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琼脂糖凝胶电泳拖尾的原因,用的是KOD酶预混mix做PCR,以前能跑出清晰条带,现将试剂都尝试换了遍,都没改善

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alirgnahs

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6 个回答

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dxy_oeu11rar

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不知道marker是不是也有拖尾现象,如果marker正常,有可能是你的模板浓度太高。如果marker不正常,排查一下琼脂糖凝胶和缓冲液的问题,buffer不正确也可能产生拖尾

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汤姆卜丽波

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是不是配的胶没混匀,marker跑的怎么样

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bamboopiggy

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考没考虑过你模板的问题?或者是你胶没融好?

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天一湖医者

有帮助

电泳出现拖尾现象,英文成为smear,就是弥散.其原因,主要从以下两个方面考虑:

1、PCR产物自身原因:

往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物 过多.

对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶.②减少dNTP的浓度.③适当降低Mg2+浓度.④增加模板量,减少引物的用量 ,减少循环次数,提高退火温度.

2、电泳体系的问题:

(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液.(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样.(3)电压太高.(4)适当把你的胶的浓度加大.(根据你的片断大小而定)

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balalaLy

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上样量大了?

pcr模板量降低些?

退火温度调高试一下,看是不是非特异结合

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未来9

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PCR产物出现拖尾的因素有很多,总结为一条,就是非特异性扩增过多。原因可能是:
(1) 模板不纯:纯化模板
(2) Buffer不合适:更换Buffer
(3) 退火温度偏低:适当提高退火温度
(4) 酶量过多:适量用酶,或调换另一种酶
(5) dNTP、Mg2+浓度偏高:适当降低dNTP和镁离子的浓度
(6) 循环次数过多:减少循环次数
(7) 模板量少或引物量过多:增加模板量,减少引物的用量
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