单细胞混样测序

单细胞Mix测序

单细胞Mix测序产品是基于10x Genomics或BD Rhapsody平台，利用寡核苷酸偶联的抗体或脂质结合的 特征寡聚体条形码孵育不同的样本，为不同的样本标记上不同的标签，然后将多个样本混合在一起，按照单 一样本文库制备的流程，进行一次建库操作，然后上机测序，实现多样本混样单细胞测序。
 

• 产品优势

• 产品局限性

1. 必须要能够同时送2个样本以上
2. 可能存在细胞数捕获偏差，混样样本数越多可能偏差越大
3. 需要的实际样本量大，样本抗体标记的过程中需要多次清洗
4. 双细胞率可能比单个样本捕获的时候高
5. 原始数据暂时不可拆分，但是不影响后续的数据分析

• 应用案例1

• 研究目的：利用单细胞RNA测序（scRNA- seq）剖析人类免疫细胞群异质性的性能

      样本信息：3个流式分选得到的T细胞亚群样本
      测序策略：BD平台，单细胞混样测序
      捕获细胞数：9708个细胞
      研究结论：绘制了人类初级CD4 T细胞的高分辨率图谱，并确定了血液和组织中Th1、Th17和调 节性T细胞（Treg）分化的精确轨迹

• 应用案例2

• 研究目的：利用单细胞RNA测序（scRNA- seq）评估继发于高氧的正常肺部组织或受损 的肺部组织的发育过程

      样本信息：36只小鼠的肺组织
      测序策略：10x平台，单细胞混样测序
      捕获细胞数：＞66,000个细胞
      研究结论：该研究描述了高氧暴露的多个方面，并确定了作为支气管肺发育不良的潜在药物靶点 的病理路径-方式