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PCR常见问题及处置

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1206
PCR 常见问题及处置
 
    1、没有扩增产物形成:
    ①循环温度,特别是解链温度是否确切,注意PCR仪的指示温度是否与实际温度相符;
    ②引物的组成是否正确,有无二级结构的形成;
    ③聚合酶活性是否正常;
    ④反应系统有无蛋白酶或核酸酶的存在,使聚合酶或模板及产物降解,可在95℃以上处理反应系统使其灭活;
    ⑤某些来源的DNA可能有较难去除的蛋白质成分,抑制PCR系统,用蛋白酶K重新处理即可。
 
    2、非特异性产物的出现:
    ①提高退火温度,缩短退火或延伸时间;
    ②调整引物,Taq DNA聚合酶或模板;
    ③调整Mg2+用量;
    ④减少热循环次数。
 
    3、引物二聚体的形成:
    ①检查引物的序列,特别是在3端是否有互补区;
    ②提高退火温度;
    ③调整引物与模板浓度,使模板比例增高;
    ④增加引物长度;
    ⑤减少热循环次数。
 
    4 、预防假阳性结果:设置一系列对照,如
    ①阳性对照:应用已知阳性模板;
    ②阴性或空白对照:加无关或不加模板DNA;
    ③重复试验:重要的实验结果要反复验证,下结论要慎重。
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