PCR常见问题及处置
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PCR 常见问题及处置
1、没有扩增产物形成:
①循环温度,特别是解链温度是否确切,注意PCR仪的指示温度是否与实际温度相符;
②引物的组成是否正确,有无二级结构的形成;
③聚合酶活性是否正常;
④反应系统有无蛋白酶或核酸酶的存在,使聚合酶或模板及产物降解,可在95℃以上处理反应系统使其灭活;
⑤某些来源的DNA可能有较难去除的蛋白质成分,抑制PCR系统,用蛋白酶K重新处理即可。
2、非特异性产物的出现:
①提高退火温度,缩短退火或延伸时间;
②调整引物,Taq DNA聚合酶或模板;
③调整Mg2+用量;
④减少热循环次数。
3、引物二聚体的形成:
①检查引物的序列,特别是在3端是否有互补区;
②提高退火温度;
③调整引物与模板浓度,使模板比例增高;
④增加引物长度;
⑤减少热循环次数。
4 、预防假阳性结果:设置一系列对照,如
①阳性对照:应用已知阳性模板;
②阴性或空白对照:加无关或不加模板DNA;
③重复试验:重要的实验结果要反复验证,下结论要慎重。