- ￥4500
- Ribo-seq蛋白组翻译
- 全国
- 2025年09月02日
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- 详细信息
- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
杭州开泰生物技术有限公司
- 服务名称：
Ribo-seq蛋白组翻译
- 规格：
1个样本
Ribo-seq——核糖体印迹测序
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核糖体印迹测序（Robo-seq），可以对正在翻译的RNA进行检测。Ribosome profiling是针对与核糖体结合、长度约为30nt的正在翻译的RNA片段进行富集、测序和定量。据此可推测起始密码子位置（包括非AUG起始）以及uORFs等信息。
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项目流程
分析内容
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Ribo基础分析
分析内容
解决问题
测序数据质量评估
过滤低质量数据，保证数据质量
参考序列比对分析
比对率分析
RFs统计
统计RFs并且明确在基因组的位置
基因表达定量
基因表达定量
翻译暂停分析
预测翻译暂停事件的发生
基因功能注释
分析基因功能
组间差异分析
寻找不同比对组间的差异mORFs
差异富集分析
差异mORFS相关基因的GO，KEGG富集分析
翻译ORFs鉴定和表达
鉴定翻译ORFs
翻译ORF数据库注释
寻找可能存在翻译潜力的sORF
翻译ORF差异分析
寻找不同比对组间的差异翻译ORF
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结果展示
RFs编码基因覆盖分布图 RFs的P-site热图
RFs丰度分布元图 注释结果条形图
差异基因火山图 差异基因聚类热图
富集气泡图 富集圈图
tranORFs长度分布图
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- 送样建议
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样本类型
送样量
植物组织
400mg以上
人，动物组织
200mg以上
细胞
4×106以上
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- 内容
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文献和实验Science：颉伟 / 陈子江 / 赵涵团队揭示人类早期胚胎翻译组图谱并发现 TPRXs 参与人类合子基因组激活
调控因子 TPRXL, TPRX1, 和 TPRX2。 通过结合超灵敏翻译组测序技术 Ribo-lite (Ligation-free, ultra-low-InpuT and Enhanced Ribo-seq) 和转录组测序技术（Smart-seq2）而开发出的 Ribo-RNA-lite (R2-lite) 方法可以进行翻译组与转录组联合测序，该方法被应用于人类卵子和早期胚胎共 8 个时期。经翻译组分析比较发现，在卵子向早期胚胎转变过程中，人-鼠同源基因中有一半呈现保守的翻译
，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括对这些翻译后修饰的定量研究。 这三大块中所提到的大规模，既可以是样品数量的大规模高通量，也可以是少量样本中蛋白数量的大规模高通量。 研究原因 有的同学可能又要问，简单的定性定量研究，有了 RNA-seq 等高通量的实验方法，为什么还学要蛋白组学呢？ 首先，由于翻译调控和翻译后调控的存在，RNA 的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高，1999 年， 蛋白组学界大神 Steven Gygi 还在另一位大神 Ruedi Aebersold
展，使得定量的蛋白组学研究成为可能。然而，当细胞适应了转录水平（例如，转录因子结合、染色质结构改变）、转录后（例如，核与质的输出或者是信使RNA的剪接，特定的核糖体负荷）、翻译后（蛋白降解和输出）的精细调控机制后，转录物和蛋白质丰度测量结果可能会不一致。因此，定量的转录物和蛋白质丰度测量可作为相互的标准，为高通量分析得出的基因表达数据做出合理的解释。正如蛋白质和RNA之间类似点可以增加我们对新的生物标记的信任度一样，差异也能暗示我们“其他的转录后调控结合点可作为治疗的候选靶点”。研究现状通过分析细胞
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