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问
大分子WB的信号如何跑好?
邓豆豆逗
可以配置8%的分离胶跑,转膜可以考虑300mA恒流40min 做好降温,同时可以提高上样量和抗体浓度
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问
蛋白加Loading煮了以后变色会影响实验吗?
bqejjh123
你的样品有什么特别的成分,一般Loading加进去变红是因为样品太酸,加入2ul氢氧化钠即可,如果样品沉不下去,适当加些甘油增加密度。
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问
提取的核蛋白wb条带多条带怎么办?
邓豆豆逗
提取的核蛋白可以做一下GAPDH看看,如果能检测到条带,说明提取的核蛋白不纯,存在胞质蛋白的污染,可以考虑碧云天的核质分离试剂盒
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问
请问怎么高效地提取膜蛋白?
dxywode
使用离心管柱分离技术起始材料仅需 undefined107 个细胞,即可将细胞 / 组织分离为细胞浆,细胞核,细胞器和质膜组分。 离心管柱带有特定孔径和表面性质,当细胞通过离心管柱,细胞膜被破裂分离出完整的细胞核,随后通过差速离心和密度离心分离出质膜蛋白,无需使用超高速离心。
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问
求再做WB实验时,最后跑出来两条清晰的条带,可能的原因有哪些呢?
未来9
有可能是同一个蛋白的磷酸化与为磷酸化的形式,分子量很接近!或者是甲基化等等!
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问
我的条带很浅显不出来怎么办?分子量也不小大约26kda
dxywode
转膜条件是否合适,先需要确定蛋白成功转至膜上一抗和二抗的比例,是经过尝试的么,有没有提前在ELISA上验证反应性。曝光显色试剂是否失效,尽量使用新鲜有效的。
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问
ChIP实验中最关键的结果是什么?什么样的富集倍数被认为是阳性的结果?
whilt-shirt
染色质免疫共沉淀(ChIP)实验本身其实就是一个通过免疫沉淀反应验证蛋白与DNA相互作用的实验。因此结果一般包括两个数据:免疫沉淀的效率(富集效率), 蛋白与DNA结合能力(富集倍数)。但是这两个结果本身都是一个相对值,因为富集效率就是断裂后的染色质分成两部分,一部分进行免疫沉淀,一部分作为对照不进行免疫沉淀,然后两者进行比较,得到一个百分比。富集倍数就是取两个抗体进行免疫沉淀,一个是特异性的抗体
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问
每次用配好的胶,跑胶电泳时,跑出的maker为什么总是歪歪扭扭的?
未来9
可能是边缘效应,两边的胶有可能没凝固好,或者是两边胶不匀而引起的,可以上样时留出两边的孔。
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问
WB跑电泳时候,肉眼可见蓝色的loading不在一条线上是为什么?是因为胶配的不好吗?
未来9
样品处理问题吧?有时制胶不好也可以,有时是电泳液的原因不一定会影响最终的结果吧
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问
WB实验,同一个样品,上样体积都一样,但在不同的孔上样,显影后,每个孔的灰度值却不一样。最左边的孔显影出来的灰度值总是最浅的。
邓豆豆逗
转膜效率不一致,可以更换海绵和滤纸,同时将胶和膜尽可能的放正中间;或者孵育一抗或二抗时膜的一端有翘起来或者贴在孵育盒上了,导致抗体孵育不充分,从而导致边上条带偏淡。
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问
10%的胶,恒压80V跑浓缩胶,120V跑分离胶,120V转膜2小时
sing生物狗
其实这个是胶的原因可能性大,建议充分混匀,跑的电压应该没问题的
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问
为什么wb条带的位置和kd值不一样
未来9
首先,SDS-PAGE电泳时分子量marker不能作为绝对标准,只是一个参考值。其次,有的蛋白(如组蛋白和一些易形成dimer的蛋白,还有一些比较难变性而又形成紧凑的球形结构的蛋白)在用常规方法电泳时会出现异常行为(表观分子量与实际分子量不符)。以前对于这个问题,似乎听实验室的师兄说,SDS-PAGE鉴定表达的外原蛋白,分子量和Marker有一定的出入,一般在10kD左右浮动还是可以接受的,也许就
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问
切分子量大的比如280的怎么避免歪歪扭扭,配胶注意点?
whilt-shirt
选择6%的SDS-PAGE胶跑蛋白,增加转膜时间和转膜电流
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问
实验中漏胶一般是什么引起的,怎么解决
sing生物狗
有可能是架子用的时间久了就会松,可以在上面夹一个1ml的枪头
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问
测定蛋白质含量用考马斯亮蓝法更好些还是酚试剂法更好些?为什么?
bamboopiggy
两个方法都可以,但是酚试剂步骤更简单一些。
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问
本人纯化his标签蛋白,无论如何更换表达感受态和诱导条件,蛋白表达量都很低是什么原因?使用载体为32a,和28a都不理想
天一湖医者
a可能原因:超声功率不合适(太大,蛋白碳化,太小,蛋白没完全释放)解决方法:改变超声功率或者其它方法破碎细胞。b.样品或缓冲液不合适解决方法:确保缓冲液中螯合剂,还原剂,咪唑浓度不是很高。c.His标签暴露不完全解决方法:在缓冲液中加变性剂(4-8M尿素,4-6M盐酸胍),然后用IMAC介质纯化。d.His标签丢失解决方法:必要时增加His的个数并确保正确表达,同时降低上样速度,确保足够的孵育时间
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问
bca定量总蛋白一致 内参tubulin不一致
邓豆豆逗
更换内参再试试,如果差异还是很大,说明定量结果不准,只能根据条带亮度进行上样量的调整了。(bca定量结果只能作为参考,不能作为你内参一致的依据)
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问
western blot实验条带颜色整体都很深,是什么原因造成的?做完了还能再改进么?
邓豆豆逗
可能原因有很多,你可以逐个排查:1.封闭时间不够或封闭液不行,建议用5%脱脂奶粉封闭,封闭时间至少1h;2.洗液被污染或一抗和二抗洗涤不充分,建议更换新鲜洗液,同时延长洗涤时间和次数,比如增加到5次,每次5mim;3.ecl发光液是超敏ecl,可以用tbst稀释一下或者用普通ecl曝光;4.pvdf膜被污染,操作过程中一定不能用手碰到膜,很容易粘上脏东西被污染;5.如果是组织提取蛋白做实验的话,可
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问
为什么其他方式能验证出两个蛋白之间有相互作用,用Co-IP却没有验证出来?
whilt-shirt
首先确定两个蛋白到底有没有相互作用。可以结合酵母双杂交,LUC或者其他的实验结果。在其他实验验证有互作的情况下,调整COIP 条件。看来你的步骤,其中孵育的时间两个overnight,太长了如果某个蛋白不稳定你这两三天的实验蛋白就降解了,加抗体后2h,加proteinG beads再4h就可以了,不需要太久。另外完全可以适应标签抗体偶联好的商业化Flag beads or HA beads, 这样
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问
ChIP实验研究转录因子,调控因子结合的DNA和组蛋白结合的NDA操作上最大的区别是什么?
whilt-shirt
实际操作上就是转录因子的必须要用甲醛固定,组蛋白看情况,在组蛋白表达的多的情况下可以不使用甲醛进行固定。其余过程就是解交联的时间,组蛋白要适当的增加解交联的时间。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行
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