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科研学霸天团,48小时有问必答
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问
怎样根据蛋白分子量配分离胶和浓缩胶浓度??
府宅
根据目的蛋白的分子量大小选择合适的凝胶浓度,再按照下面的表格配制:
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问
染色后可以用自动细胞计数器计数吗?
whilt-shirt
可以,染色只是区分活细胞和死细胞,不影响计数
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问
western做p-AMPK和AMPK时,是先把一种抗体洗脱了再敷另一个,还是可以平行着分别做?
dxy_gwrp7ndq
如一抗种属来源不一致,即使分子量接近的蛋白,只要洗脱够彻底,也不会产生多条带,就可以一起做。
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问
6.5%的EMSA 胶为什么100V跑一个半小时才能跑到1/2,理论上不应该半小时就跑到吗
dxy_gwrp7ndq
可能是电泳环境的问题,一般电泳大约50-60min,可以根据实际情况调整电泳时间及电压,而且电泳时间不宜过长
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问
想用荧光抗体对组织免疫染色,能染出梯度吗?如何对梯度分布的分子进行染色?
天一湖医者
可以的,通过调控镜片在染色液里上下运动的时间的方法进行。
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问
coip实验中从免疫磁珠上洗脱相互作用的蛋白时,怎样才能只洗脱下来相互作用的蛋白,而不将磁珠上的抗体也洗脱下来?有专门的洗脱液吗
天一湖医者
可在洗脱之前加一步水洗,也可以有效降低洗涤液残留对磁珠洗脱效果的干扰。
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问
western blot,最后显影不特异,怎么办。
vae1476
没有特异条带吗?那考虑样本没问题的话,最可能出问题的是一抗,一抗的特异性决定了结果的特异性
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问
IHC-P,IHC-Fr和IHC-Fl切片固定条件(浓度,温度,时间等)和注意事项有哪些?
丁香粉猪猪
对组织浸蜡时,一般选用56℃~58℃熔点的石蜡,浸蜡温度最好不超过60℃,防止抗原的损失。
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问
ChIP实验中最关键的结果是什么?什么样的富集倍数被认为是阳性的结果?
whilt-shirt
染色质免疫共沉淀(ChIP)实验本身其实就是一个通过免疫沉淀反应验证蛋白与DNA相互作用的实验。因此结果一般包括两个数据:免疫沉淀的效率(富集效率), 蛋白与DNA结合能力(富集倍数)。但是这两个结果本身都是一个相对值,因为富集效率就是断裂后的染色质分成两部分,一部分进行免疫沉淀,一部分作为对照不进行免疫沉淀,然后两者进行比较,得到一个百分比。富集倍数就是取两个抗体进行免疫沉淀,一个是特异性的抗体
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问
ChIP实验中DNA的检测在什么情况下用PCR反应?什么情况下用测序?
dxywode
ChIP实验中,当检测已知蛋白结合的DNA序列的时候,可以使用PCR反应进行检测,因为你可以根据已知的DNA序列,取设计引物,然后进行扩增,看能不能将DNA扩增出来。扩增出来了,就证明你成功的使用抗体将目的基因富集下来。当你不知道结合蛋白所对应的DNA序列时,就要通过构建文库以后,进行测序,然后知道富集下来的DNA序列。
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问
western目的条带上方还有一条稍细的条带,这种图片能否用于发文章?
丁香粉猪猪
抗体是不是回收重复利用的?重复利用的抗体效价会降低。2.样品是不是放的时间长了?蛋白有些降解,建议重新取样。若不是,可以用以前的样品做个阳性对照。看是否也是这样。3.杂一抗前用5%的脱脂奶粉封闭30min,可以降低背景和杂带。
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问
ChIP实验中需要选择ChIP级别抗体,没有ChIP级别抗体该怎么选择?如果我的实验种属比较特殊(果蝇,昆虫,植物等)该怎么选择
vae1476
实在没有的话,可以联系公司订制,但时间比较长,急的话,可以拿IP/IHC/ICC级别的抗体进行尝试
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问
ChIP实验中使用超声方法断裂染色质温度不易控制,可能会使蛋白变性,影响ChIP结果,有没有较好的优化方案?
dxywode
目前,市面上有很多打断仪器是可以持续控制温度在指定温度的。也就是说可以将温度控制在一个比较冷的环境中,这样可以减少你所说的蛋白质变性的可能。同时在打断时可以选择间断循环打断。就是可以减少打断的时间,增加打断的循环数,从而达到同样的打断效果和降低蛋白变性的可能性。
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问
跑western条带总是中间浅、两侧深的原因是什么?
whilt-shirt
是不是转膜没夹紧导致的,尝试更换新的转膜滤纸
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问
蛋白质分离纯化,用什么方法最好?
丁香粉猪猪
一、常用的破碎组织细胞的方法有: 1.机械破碎法 这种方法是利用机械力的剪切作用,使细胞破碎。常用设备有,高速组织捣碎机、匀浆器、研钵等。 2.渗透破碎法 这种方法是在低渗条件使细胞溶胀而破碎。 3.反复冻融法 生物组织经冻结后,细胞内液结冰膨胀而使细胞胀破。这种方法简单方便,但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。 4.超声波法 使用超声波震荡器使细胞膜上
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问
酶联免疫吸附试验是敏感性很高的一项技术实验,实验过程有哪些需要注意的?与其他实验相比有什么优点?
府宅
注意事项:1.可溶性抗原或抗体吸附于固相载体而成为不溶形式,这是进行酶标记测定的基本条件。许多物质可作为固相载体,如纤维素、交联右旋糖苷、聚丙烯、聚乙烯及聚氯乙烯等等。但在ELISA中常用的是聚苯乙烯或聚氯乙烯微量反应板及塑料管。2.包被所用的抗原必须是可溶性的,而且要求是优质和稳定的制剂,纯度和免疫原性要高。如果不纯,由于抗原中所含杂质就会竞争固相载体上的有限位置,降低敏感性和特异性。此外还应考
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问
为什么我的细胞提取液中没有目标蛋白?
邓豆豆逗
可能细胞表达量较少检测不到,建议换大皿培养,增加上样量,或者抗体浓度,还有可能确实没表达,重新诱导,同时用流式,elisa等同时检测
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问
湿转转膜时间与蛋白大小有没有必然联系呢?
迟C迟
有关系的,转膜时间太长,小蛋白会从膜中穿过。
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问
蛋白结构探索,什么是蛋白
小布丁瑶瑶
蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子,蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。所有蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成的多聚体,在形成蛋白质后,这些氨基酸又被称为残基。蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰,有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为,若残基数少于40,就称之为多肽或肽。要发挥生物学功能,蛋白质需要正确折叠为一个特定构型,主要是通过大量的非共价
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问
怎么确定上样量呢?怎么计算?为什么WB条带会跑歪,那怎么处理呢?
府宅
这要根据你做的蛋白表达量多少,一般是用DAB显色要50-100μg,用ecl曝光上样量为20-40μg。但根据你蛋白表达量的不同目标蛋白绝对量DAB法至少50pg,ecl法至少20pg。
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