shRNA文库构建

• 高多样性： 我们的shRNA文库拥有从数百至10⁶的高度复杂度。
• 高度灵活的载体设计： 我们可根据您的需求为您设计合适的文库载体，使用不同的递送系统、启动子、标记基因、barcode等。
• 高质量病毒包装： 我们可包装多种病毒系统，周期短、性价比高。
• 高覆盖率、高均一性： 我们设计的载体变体其文库可达>98%的覆盖率。

价格与周期

 

技术详情

shRNA具有其特有的茎环结构，在RNA干扰（RNAi）过程中发挥着至关重要的作用，可精准降解mRNA。shRNA转录形成发夹结构后，可识别并降解靶mRNA。shRNA文库是大规模功能缺失筛选的强大工具。根据您的研究需求，云舟生物提供多种形式的shRNA文库，包括E. coli菌株、质粒DNA和包装好的病毒载体。这些文库都会进行NGS测序验证以确定文库的质量。

 

 

慢病毒shRNA文库介导的基因筛选常规流程如图2所示。首先，利用慢病毒shRNA文库转导靶细胞，并通过慢病毒载体上携带的筛选标记（例如药物选择或荧光标记）来筛选成功转导的阳性细胞。将阳性细胞分为对照组和实验组，对实验组进行压力选择（如药物处理或重复传代），筛选出具有目的表型的细胞。基因功能筛选策略通常有三种类型：1）活力筛选，筛选出shRNA富集或锐减的活细胞; 2）报告基因筛选，筛选出报告基因的表达强度与shRNA的富集有关的细胞（如靶向调节报道基因表达shRNA）；3）行为筛选，筛选出shRNA与细胞侵袭、迁移等基因相关的细胞。相对于对照组，实验组细胞筛选完成后，通过sanger测序或NGS测序鉴定出富集或锐减的shRNA。通过下游功能研究，进一步分析富集或消减的shRNA可能靶向的候选基因。