CRISPR文库构建

CRISPR文库构建

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  • 云舟生物在设计和构建高复杂性的大规模功能筛选文库方面具有丰富的经验。
  • 广州
  • 2025年12月31日
    • 详细信息
    • 技术资料
    • 提供商

      云舟生物科技(广州)股份有限公司

    • 服务名称

      定制服务

    云舟生物专注于高度复杂的CRISPR文库设计,以满足各种大规模和小规模功能筛选的实验需求。CRISPR文库可以以E. coli菌株、质粒DNA或重组病毒的形式交付。我们使用下一代测序(NGS)全面验证定制文库,能让您真正了解所购买文库的组分和质量。

     

    亮点

    • 高多样性: 我们的CRISPR文库拥有从数百至106的高度复杂度。
    • CRISPR文库设计经验丰富: 我们对于多种类型的CRISPR文库针对不同种类的筛选策略拥有丰富的设计经验,包括但不限于CRISPR KO(单gRNA或双gRNA)、CRISPRa、CRISPRi、单细胞CRISPR技术、CRISPR barcoding技术等。
    • 高度灵活的载体设计: 我们可根据您的需求为您设计合适的文库载体,使用不同的递送系统、启动子、标记基因、barcode等。
    • 高质量病毒包装: 我们可包装多种病毒系统,周期短、性价比高
    • 高覆盖率、高均一性: 我们设计的载体变体其文库可达>98%的覆盖率
     
    技术详情
    CRISPR 筛选策略

    CRISPR文库是一种强大的工具,可用于针对特定通路、疾病、细胞对药物治疗的反应、发育过程、基因调控等编码或非编码区域的大规模或全基因组功能筛选。表3展示了常用的CRISPR筛选方法并进行了比较。

    表3 CRISPR筛选方法比较

    CRISPR文库构建

     

     

    实验数据

     

    Complexity, coverage, and alignment rate of CRISPR libraries constructed by VectorBuilder

    图1 云舟生物CRISPR文库的复杂度、覆盖率和序列比对的一致性。来自于云舟生物构建的CRISPR文库的数据以无偏好方式进行收集和分析。(A)文库复杂度范围从102到>105。(B)gRNA的覆盖率和读取的比对率均很高,表明我们的文库具有出色的覆盖率和低错误率。

    Distribution of gRNA representation in a pooled library

    图2 包含7.7×104个gRNA的文库的gRNA分布统计。gRNA read counts使用NGS库大小(一千万reads)进行标准化,并以log2尺度绘制。NGS测序深度为300×。

     
    客户提供文库质粒

    如果您需要使用您的文库质粒构建文库,请按照外来物品接收指南将质粒寄送给我们。请严格按照我们的指南来进行装运以免造成物品的任何延误和损坏。客户提供的所有材料均需经过QC检测,每一份材料附加检测费用。请注意,客户提供物品接收并通过QC之后生产才正式开始。对于使用客户文库质粒构建的文库,我们无法保证文库的多样性和均一性。

     

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