RNAi相关的术语

互联网2013-08-27

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1.RNAi ：(RNA interference)RNA干扰

一些小的双链RNA可以高效、特异的阻断体内特定基因表达，促使mRNA降解，诱使细胞表现出特定基因缺失的表型，称为RNA干扰(RNA interference，RNAi ，也译作RNA干预或者干涉)。它也是体内抵御外在感染的一种重要保护机制。

2.siRNA ：(small interfering RNAs)小干扰RNA

一种短片断双链RNA分子，能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的mRNA，这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference pathway)。

3.shRNAsRNA-Short hairpin RNAs)短发夹RNA

是设计为能够形成发夹结构的非编码小RNA分子，短发夹RNA能够通过RNA干扰来抑制基因的表达。Thomas Rosenquist's group和Greg Hannon's group联合研究了在哺乳动物种系细胞中shRNAs的转移导致基因长时间稳定沉默的机制。

4.bpBase Pair)碱基对

两个碱基(A和T，或者C和G)之间靠氢键结合在一起，形成一个碱基对。DNA的两条链就是靠碱基对之间的氢键连接在一起，形成双螺旋结构。

5.Base sequence:碱基序列

DNA分子中碱基的排列顺序。

6.Base Sequence Analysis:碱基序列分析

分析出DNA分子中碱基序列的方法(这种方法有时能够全自动化)

cDNA：参见互补DNA。

7.cDNA：互补DNA

以信使RNA为模板合成的DNA，常常采用互补DNA的一条链作为绘制物理图谱时的探针。

8.Complementary sequence：互补序列

以一条核苷酸链为模板，根据碱基互补规则形成的互补链，称为该模板的互补序列。

9.Genomic Library：基因组文库

对某个染色体，制备随机产生的、相互之间有重叠部分的片段的克隆。

10.RISC：(RNA-induced silencing complex)RNA诱导沉默复合物

在RNAi 效应阶段，siRNA双链结合一个核酶复合物从而形成所谓RNA诱导沉默复合物。激活RISC需要一个ATP依赖的将siRNA解双链的过程。激活的RISC通过碱基配对定位到同源mRNA转录本上，并在距离siRNA3'端12个碱基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。尽管切割的精确机制现在还是未知，研究表明每个RISC都包含一个siRNA和一个不同于Dicer的RNA酶。

11.Dicer：Dicer酶

RNaseIII家族中特异识别双链RNA的一员，能以一种ATP依赖的方式逐步(processive)切割由外源导入或者由转基因、病毒感染等各种方式引入的双链RNA，切割将RNA降解为19—21bp的双链RNAs(siRNAs)，每个片断的3'端都有2个碱基突出(27, 28)。

12.PTGS：(Post-transcriptional Gene Silencing ,PTGS)转录后基因沉默

部分的植物中的基因沉默是在转录后发生的。它是相对于部分植物中发生的转录阶段的基因沉默(TGS)而言的。

13. TGS：(transcriptional gene silencing)转录阶段基因沉默

14.gene silence:基因沉默

研究结果发现有大量的转基因植株不能正常表达，通常这并不是由于转基因的缺失或突变引起的，而是基因失活的结果.这种失活的现象称为基因沉默。

15.RNA transfection：RNA转染。

16.Sense RNA：正义链RNA

17.Antisense RNA：反义链RNA。

18.19 2 2 nt siRNA：

在细胞中双链RNA一般都被切割成21-23小片段，这样的RNA片段能达到更好的RNAi 作用。人工合成的siRNA也是依据这个原理，所合成的RNA就是19nt的碱基序列再加上两端的识别序列如-GG，-TT等。