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物种的De novo测序与基因组重测序
物种的Denovo测序与基因组重测序
虽然无法与Sanger法850bp的读长相比，新一代测序的读长也在稳步提高，Roche的新一代测序平台454目前读长是400bp,使其在基因组的从头测序上占很大优势,但需要传统Sanger法的协助。Paired-End技术使其在文库构建时能够跨越3Kb的重复区，从而对复杂基因组特别是含有高度重复序列的植物基因组进行多态性分析的提供了一条技术路线。另外，其发现基因和结构变异的能力远远高于传统的Sanger法，这一点在基因诊断技术在医学上的应用显得非常重要。目前，第二代测序仪包括454和SOLEXA在基因组测序上已经被广泛证实，2007年van Orsouw等人结合改进的AFLP 技术和454 测序技术对玉米基因组进行了重测序，该重测序实验发现的超过75%的SNP位点能够用SNPWave技术验证，表明了其在复杂基因组特别是含有高度重复序列的植物基因组进行多态性分析上的优势。2008年Hillier对线虫CB4858 品系进行Solexa重测序，寻找线虫基因组中的SNP位点和单位点的缺失或扩增。
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文献和实验qiangshou2010 我想问个这几天一直想不明白的事情。 现在人类基因组测序早就完成了，也开始了其它物种的测序，包括猴子---恒河猴，rhesus,这几天我查了猴子的几个基因，发现在它的序列里包括了一部分的N。这些N表示什么意思呢？是当时没有测出来？还是不能找到合适的样本，才测不出来的？ 在哪里可以查到序列完全测出来的物种呢？就拿猴子来说，哪种猴子的序列是测全了的呢？ zhujoker
《科学》：我国完成桑蚕大规模基因组重测序 并绘制完成世界第一张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱 北京时间8月28日凌晨2时，由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表，这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。该研究由中国工程院院士、著名蚕学家向仲怀教授带领完成；西南大学教授、中国家蚕基因组主要攻关专家夏庆友为论文第一作者。 据悉，科学家共获得了40
海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因，但是表型（药敏试验仍对该类抗生素敏感）阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序，想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢？ zhujoker 我来胡说2句吧，不知道细菌基因组有没有甲基化修饰，自己不做细菌，所以不能确定（但是偶刚才查一下的确好像
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