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PCR反应体系的耐热DNA聚合酶

PCR反应体系的耐热DNA聚合酶 DNA的体外扩增是由许多不同来源的DNA聚合酶完成的。对PCR而言,热稳定DNA聚合酶(如Tag、Vent和pfu)优于热不稳定聚合酶(如T4、T7和Klenow),因为它们更易操作和实现自动化,其中以Taq DNA聚合酶的应用最为广泛。Taq DNA聚合酶的分子量为94kD这种酶不显示任何3,→5,核酸外切酶活性它的最适反应温度在75℃左右对95℃的变温 ...

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PCR反应体系的循环参数

1、变性温度和时间:模板DNA和PCR产物的变性不充分是PCR失败的主要原因。适宜的变性条件是95℃ 30s或97℃15s。变性不完全,DNA双链会很快复性因而减少产量。在变性中温度太高或反应时间过长会导致酶活性的损失。Taq DNA聚合酶活性的半寿期:92.5℃为2h以上,95℃为40min,97℃为5min。 2、复性温度和时间:复性温度决定PCR的 ...

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PCR反应体系的污染的对策

PCR反应体系的污染的对策 PCR可从痕量的DNA扩增出大量的DNA产物,由于它的高度敏感性,使PCR也特别容易受到污染。如果一对引物多次使用或以靶序列扩增产物的有无作为诊断的标准,那么必须消除污染以得到有意义的PCR结果。污染的DNA可能有三个来源:来自其他测试样品的DNA,来自实验材料如重组克隆的DNA,或者来自同一靶序列的前一次PCR的扩增产物。最后一种污染,通常称为“遗留”(car ...

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PCR常见问题及处置

PCR常见问题及处置 1、没有扩增产物形成: ①循环温度,特别是解链温度是否确切,注意PCR仪的指示温度是否与实际温度相符; ②引物的组成是否正确,有无二级结构的形成; ③聚合酶活性是否正常; ④反应系统有无蛋白酶或核酸酶的存在,使聚合酶或模板及产物降解,可在95℃以上处理反应系统使其灭活; ⑤某些来源的DNA可能有较难去除的蛋白质成分抑制PCR系统用蛋白 ...

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PCR反应体系的其他优化策略

PCR反应体系的其他优化策略 1、增强剂:一系列辅助物如DMSO(1%~10%)、PEG-6000(5%~15%)、甘油(5%~20%)、非离子去污剂、甲酰胺(1.25%~10%)和牛血清白蛋白(10~100μg/ml)等可以加到反应中以提高特异性和产量。有些反应只能在这些辅助物存在时才能扩增。2、热启动PCR:Tag酶在低温下仍有活性,当所有的反应成分混合后进入循环前,一些非特 ...

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白细胞标本DNA PCR反应模板的制备

白细胞标本DNA PCR反应模板的制备 方法一 【试剂与配制】蛋白酶K:20mg/L 溶于10mmol/L Tris-HCl pH7.5TE缓冲液(pH7.5 或8.0)PBS(磷酸盐缓冲液)钾缓冲液:50mmol/L KCl10~20mmol/L Tris-Cl,2.5mmol/L MgCl(pH8.3),1%laureth12 ,0.5% Tween-20,蛋白酶K(100μg/m ...

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细菌DNA PCR反应模板的制备

细菌DNA PCR反应模板的制备 从分析的标本中纯化核酸,即制备PCR反应的模板,是使PCR获得成功的重要的第一步。由于PCR的用途各异,用于抽提核酸的起始材料种类可能差异很大(包括新鲜的、储存的和古代的)。每种特殊样品类型有各自的限制和抽提核酸的不同要求,但它们都有一个共同的标准,扩增的灵敏性要求特别注意不同材料、PCR产物、质粒或对照之间可能存在的交叉污染。由于PCR不需要高分子量和高 ...

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全血标本DNA PCR反应模板的制备

全血标本DNA PCR反应模板的制备 【试剂与配制】蛋白酶K:20mg/L 溶于10mmol/L Tris-HCl pH7.5TE缓冲液(pH7.5 或8.0)PBS(磷酸盐缓冲液)钾缓冲液:50mmol/L KCl,10~20mmol/L Tris-Cl,2.5mmol/L MgCl(pH8.3), 1%laureth12,0.5 ...

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临床拭子标本DNA PCR反应模板的制备

临床拭子标本DNA PCR反应模板的制备 此方法适用于各种拭子标本(鼻、咽、口腔和生殖道等)中DNA的快速制备。 【试剂与配制】PBS-2×Fungi-Bact液钾缓冲液:50mmol/L KCl10~20mmol/L Tris-Cl,2.5mmol/L MgCl(pH8.3),1%laureth12,0.5% Tween-20,蛋白酶K(100μg/ml) 生理盐水无水乙醇T ...

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固定和包埋的组织标本DNA PCR反应模板的制备

固定和包埋的组织标本DNA PCR反应模板的制备 石蜡包埋组织和其他固定组织代表档案标本。由于PCR可以扩增相对于完整的染色体DNA来说较短的DNA片段,而且在一定程度上可接受降解的DNA,所以固定组织适用于分子遗传学研究。这些组织是前瞻和回顾性分子遗传学和感染疾病研究的巨大资源。大部分固定和包埋组织标本经福尔马林固定,分析前样品大多要进行脱蜡和水化,再用蛋白酶消化。 【试剂与配制】( ...

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微量和特殊标本DNA PCR反应模板的制备

微量和特殊标本DNA PCR反应模板的制备(一)血斑标本【操作方法】 (1) 将血斑剪碎置于试管中;(2) 加1.8ml TES液(含0.15mol/L NaCl10mmol/L Tris-HClpH7.51mmol/L EDTA)浸泡10min;(3) 加10% SDS 180μl和蛋白酶K(10U)25μl50℃过夜;(4) 用等体积的饱和酚和氯仿各抽提两次;(5) ...

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体外培养细胞和组织细胞DNA PCR反应模板的制备

体外培养细胞和组织细胞DNA PCR反应模板的制备 1g哺乳动物细胞,可以得到约2mg DNA。【试剂与配制】(1)磷酸缓冲液;(2)酚/氯仿/异戊醇25:24:1;(3)7.5mol/L醋酸铵;(4)100%和70%乙醇;(5)TE缓冲液;(6)消化缓冲液:100mmol/L NaCl、pH8.0 10mmol/L Tris.Cl、pH8.0 25mmol/L EDTA、0.5%SDS ...

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PCR产物的检测凝胶电泳分析法

PCR产物的检测凝胶电泳分析法 用琼脂糖凝胶电泳来分辨和检测PCR产物是最简单,也是最常用的方法。根据寡核苷酸引物的位置可以预知产物的长度,所以在正确的位置上出现分离的条带通常表示反应是成功的。凝胶电泳不仅可以鉴定产物的大小,监测扩增的情况,还可以用来纯化产物。PCR产物电泳分析中琼脂糖浓度片段大小(bp) 琼脂糖浓度 50~500 ...

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凝胶中PCR产物再扩增标本PCR反应模板的制备

凝胶中PCR产物再扩增标本PCR反应模板的制备 有时DNA模板来源较困难,如病毒核酸或cDNA,一次PCR成功后,要想多获得一些PCR产物,用原模板较浪费,此时可用凝胶中PCR产物作为模板,用低熔点胶回收后溶解直接用于PCR。【操作方法】(1) 用合适浓度(1%)的低熔点胶分离扩增产物;(2) 切下预期的产物,放于微量离心管中,可保存于4℃或立即溶解应用; ...

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RNA标本PCR反应模板的制备

RNA标本PCR反应模板的制备(一) 血液单核细胞RNA制备(1) 用密度梯度法制备血中单核细胞;(2) 取出单核细胞用PBS洗2次,每次300g离心5min;(3) 洗后的单核细胞沉淀用200~400μl含0.5% NP-40的预冷的IHB(0.01% DEPC配制)重新悬起;(4) 离心10sec沉淀细胞核,若有必要,可收集细胞核DNA,但应洗去DEPC;(5) 将上 ...

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点杂交膜的制备

点杂交膜的制备 当扩增产物是多条带时,用点杂交更合适。通过将PCR 产物固定于尼龙膜和硝酸纤微素膜上,再用标记的探针进行点杂交。点杂交可检测突变DNA的突变类型,而应用于人类遗传病诊断和某些基因的分型。 方法有二:一是将PCR产物固定至膜上,液相中的探针与其杂交;二是将多种探针固定于同一膜上不同区域,再与液相中的PCR产物杂交,根据阳性位置即可判断产物的类型。1.PCR产物的固定 ...

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PCR产物的检测点杂交

PCR产物的检测点杂交1.寡核苷酸探针杂交 【试剂与配置】 预杂交液:5×SSC,5×Denhadrt 0.5%Triton X-100 2×SSC/0.1%SDS 1×SSC/0.1%SDS 0.1×SSC/0.1%SDS 【操作方法】 (1) 将2×SSC湿润的杂交膜放入50ml试管中,再加入5~10ml预杂交液,盖上盖子; (2)置于杂交炉中,在杂交温度下(比探 ...

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PCR产物的检测PCR-ELISA法

PCR产物的检测PCR-ELISA法 在一个引物的5’端标记上生物素以便使其能与包被板上的亲合素结合而固定PCR产物,而在另一引物的5’端标记FITC,用HRP标记的抗FITC抗体与之结合显色,即可进行常规ELISA检测。如设立标准对照,此技术还可用于定量分析。【试剂与配置】 包被液:4.3mmol/L Na2HPO4 1.4mmol/L K2HPO4 0.05% (w/v) Twee ...

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点杂交的检测

点杂交的检测 现在大多数的实验室里,常用的标记物为地高辛和生物素,下面主要介绍这两种标记系统的显色方法。1. 地高辛标记探针和PCR引物【试剂与配置】缓冲液Ⅰ:150mmol/L NaCl 100mmol/L Tris-HCl (pH7.5)缓冲液Ⅱ:0.5%阻断剂溶于缓冲液Ⅰ缓冲液Ⅲ:100mmol/L NaCl 100mmol/L Tris-HCl (pH7.5),50mmol/ ...

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免疫PCR(IM-PCR)

免疫PCR(IM-PCR) 免疫PCR是将抗原抗体反应的特异性与体外扩增DNA的技术相结合用于检测生物样品中含量极少的蛋白质,如细胞因子,微量抗原等的方法。首先由Sahot等用重组的链霉亲合素和A蛋白的嵌合体,将免疫法和PCR结合在一起而形成。其基本原理和酶联免疫固相检测法(ELISA)一样只是标记物质为一段特定的DNA,并且通过PCR扩增进行检测。为此它要比ELISA敏感10万倍敏感 ...

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