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qPCR实验重复性问题
天一湖医者
是的,首先qPCR不是很准,特别是对于新手来说。其次,三个平行以上才具有统计学意义,三个生物学重复以上才具有生物学意义。(发表文章时需要)最好能够设置3个复孔,同样的实验再重复3次以上才有可信度.不同的孔之间的差异不要大于0.4-0.5为有效,否则肯定是加样过程出了问题.
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问
质粒酶切后的回收可以不跑胶直接PCR回收吗?
迟C迟
不可以,直接PCR产物回收的有好几种片段,不是你要的目的片段,会降低后续实验准确性。
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问
如何快速地锁定Meta分析的矛盾点?
天一湖医者
参考下这个,讲的很详细,https://baijiahao.baidu.com/s?id=1730794819467226100&wfr=spider&for=pc&searchword=%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%BF%AB%E9%80%9F%E5%9C%B0%E9%94%81%E5%AE%9AMeta%E5
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问
有没有一款软件可以分析多重荧光定量pcr的引物是否会相互干扰及量化干扰程度?
Eason老歌迷
有的,可以参考https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
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问
求助,半定量PCR的问题
bamboopiggy
半定量PCR是首先通过确定目标物PCR有限扩增至最大值的最低循环数,进而比较不同样品之间该目标物的PCR扩增产物数量,以此确定样品中目标物的相对数量。也就是说是一个相对值,不是绝对含量。至于第二个问题,完全一样的操作,并不代表完全一样的模版都加进去了,每加一次样,都可能存在误差,甚至没有吸到液体。
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问
PCR实验引物设计有什么要求?TM值一般多少最合适?
汤姆卜丽波
1、引物长度一般在15-30bp。常用的为18-27bp,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应;2、引物GC含量一般为40%-60%, 45-55%为宜,GC含量过高或过低都不利于引发反应,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近,一般Tm值不超过 5℃。3、引物所对应的模板序列的Tm值在55-80℃之间,最好为 72℃左右。4、引物的延伸是从3′端开始的,不能进行任
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问
Pcr模板加的量太多会导致产物多条带,且不亮吗
bamboopiggy
按照你的酶的说明书来加pcr模板的量,加多了,会产生非特异性结合,产物条带多,且不特异。
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问
PCR程序设定是根据什么来的?
shanshan2113
pcr程序设定取决于:1.扩增酶的类型,决定变性温度,扩增效率等;2.扩增引物,决定退火温度;3.目的片段大小,决定延伸时间。
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问
定下引物的Tm值范围之后即可定下引物的长度范围吗?
shanshan2113
引物Tm值与引物序列GC含量有关,确定Tm值后,若GC含量高,则引物短,GC含量低,则引物长。
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问
难道引物会突然不适用了吗
balalaLy
引一般引物稀释后保存在-20可以用挺久的,4度的话可能超过一个月就不敢保证了
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问
rtPCR,药物、对照组设置问题
balalaLy
对,一块96孔板可以跑完。每个指标要分开,不能mix。如果你加样熟练手很稳的话,可以只做2个副孔。
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问
为什么血型糖蛋白SDS-PAGE电泳时跑得慢?
bamboopiggy
糖基化会影响糖蛋白的预期大小,从而导致其再SDS-PAGE胶中的位置与分子量不一致。血型糖蛋白30000分子量,而红细胞带3蛋白分子量约 95,000~100.00,但是由于糖基化的存在,使得血型糖蛋白的电荷/摩擦系数与带3蛋白接近,所以出现在带3蛋白附近。
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问
类器官药敏实验复孔间结果数据频繁差异巨大,考虑原因为类器官大小各异复孔间细胞数差异过大,请教改善方法
天一湖医者
类器官药敏实验复孔间结果数据频繁差异巨大。立体微小组织块培养法成功率高、成本低、出结果快,但样本量极其有限,无法设置复孔求均值数据随机性误差大,无法区分混在癌组织中的正常细胞;PDX能保持人肿瘤原有的组织形态和生物学特性,准确性较高,但动物实验本身会受体内多种不可控因素的制约,接种成功率低、周期长、成本高,且无法实现高通量药筛;类器官技术成本居中,2-3周出结果,能模拟肿瘤细胞3D模式下的生存和增
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问
请问为什么提取RNA的时候最后没有看到羽毛状沉淀呢?
bamboopiggy
可能你rna的浓度有点低,所以并且那个沉淀是透明的,如果太小了,你可以能看不到,没事,能用就好
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问
地贫基因gapPCR电泳条带有粗、细,与标本浓度有关?
棋NKKP
不仅与浓度有关,与样品的质量,胶的质量,核酸染料甚至是电泳条件都有关
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问
最近酶切连接转化后一直没菌落,一般问题出在哪
棋NKKP
这个涉及的就比较多了,可能载体构建时设计的问题,或者筛选的条件不合适,或者培养条件不合适,或者感受态转化效率低,可以考虑设置对照去检查自己的实验体系
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问
可以用于 DNA 差异筛选杂交的探针有哪些?
bamboopiggy
杂交探针是核酸分子上带有可能被检测的信号分子,如同位素或荧光标记的核酸分子。双链DNA加热变性成为单链,随后用放射性同位素(通常用磷-32)、萤光染料或者酶(如辣根过氧化物酶)标记成为探针。磷-32通常被掺入组成DNA的四种核苷酸之一的磷酸基团中,而荧光染料和酶与核酸序列以共价键相连。分为cDNA探针,基因组DNA探针,寡核苷酸探针,RNA探针。
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问
PCR过程中提取试剂1底物添加对实验过程影响多少?
whilt-shirt
你这个不太好回答,试剂1都不知道是什么
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问
用NEB的BpuEI酶1ul,切1ug的质粒失败,多加酶也不行,是酶量不够?应该用多少计量?
棋NKKP
酶切体系商业化很稳定,首先要确定自己的酶切位点是不是正确
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问
质粒构建中遇到的问题?
棋NKKP
在基因前插入要考虑移码突变的发生,而且不仅仅这一种会导致最终的不表达,还有很多原因
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