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科研学霸天团,48小时有问必答
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问
PCR 管材质厚度不一,是不是厚点的稳定性更好呢?
bamboopiggy
这个和管壁的厚薄没啥关系,主要取决于你用的盖或膜的透光性。
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问
PCR 封板膜有好多种类型,哪种实验效果更好呢?
bamboopiggy
其实都可以,只要你每次实验用的都是同一个牌子的就没有问题,还有就是你自己封,要封紧。虽然这么说,我还是推荐用国外大品牌的,透光度和密闭性都好一些
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问
qPCR的内参应该怎么选
汤姆卜丽波
内参主要的作用就是校正和标准化,
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问
real time RT-PCR如何保证重复性
bamboopiggy
这个不是污染不污染的,只要你加样准,一般问题就不大,加样准,前提是枪和枪尖要match,保证每次加进去的样本量是一致的
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问
在菌落PCR时能够获得条带但是测序并没有该序列是什么原因?
bamboopiggy
可能是你的seqA有复杂结构,测不过去,你试试从你的insert seq中设计测序引物,分别往两端p,能不能把两个seq给p出来
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问
overlap PCR时有一段序列怎么都连接不成功都有可能是什么原因?
bamboopiggy
实在不行的话,把另外两段构建好的情况下,用酶切的方法,插入第三段。
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问
加尾法逆转录miRNA的qPCR如何区分前体和成熟体?
汤姆卜丽波
前体和成熟体的大小序列都不一样。除非你特别设计不同引物,不会一起扩增
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问
如何通过qpcr.测定基因敲除鼠基因的表达情况(主要是样品浓度不太一致)
bamboopiggy
收样品,然后提RNA,调整浓度,做逆转,然后跑qpcr,与内参值进行比较。其实你是基因敲除,做wb可能更能说明问题。
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问
RT值过高。最近实验细胞给药后杀伤效果跟之前相近,但同样方法下做出的RT值过高,有时候能超过40,大家帮忙提提问题
bamboopiggy
你说的是CT值过高吧?超过40基本代表没有什么表达了。要不你试试降低药物浓度,有部分细胞能活的情况下做这个实验。
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问
反转录同样按试剂盒建议量加,之后由SYBR染料法改为taqman探针法,结果曲线非常乱,不具有特异性,怎么改进
bamboopiggy
跟反转录和sybr的 关系不大,可能是你taqman探针法的引物有问题
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问
【扩增启动子】有时候同样的条件,第一次能扩增出来有单一明亮的条带,第二次就没有条带,这是什么原因呢?对于启动子扩增有什么建议吗?
汤姆卜丽波
没有条带的话,是不是操作过程中导致样本降解了
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问
易错pcr 可以用普通的pcr mix 做吗?
汤姆卜丽波
不可以的。易错pcr体系中用到的镁离子浓度和普通的不一样,还要加锰离子提高突变率
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问
做qpcr 时候设计引物一定要垮内含子嘛?
dxy_jrj59zn3
你的意思是引物设计在两个外显子的连接点上吧?其实可以把两条引物分别在两个外显子上,这样应该会比较好
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问
定量PCR和半定量一般对象检验的周期在多久
汤姆卜丽波
定量pcr一般两小时,大约40个循环。半定量的话就看你的实验目的,最多不超过35个循环。
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问
overlap pcr 如何设计引物?有何注意事项?
汤姆卜丽波
重叠延伸pcr的引物设计:引物F及R为基因两端特异引物,其中Fm及Rm为中间引物。其中引物Fm及Rm中间共享一段序列(至少10bp完全匹配),为突变点,突变点最好是位于引物的5’端,尽量避免出现在3’端。然后分别用引物F和Rm及Fm和R进行配对进行PCR。该步一定要用pfu酶,不能用Taq酶,因为Taq酶容易在PCR 产物末端加A,会造成产物移码突变。其余标准和普通pcr一致的
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问
求助:跑pcr整不出来?
Eason老歌迷
如果你测序有,但是扩增不出来,可能是模板dna被降解了?引物的浓度问题,引物设计的是不是合理等
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问
RT-pcr,整出来是一条直线,怎么回事?
whilt-shirt
有可能是程序原因,你可以先逆转录,然后再PCR试试。
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问
反转录pcr试剂盒中随机引物合成片段的原理是什么,大小会不会不一样
bamboopiggy
随机引物:某些特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列,比较难以转录成全长序列时,可采用非特异的随机引物来转录全长mRNA。选择这种引物,体系中所有RNA分子会全部充当DNA第一链模板,然后PCR引物在下游扩增过程中再扩增特异的目的基因。通常,用此引物合成的cDNA中,96%来源于rRNA。Oligo(dT):绝大多数真核细胞的mRNA具有3’端Poly(A+)尾,所以使用Oligo(dT)仅mR
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问
Trizol法提取的Rna模板不经过dna酶消化可以直接用于rt-qpcr吗
whilt-shirt
可以直接用,但是可能会有污染。
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问
菌液Pcr反应中,一般最少多少个循环可以得到可视条带的浓度。
whilt-shirt
一般35个循环就能看到条带了。
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