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        共同表位的预测 求助!

        相关实验:用 GST 融合蛋白检测蛋白质-蛋白质相互作用实验

        user-title

        红豆西米露嘻嘻

        想预测禽流感的几种亚型的共同表位,原本拿这几种亚型的蛋白质序列进行比对,发现都没有相似的序列,求大佬提点意见!如果能介绍网站和方法就更好了!!!

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        3 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        预测共同表位可以使用一些生物信息学方法,例如结构生物学、序列分析和比较基因组学等方法。

        结构生物学方法

        结构生物学方法可以通过分析病毒表面蛋白的三维结构来预测共同表位。这种方法需要已知的病毒蛋白质结构,可以通过比对不同亚型的结构来鉴定可能的共同表位。这种方法需要专业的软件和技能,例如蛋白质结构分析软件PyMOL等。

        序列分析方法

        序列分析方法可以通过比对不同亚型的蛋白质序列来寻找可能的共同表位。这种方法需要已知的蛋白质序列,可以通过比对不同亚型的序列来鉴定可能的共同表位。这种方法需要专业的软件和技能,例如蛋白质序列分析软件Clustal等。

        比较基因组学方法

        比较基因组学方法可以通过分析不同亚型的基因组序列来预测共同表位。这种方法需要已知的基因组序列,可以通过比对不同亚型的基因组序列来鉴定可能的共同表位。这种方法需要专业的软件和技能,例如基因组序列分析软件NCBI等。

        总之,预测共同表位需要综合运用多种生物信息学方法,并且需要进行进一步的实验验证。

        user-title

        sswei

        有帮助

        细胞表位的鉴定是研制疫苗、疾病诊断的关键步骤,表位预测是研究蛋白质表位一种筛选技术,能降低传统方法的大量投入,大幅降低研制时间、研发经费投入、研究人员精力花费等。表位预测的计算工具和方法不断推出,但预测性能却难言理想。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以上pubmed上搜相关的综述,会提供一些思路

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