rtPCR引物长度336bp可以用作引物吗？

可以用作rtPCR的引物，因为你已经找不到更合适的了，产物稍微长一点也是可以的。注意一下你的延伸时间就好

不能，因为引物长度一般为15-30bp，常用的为18-27bp，但不能大于38bp；

可以试着做一下，看一看结果怎么样，和预测的结果有无差异

通常很多人用的都是Δ ΔCT的方法来进行相对定量，这就需要扩增效率接近2。而通常PCR产物越短，那么效率越高，越趋近于2，因此通常设计长度为200bp以内。所以，如果你的PCR产物越长，那么扩增效率越低，就不能简单的使用上述Δ Δ CT的方法，除非你做校正曲线（通常是不需要做的，如果你片段的长度小于200bp的话）。长度为797bp的片段尽管可以用realtime pcr的方法扩增出来，但显然已经几乎失去了QPCR的意义了，即不适合于定量实验。