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康测科技
绝对定量转录组测序
这些RNA各自具有不同的生物学功能,为了研究这些RNA的功能,目前发展出了多种测序技术对其表达进行检测。
测序类型 | mRNA-seq | lncRNA-seq | sRNA-seq | circRNA-seq |
技术方案 | polyA捕获 | rRNA剔除 | 连接富集 | 去除线性RNA |
检测对象 | mRNA pre-mRNA(部分) lncRNA(部分) |
mRNA pre-mRNA lncRNA circRNA(部分) |
miRNA siRNA piRNA(部分) |
circular RNA |
KC-digital RNA-seq绝对定量UMI测序技术
为了解决现有RNA相关测序技术的技术难点,获得更准确的表达数据,康测科技开发出“绝对定量测序”技术。
该技术在文库扩增之前为每一条逆转录的cDNA片段加上唯一的身份标签(Unique Identifier,UMI),也称为数字标签,数字标签会伴随片段扩增、测序、分析的全过程。
左图:使用普通RNA建库试剂盒对同一个样品在不同扩增条件下获得的基因表达的一致性;
右图:使用KC-digitalRNA建库试剂盒对同一个样品在不同扩增条件下获得的基因表达的一致性。
KC-digital RNA-seq带来更高的qPCR验证结果
选择48个差异表达基因进行qPCR验证,分析qPCR和测序结果的相关性
左图:普通RNA-seq与qPCR实验结果的比较;右图:KC-Digital RNA-seq与qPCR实验结果的比较;
KC-DigitalRNA-seq测序结果与qPCR结果更为相符,有更高的一致性。
部分客户文章(绝对定量转录组)
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