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吉凯基因
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admin_dxy
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单细胞Mix测序
单细胞Mix测序产品是基于10x Genomics或BD Rhapsody平台,利用寡核苷酸偶联的抗体或脂质结合的 特征寡聚体条形码孵育不同的样本,为不同的样本标记上不同的标签,然后将多个样本混合在一起,按照单 一样本文库制备的流程,进行一次建库操作,然后上机测序,实现多样本混样单细胞测序。

- 产品优势

- 产品局限性
- 必须要能够同时送2个样本以上
- 可能存在细胞数捕获偏差,混样样本数越多可能偏差越大
- 需要的实际样本量大,样本抗体标记的过程中需要多次清洗
- 双细胞率可能比单个样本捕获的时候高
- 原始数据暂时不可拆分,但是不影响后续的数据分析
- 应用案例1

- 研究目的:利用单细胞RNA测序(scRNA- seq)剖析人类免疫细胞群异质性的性能
样本信息:3个流式分选得到的T细胞亚群样本
测序策略:BD平台,单细胞混样测序
捕获细胞数:9708个细胞
研究结论:绘制了人类初级CD4 T细胞的高分辨率图谱,并确定了血液和组织中Th1、Th17和调 节性T细胞(Treg)分化的精确轨迹
- 应用案例2

- 研究目的:利用单细胞RNA测序(scRNA- seq)评估继发于高氧的正常肺部组织或受损 的肺部组织的发育过程
样本信息:36只小鼠的肺组织
测序策略:10x平台,单细胞混样测序
捕获细胞数:>66,000个细胞
研究结论:该研究描述了高氧暴露的多个方面,并确定了作为支气管肺发育不良的潜在药物靶点 的病理路径-方式
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文献和实验提到单细胞测序,相信各位小伙伴们都很熟悉,真是又爱又恨的一个技术啊,爱它既能帮助我们解决很多科研问题,同时也是对它的价格暗暗咬牙;大家莫慌,今天小编就给大家一个神器——单细胞混样测序,让大家用小经费就能轻轻松松发表5分左右的文章。 单细胞Mix(混样)测序产品是基于10x Genomics和BD Rhapsody平台,利用寡核苷酸偶联的抗体孵育不同的样本,为不同的样本标记上不同的标签,然后将多个样本混合在一起,按照单一样本文库制备的流程,进行一次建库操作,然后上机测序,实现多样本混样
的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
样本制备能力,如下图所示的一些冻存样本的核悬液制备结果: 单细胞核测序初步质控结果 单细胞核测序UAMP降维结果 吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累,建立的标准化 、工程化 、系统化的GRP平台,为中国研究型医生提供科研服务,加快科研成果转化,其中,单细胞测序拥有10x和BD两个平台,提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞(RNA+ATAC)、空间转录组测序等服务。
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