伤胰腺癌细胞的药物。
在CFPAC-1细胞中,使用430种激酶抑制剂与1 μmol/L diABZI联合处理72小时,通过CellTiter-Glo评估细胞活力,计算Bliss协同分数。
MEK Inhibition Sensitizes Pancreatic Cancer to STING Agonism by Tumor Cell-intrinsic Amplification of Type I IFN Signaling
包含体外细胞系筛选、CRISPR敲除、体内异种移植模型、患者来源异种移植模型及机制验证,证据层级多样。
CFPAC-1细胞系 SUIT2细胞系 CFPAC-1异种移植瘤模型 患者来源异种移植瘤(XWR7)
STING表达水平与协同细胞毒性相关 IFNAR1敲除消除协同细胞毒性 NFκB活性对协同效应至关重要 IRF1表达是NFκB与IFN产生之间的机制桥梁
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与STING激动剂diABZI协同杀伤胰腺癌细胞的药物。
在CFPAC-1细胞中,使用430种激酶抑制剂与1 μmol/L diABZI联合处理72小时,通过CellTiter-Glo评估细胞活力,计算Bliss协同分数。
验证MEK抑制剂与STING激动剂在其他胰腺癌细胞系中的协同杀伤作用,并确认STING表达水平对协同效应的影响。
在多个PDAC细胞系(Panc03.27, HPAF-II等)中,使用diABZI和trametinib联合处理,通过CellTiter-Glo测定细胞活力,并检测STING蛋白表达。
验证STING激动剂与MEK抑制剂联合在体内对肿瘤生长的协同抑制作用。
建立CFPAC-1 TetR STINGR284M、CFPAC-1和XWR7患者来源异种移植瘤模型,使用DOX饮食、diABZI和cobimetinib处理,测量肿瘤体积。
探究MEK抑制增强STING激动剂细胞毒性的分子机制。
通过RNA-seq、RT-PCR、ELISA、免疫印迹等方法,分析CFPAC-1细胞在diABZI和trametinib处理后的基因表达变化,包括IFNB1、IL6、TNF等,并检测信号通路蛋白的磷酸化状态。
证明I型IFN信号对协同细胞毒性是必需的。
使用CRISPR/Cas9敲除IFNAR1的CFPAC-1和SUIT2细胞,检测联合处理对细胞增殖和凋亡的影响,并在体内异种移植模型中验证。
确定NFκB在协同效应中的具体作用机制。
使用IKKβ抑制剂TPCA1和TPL2抑制剂处理CFPAC-1细胞,检测IFNB1、IL6、TNF表达和IRF1表达,并通过CRISPR敲除IRF1或IL6R,评估对协同细胞毒性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10-107-CV |
| RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV | |
| 胎牛血清 | Omega Scientific | FB-11 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | ThermoFisher Scientific | L3000001 |
| OptiMEM培养基 | ThermoFisher Scientific | 31985-062 | |
| 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966-1 | |
| 药物处理 | 人IFNβ | PBL Assay Science | 11415-1 |
| 人重组IL-6 | PeproTech | 200-06 | |
| diABZI | Selleckchem | S8796 | |
| 曲美替尼 | Selleckchem | S2673 | |
| 考比替尼 | Selleckchem | S8041 | |
| SCH772984 | Selleckchem | S7101 | |
| SC144 | Selleckchem | S7124 | |
| TPL2抑制剂 | Cayman | 19710 | |
| 托珠单抗 | Selleckchem | A2012 | |
| TPCA1 | Selleckchem | S2824 | |
| Z-VAD-FMK | InvivoGen | tlrl-vad | |
| 多西环素 | Clontech | 631311 | |
| 蛋白提取 | RIPA蛋白裂解液 | Boston BioProducts | BP-115 |
| Laemmli上样缓冲液 | Boston BioProducts | BP-110R | |
| 蛋白电泳 | 4-12% Bis-Tris凝胶 | ThermoFisher Scientific | NP0336 |
| 蛋白转印 | 硝酸纤维素膜 | ThermoFisher Scientific | 88018 |
| 封闭 | 脱脂奶粉 | ThermoFisher Scientific | M-0841 |
| 洗涤 | Tris缓冲盐水 | ThermoFisher Scientific | 50-751-7046 |
| 吐温-20 | Sigma-Aldrich | P9416 | |
| 封闭 | 牛血清白蛋白 | Fisher Scientific | 9048-46-8 |
| 蛋白提取 | Halt蛋白酶抑制剂混合物 | ThermoFisher Scientific | PI78430 |
| Halt磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoFisher Scientific | PI78428 | |
| 免疫印迹 | Immobilon Western HRP底物-Forte | Millipore | WBLUF0500 |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Takara | 740955.250 |
| RT-PCR | MultiScribe逆转录酶 | ThermoFisher Scientific | 4311235 |
| 2x qPCR通用绿色MasterMix | Lamda Biotech | qMX-Green | |
| 组织匀浆 | 硬组织匀浆管 | Omni International | 19-628 |
| 动物实验 | 多西环素补充啮齿动物饲料 | Envigo | TD.120769 |
| 对照啮齿动物饲料 | Envigo | TD.00588 | |
| PEG-400 | Millipore Sigma | PX1286B-2 | |
| ELISA | VeriKline人IFNβ ELISA试剂盒 | PBL Assay Science | 41410-1 |
| 细胞活力 | 2D CellTiterGlo细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7572 |
| RealTime-Glo MT细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9711 | |
| 凋亡检测 | Annexin-V FITC凋亡检测试剂盒 | BioVision | K101-25 |
| 支原体检测 | 支原体检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MP0025 |
| 免疫印迹 | STAT1总蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 14994 |
| 磷酸化STAT1 Y701抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| MX1抗体 | Cell Signaling Technology | 37849 | |
| Vinculin抗体 | Cell Signaling Technology | 13901 | |
| TYMP抗体 | Cell Signaling Technology | 4307 | |
| STAT3总蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 磷酸化STAT3 Y705抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 磷酸化STING S366抗体 | Cell Signaling Technology | 50907 | |
| STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3013 | |
| 磷酸化TBK1 S172抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| 磷酸化IRF3 S386抗体 | Abcam | 76493 | |
| IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化NF-κB p65 S536抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| p44/42 MAPK (ERK1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 磷酸化p44/42 MAPK (pERK1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 切割型Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 切割型Caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 20750 | |
| 切割型PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625 | |
| BIM抗体 | Cell Signaling Technology | 2933 | |
| 磷酸化H2AX S139抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 | |
| IFNAR1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | 7391 | |
| IFIT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14769 | |
| IRF1抗体 | -- | -- | |
| HRP标记的抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| HRP标记的抗鼠IgG | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 流式细胞术 | Attune NxT流式细胞仪 | ThermoFisher | -- |
| 细胞活力检测 | BioTek微板阅读器 | BioTek | -- |
| 组织匀浆 | BeadRuptor Elite匀浆仪 | OMNI International | -- |
| 免疫印迹 | Odyssey Fc成像系统 | LI-COR | -- |
| RT-PCR | QuantStudio3实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型(DMEM或RPMI1640)、血清浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| 药物处理 | 药物浓度(如diABZI 1 μmol/L, trametinib 100 nmol/L)、处理时间(24或72小时)、溶剂(DMSO) 阅读提示:Materials and Methods - Drugs |
| 基因敲除 | CRISPR/Cas9敲除的靶基因、gRNA序列、电穿孔条件、筛选方法 阅读提示:Materials and Methods - CRISPR-Cas9 and guide RNA-guided gene knockout |
| 体内实验 | 动物品系(NCG小鼠)、年龄(6-8周)、性别(雌性)、细胞接种数量(1×10^6)、给药剂量(diABZI 1.5 mg/kg静脉注射, cobimetinib 5 mg/kg口服)、给药频率(每日)、肿瘤测量公式 阅读提示:Materials and Methods - Animal studies |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(1×10^3 cells/well)、处理时间(72小时)、CellTiter-Glo试剂稀释比例(1:5) 阅读提示:Materials and Methods - Viability assay |