巨噬细胞膜电位去极化模型的建立与验证
探究膜电位去极化对炎症巨噬细胞的影响
使用 elevated [K+]e(50 mM)或gramicidin(1.25 μM)处理LPS刺激的腹腔巨噬细胞,通过全细胞膜片钳或DiBAC4(3)测量膜电位,并进行RNA-seq和代谢组学分析。
Kir2.1-mediated membrane potential promotes nutrient acquisition and inflammation through regulation of nutrient transporters.
包含体外巨噬细胞模型、基因敲除小鼠、体内脓毒症模型及人类样本,并有功能验证和机制验证
小鼠腹腔巨噬细胞 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) Lyz2-cre-Kcnj2f/f小鼠 人痛风患者滑液细胞
LPS处理浓度500 ng/ml,处理时间6小时(部分实验2小时) ML133使用浓度25 μM elevated [K+]e浓度50 mM gramicidin使用浓度1.25 μM 体内LPS注射剂量25 mg/kg或20 mg/kg,ML133剂量30 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究膜电位去极化对炎症巨噬细胞的影响
使用 elevated [K+]e(50 mM)或gramicidin(1.25 μM)处理LPS刺激的腹腔巨噬细胞,通过全细胞膜片钳或DiBAC4(3)测量膜电位,并进行RNA-seq和代谢组学分析。
确定调控巨噬细胞膜电位的生理性调节因子
通过RNA-seq比较K+通道表达,使用ML133(25 μM)或Lyz2-cre-Kcnj2f/f小鼠巨噬细胞,进行膜片钳记录和炎症基因qPCR分析。
验证Kir2.1介导的膜电位是否影响营养摄取和代谢重编程
使用ML133或Kir2.1缺陷巨噬细胞,进行代谢组学、ECAR测量、葡萄糖摄取实验和13C标记代谢流分析。
探究Kir2.1是否通过SAM影响表观遗传修饰
测量SAM水平,使用13C标记追踪,补充外源SAM,进行ChIP-qPCR检测H3K36me3在炎症基因位点的富集。
阐明Kir2.1调控营养转运蛋白表面表达的机制
使用流式细胞术和免疫印迹检测GLUT1和4F2hc表面表达,进行膜蛋白生物素化、内化实验、PIP2聚类分析和SopB表达 rescue 实验。
评估Kir2.1在体内炎症模型中的作用
使用LPS诱导的脓毒症模型和细菌感染模型,给予ML133或使用Lyz2-cre-Kcnj2f/f小鼠,检测血清细胞因子和生存率。
验证Kir2.1在人类炎症疾病中的相关性
分析脓毒症患者单核细胞转录组数据,使用痛风患者滑液细胞检测ML133对IL-1β产生的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | -- | |
| 药物处理 | 大肠杆菌O111:B4脂多糖 | Sigma | -- |
| ML133 | Selleck | -- | |
| 短杆菌肽 | MedChemExpress | -- | |
| PA-6 | MedChemExpress | -- | |
| Tram-34 | MedChemExpress | -- | |
| PAP-1 | MedChemExpress | -- | |
| 代谢示踪 | U-[13C]-葡萄糖 | Cambridge Isotope Laboratories | -- |
| U-[13C]-丝氨酸 | Sigma | -- | |
| 葡萄糖摄取检测 | 2NBDG | Cayman | -- |
| 内吞抑制 | 制霉菌素 | Sigma | -- |
| 细胞处理 | 细胞通透性二甲基2-氧戊二酸 | 9 Ding Chemistry | -- |
| Western blot | pro-IL-1β抗体 | R&D systems | AF-401-NA |
| 抗Kir2.1抗体 | Proteintech | 19965-1-AP | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4814 | |
| 抗磷酸化Erk抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗Erk抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9255 | |
| 抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 抗磷酸化P38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511 | |
| 抗P38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690 | |
| 抗磷酸化AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 抗AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| ChIP | 抗H3K36me3抗体 | Cell Signaling Technology | 4909 |
| Western blot | 抗LC3B抗体 | ABclonal | A19665 |
| Western blot/流式/免疫荧光 | 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 |
| 免疫荧光 | 抗PIP2小鼠单克隆抗体[2C11] | Abcam | ab11039 |
| Alexa Fluor 647标记的山羊抗小鼠IgG二抗 | Abcam | ab150115 | |
| 流式细胞术 | PE标记抗小鼠4F2hc抗体 | Biolegend | 128207 |
| APC/Cyanine7标记抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 103115 | |
| PE/Cyanine7标记抗小鼠/人CD11b抗体 | Biolegend | 101215 | |
| APC标记抗小鼠F4/80抗体 | Biolegend | 123115 | |
| APC标记抗小鼠Ly-6C抗体 | Biolegend | 128015 | |
| 免疫荧光 | 抗4F2hc抗体 | Proteintech | 15193-1-AP |
| Western blot | 抗β-actin抗体 | HuaBio | M1210-2 |
| HRP标记抗兔IgG二抗 | HuaBio | HA1001 | |
| HRP标记抗小鼠IgG二抗 | HuaBio | HA1006 | |
| HRP标记抗山羊IgG二抗 | HuaBio | HA1005 | |
| 免疫荧光 | DyLight549标记山羊抗兔IgG二抗 | MultiSciences | 70-GAR5492 |
| DyLight488标记山羊抗兔IgG二抗 | MultiSciences | 70-GAR4882 | |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9005 |
| ELISA | IL-1β和IL-6 ELISA试剂盒 | ThermoFisher | -- |
| IL-1α ELISA试剂盒 | DAKEWE | 1210112 | |
| PIP2定量 | PI(4,5)P2 Mass ELISA试剂盒 | Echelon | K-4500 |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Pall | 28637358 |
| ECAR测量 | Seahorse XF96分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| 无酚红XF基础培养基 | Agilent Technologies | 103335-100 | |
| qPCR | RNAiso Plus试剂 | Takara | -- |
| HiScript II逆转录酶 | Vazyme Biotech | -- | |
| SYBR Green | Vazyme Biotech | -- | |
| CFX96 Touch实时PCR仪 | BioRad | -- | |
| 外周血单核细胞分离 | Ficoll-Paque PLUS | GE Healthcare | -- |
| 流式细胞术 | BD Fortessa多色流式细胞仪 | BD | -- |
| ACEA NovoCyte流式细胞仪 | ACEA | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM 800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 巨噬细胞膜电位去极化处理 | elevated [K+]e浓度50 mM;gramicidin浓度1.25 μM;LPS浓度500 ng/ml;处理时间6小时(部分实验2小时) 阅读提示:Methods中“Membrane potential assessment by FACS”和“Electrophysiology”部分,以及Fig. 1图注 |
| Kir2.1抑制或敲除 | ML133浓度25 μM;Lyz2-cre-Kcnj2f/f小鼠基因型;对照Kcnj2f/f小鼠 阅读提示:Methods中“Mice”和“Reagents”部分,以及Fig. 2图注 |
| 体内脓毒症模型 | LPS剂量25 mg/kg(细胞因子检测)或20 mg/kg(生存率分析);ML133剂量30 mg/kg;注射途径腹腔注射;检测时间点4小时(细胞因子)或生存率分析 阅读提示:Methods中“In vivo LPS challenge”部分,以及Fig. 7图注 |
| 细菌感染模型 | 细菌种类Escherichia coli和Salmonella typhimurium(SL1344);感染量体内1×10^7,体外5×10^6;ML133剂量30 mg/kg(体内)或25 μM(体外);检测时间点6小时 阅读提示:Methods中“Bacterial infection”部分,以及Fig. 7图注 |
| 人类样本实验 | 痛风患者滑液细胞;LPS浓度100 ng/ml;ML133浓度文中未明确说明;处理时间12小时 阅读提示:Methods中“Patient-derived samples”部分,以及Fig. 7图注 |