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移码突变

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      伊莱博生物科技(上海)有限公司

    • 服务名称

      移码突变

    一、定义与分子机制

    1. 核心概念

    移码突变是一种由非3倍数核苷酸(1、2、4、5...个碱基)在基因编码区的插入或缺失(Indels)引起的基因突变。其本质在于破坏三联体密码子的连续性,导致阅读框偏移(Reading Frame Shift),使突变点下游的氨基酸序列完全改变或提前终止(图1)。

    2. 发生机制

    诱因 分子过程 案例
    自发错误 DNA复制滑移(如重复序列区) 微卫星不稳定肿瘤
    化学诱变剂 吖啶类染料插入双链 → 复制时碱基错配 实验室诱导突变
    物理损伤 辐射/活性氧致碱基断裂 → 修复时非3倍数缺失 紫外线相关皮肤癌
    基因编辑 CRISPR/Cas9诱导DSB → NHEJ修复引入Indels 基因敲除动物模型 

    关键特征:突变越靠近基因5'端,对蛋白功能破坏越大(>80%序列改变)。


    二、生物学后果与疾病关联

    1. 蛋白质功能破坏

    • 翻译错误
      阅读框偏移导致错义氨基酸插入(如精氨酸→终止密码子)。
    • 肽链截短
      提前出现终止密码子(UAA/UAG/UGA) → 产生无功能截短蛋白(图2)。
    • 异常折叠
      错误氨基酸序列致蛋白空间结构崩溃(如囊性纤维化ΔF508突变)。

    2. 疾病关联性

    疾病类型 相关基因 突变形式 致病机制
    遗传病 CFTR 3-bp缺失(ΔF508) 氯离子通道功能丧失 → 囊性纤维化 
      DMD 外显子缺失 肌营养不良蛋白缺失 → 杜氏肌萎缩 
    癌症 TP53 1-bp插入(密码子248) p53抑癌功能丧失 → 多癌种 
    自身免疫病 NOD2 3020insC 免疫应答失调 → 克罗恩病 

    三、基因编辑中的移码突变:期望与悖论

    CRISPR/Cas9技术通过NHEJ修复刻意诱导移码突变以实现基因敲除(KO),但实验中常出现突变后蛋白持续表达的反常现象:

    1. 悖论成因解析

    原因 分子机制 解决方案
    抗体特异性不足 抗体识别截短蛋白表位 → 假阳性信号 使用N端抗体 
    移码位置靠近3'端 突变点后仍保留部分功能域(如激酶活性区) 设计靶向5'端gRNA 
    截短蛋白逃逸降解 缺乏降解信号(如PEST序列) → 稳定存在 联合蛋白酶抑制剂 
    遗传补偿效应 同源基因代偿性上调(如smn1突变致smn2激活) 双基因敲除 
    可变剪切绕过 外显子跳跃产生新异构体 → 恢复阅读框 靶向保守外显子 
    无义介导降解(NMD)失效 终止密码子位于最后外显子 → 逃避NMD识别 诱导外显子跳跃 

    2. 实验验证要点

    产品细节图片1

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    • 移码突变 frameshift mutation,phase shi-ft mutation

        移码突变 frameshift mutation, phase shi-ft mutation 在基因 DNA中插入或缺失非 3的倍数的少数几个碱基,因而在该基因 DNA作为蛋白质的氨基酸顺序的信息解读时,读码的框架会发生移动,这样的突变称为移码突变。吖啶橙 -类诱变剂可以诱发这类突变。如图所示,丝氨酸的密码子和甘氨酸的密码子之间插入了一个鸟甙酸( G),由于在蛋白质合成时每三个邻接的碱基和一个氨基酸相对应,所以解读框段( reading frame)向左面一个碱基移动

    • AAV 在眼科中的应用

        2、基因编辑(Gene Editing) 原理:Cas9 蛋白在 sgRNA 的引导下切断目的基因 DNA 列,导致移码突变、 碱基突变、基因片段敲入等 应用场景:隐性、显性单基因疾病,基因功能缺陷引起的疾病等 应用案例精选 病毒工具:AAVshH10-SpCas9,AAV shH10-sgRNA 作用效果:敲除 Car2 基因 注射方式:DBA/2J 小鼠,玻璃体内注射,1x1013 gc/mL. 2uL 检测时间: 感染后 1 周

    • 搞定 CRISPR/Cas9 系统操作

      。 Target 设计 Target 设计:通常情况下我们仅需要在你的目的位置附近找到 NGG(N 代表任意核苷酸),然后找到其紧邻的上游 20 nt 即可(如上图)。 目的位置的选择:我们绝大部分时候的目的是完全 KO 一个基因,其原理是利用移码突变(CRISPR/Cas 系统诱导产生 indel)。所以我们一般选择距离起始密码子 ATG 下游 200bp 范围内的 exon 区域。另外,通常一个基因往往会转录成 2 个以上的 isoforms,所以请选择尽量

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