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- Ribo-seq蛋白组翻译
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- 2026年01月17日
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- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
杭州开泰生物技术有限公司
- 服务名称：
Ribo-seq蛋白组翻译
- 规格：
1个样本
Ribo-seq——核糖体印迹测序
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核糖体印迹测序（Robo-seq），可以对正在翻译的RNA进行检测。Ribosome profiling是针对与核糖体结合、长度约为30nt的正在翻译的RNA片段进行富集、测序和定量。据此可推测起始密码子位置（包括非AUG起始）以及uORFs等信息。
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项目流程
分析内容
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Ribo基础分析
分析内容
解决问题
测序数据质量评估
过滤低质量数据，保证数据质量
参考序列比对分析
比对率分析
RFs统计
统计RFs并且明确在基因组的位置
基因表达定量
基因表达定量
翻译暂停分析
预测翻译暂停事件的发生
基因功能注释
分析基因功能
组间差异分析
寻找不同比对组间的差异mORFs
差异富集分析
差异mORFS相关基因的GO，KEGG富集分析
翻译ORFs鉴定和表达
鉴定翻译ORFs
翻译ORF数据库注释
寻找可能存在翻译潜力的sORF
翻译ORF差异分析
寻找不同比对组间的差异翻译ORF
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结果展示
RFs编码基因覆盖分布图 RFs的P-site热图
RFs丰度分布元图 注释结果条形图
差异基因火山图 差异基因聚类热图
富集气泡图 富集圈图
tranORFs长度分布图
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- 送样建议
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样本类型
送样量
植物组织
400mg以上
人，动物组织
200mg以上
细胞
4×106以上
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- 内容
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文献和实验Science：颉伟 / 陈子江 / 赵涵团队揭示人类早期胚胎翻译组图谱并发现 TPRXs 参与人类合子基因组激活
调控因子 TPRXL, TPRX1, 和 TPRX2。 通过结合超灵敏翻译组测序技术 Ribo-lite (Ligation-free, ultra-low-InpuT and Enhanced Ribo-seq) 和转录组测序技术（Smart-seq2）而开发出的 Ribo-RNA-lite (R2-lite) 方法可以进行翻译组与转录组联合测序，该方法被应用于人类卵子和早期胚胎共 8 个时期。经翻译组分析比较发现，在卵子向早期胚胎转变过程中，人-鼠同源基因中有一半呈现保守的翻译
1 个关键药物，实现小鼠全能干细胞体外捕获和长期维持，北大杜鹏 Cell 报道新技术
学分析。核糖体谱测序分析 (Ribo-seq) 显示，TBLCs 与 PSCs 进行比较时，有 2581 个和 837 个基因表现出上调和下调，上调的基因包含了全能性基因 ZSCAN4s、DDIT4L、SP110 等，下调的基因包含了多能基因 POU5F1、ZFP42、SOX2 等。 图片来源：Cell 采用全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS)，他们分析了 TBLCs 和 PSCs 的 DNA 甲基化特征，总的来说，他们发现 PSCs 中 CpG 甲基化水平为 71%，接近胚胎第 6.5 天
Adv Sci：林戈/薛愿超合作阐明 eIF4E1B 在哺乳动物卵母细胞向胚胎转换过程中母源 mRNA 选择性翻译的作用机制
？这些 RNA 是否共同存在着特殊的调控元件？ 中南大学/中信湘雅生殖与遗传医院林戈教授团队联合中科院生物物理所薛愿超教授团队，利用 LACE-seq 技术明确了翻译起始因子 eIF4E1B 所结合的靶标 mRNA，通过进一步分析发现其倾向性结合在靶标 mRNA 的 5′和 3′UTR 区域。为了明确 eIF4E1B 在卵母细胞翻译激活过程中的选择性作用，研究人员比较了经典翻译起始因子 eIF4E 和 eIF4E1B 所结合靶标 mRNA 的差异，发现不同亚型的翻译起始因子能靶向结合特定的 mRNA
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