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荧光定量PCR反应体系
bamboopiggy
500ngrna反转后,稀释到200ul,取4ul上样
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问
引物设计一定从启动子开始吗?
dxy_np1w2as6
这题我会!不一定要从起启动子开始,可以从网站上查找目的基因mRNA的序列,之后从启动子两端的序列设计引物,这样可以选择很多引物配对,但是最后扩出来的序列一定要包含你的CDS区
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问
pcr扩增曲线有异常,总出现s型曲线
bamboopiggy
检查是不是都是在同一个孔,可能是这个孔被污染了,或者是热板盖歪了
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问
跑pcr,怎么避免非特异性条带
bamboopiggy
注意annealing temperature,可以适当提高
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问
PCR的产物总是太少,是什么原因?
bamboopiggy
看看你是不是酶啊,引物啊,或者是模版加的浓度不对
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问
pcr引物可不可以mix之后保存?
bamboopiggy
可以将pcr引物稀释后,按照1:1的浓度mix保存
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问
提取细菌RNA需要去除基因组DNA吗?
bamboopiggy
需要去除基因组DNA,否则对实验结果有影响。
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问
PCR产物需不需要凝胶纯化?
bamboopiggy
如果下一步要酶切,连接之类的,是需要纯化的
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问
验证质粒是否导入感受态是应该做pcr电泳还是直接做测序好呢?
bamboopiggy
都可以,一般会选择pcr鉴定,但是现在有些实验室有钱。就直接送测序
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问
自己引物设计软件和文献报道不一样
bamboopiggy
只要引物好用,不用管是不是和文献报道的一样,只管用
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问
rtPCR引物长度336bp可以用作引物吗?
bamboopiggy
可以用作rtPCR的引物,因为你已经找不到更合适的了,产物稍微长一点也是可以的。注意一下你的延伸时间就好
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问
引物设计提示多条合适,如何从中选择最优的
bamboopiggy
不用,你可以选比较靠前的引物,产物长度在50-200bp左右u
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问
如何选择多重荧光定量pcr的报告基团和淬灭基团,选择原则是什么?淬灭基团是不是一样比较好?
天一湖医者
根据荧光定量PCR仪荧光通道,选择适配的荧光基团,优先选择常用的荧光基团,如FAM、VIC或CY5等;2. 根据荧光基团类型选择淬灭基团。早期的淬灭基团TAMRA,自身会发出荧光信号,干扰检测结果,后续慢慢地被其他淬灭基团替代。目前淬灭基团最常用的就是BHQ、NFQ-MGB或QSY等;3. 进行多重qPCR检测时,每个通道要选择不同的荧光基团,且避免各标记基团的激发和发射波长重叠,出现荧光干扰的情
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问
有没有一款软件可以分析多重荧光定量pcr的引物是否会相互干扰及量化干扰程度?
Eason老歌迷
有的,可以参考https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
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问
进行PCR实验,SSⅢ与SSⅡ有何不同?
bamboopiggy
SSIII 是一种基因工程化的 MMLV 逆转录酶 (RT),它通过引入几个突变来降低 RNase H 活性、延长半衰期和提高热稳定性。 SSIII RT 提供更高的 cDNA 产量、更长的 cDNA 长度、更高的 GC 丰富靶 RNA 效率,以及比野生型 MMLV 和 MMLV RNase H-minus 酶更好的整体性能。SS II也是一种基因工程化的 MMLV 逆转录酶 (RT),与野生型
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问
PCR中关于cDNA的一点疑问
balalaLy
cDNA一般很少出问题,除非反复冻融次数太多,条带越来越淡有没有可能是你的酶出现问题了?酶反复使用过程中没有注意低温操作也容易成问题
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问
RTPCR实验高浓度的cDNA会对最终结果造成影响么?
bamboopiggy
模版浓度太高,可能与引物结合不完全,也可能很早就达平台期,看不出差别。一般要求酶和引物是过量的
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问
求助,半定量PCR的问题
bamboopiggy
半定量PCR是首先通过确定目标物PCR有限扩增至最大值的最低循环数,进而比较不同样品之间该目标物的PCR扩增产物数量,以此确定样品中目标物的相对数量。也就是说是一个相对值,不是绝对含量。至于第二个问题,完全一样的操作,并不代表完全一样的模版都加进去了,每加一次样,都可能存在误差,甚至没有吸到液体。
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问
PCR实验引物设计有什么要求?TM值一般多少最合适?
汤姆卜丽波
1、引物长度一般在15-30bp。常用的为18-27bp,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应;2、引物GC含量一般为40%-60%, 45-55%为宜,GC含量过高或过低都不利于引发反应,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近,一般Tm值不超过 5℃。3、引物所对应的模板序列的Tm值在55-80℃之间,最好为 72℃左右。4、引物的延伸是从3′端开始的,不能进行任
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问
Pcr模板加的量太多会导致产物多条带,且不亮吗
bamboopiggy
按照你的酶的说明书来加pcr模板的量,加多了,会产生非特异性结合,产物条带多,且不特异。
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