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microRAN原位杂交
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英拜
RNA原位核酸杂交(RNA nucleic acid hybridization in situ)又称RNA原位杂交(RNA in situ hybridization RISH)。该技术是指运用cRNA或寡核苷酸等探针检测细胞和组织内RNA表达的一种原位杂交技术。其基本原理是:在细胞或组织结构保持不变的条件下,用标记的已知的RNA核苷酸片段,按核酸杂交中碱基配对原则,与待测细胞或组织中相应的基因片段相结合(杂交),所形成的杂交体(Hybrids)经显色反应后在光学显微镜或电子显微镜下观察其细胞内相应的RNA分子。现在探针标记技术有生物素、碱性磷酸酶、辣根过氧化酶和荧光素。
microRNA原位杂交实验流程:
- 组织预处理:冰冻切片、石蜡切片、细胞爬片等样本取材、固定、切片。
- 脱蜡:石蜡切片在乙醇、甲醛中脱蜡。
- 蛋白k孵育
- 原位杂交
- 杂交后处理
- 杂交后显色
具体实验操作步骤
1、脱蜡:
1)xylene脱蜡3次,每次5min;
2)100%酒精两次,每次2min;
3)移出酒精,斜置切片,标记末段向下,空气干燥。
2、蛋白酶处理:
1)每个染色缸40ml蛋白酶K消化溶液,配制方法如下:2×SSC 40ml倒人Facal管,在水浴槽中预热。将消化酶液加入管内,摇动直到酶溶解。
2) 37℃水浴槽中预热染色缸和蛋白酶K溶液。37℃孵育20min。
3) ×SSC在室温下漂洗切片3次,每次1min。
4)梯度酒精脱水(-20℃预冷)。
3、变性:
1)每一个立式染色缸配制40ml变性溶液;
2)78℃水浴槽中平衡预热混合液染色缸;
3)78℃孵育8min;
4) 即移入-20℃预冷70%酒精的染色缸内2min,再依次移入80%、90%和100%的-20℃预冷酒精内,每缸2min;
5)空气干燥。
4、杂交:
1)准备探针;
2)取一个较大的湿盒,交叉放置切片;
3)滴10μl探针在切片的组织上,加盖玻片;
4)盖上湿盒盖,37℃孵育12h~16h。
杂交后的水洗:
5)镊子小心去除盖玻片;
6)43℃预热杂交后水洗溶液40ml水洗切片15min;
7)2×SSC(37℃)洗两次,每次10min;
8)切片放人染色缸的1×PBS内待检测,勿使切片干燥。
检测:
9)从1×PBS中取出切片,除去过多的水分,避免标本干燥。把切片放入湿盒内,同时处理4张切片。
10)每张切片使用30μl~60μl罗丹明抗-抗体或FITC卵白素,室温下孵育20min;
11)去掉塑料盖膜,把切片放入含1×PBS的染色缸。1×PBS室温下洗3次,每次2min。
扩增:
12)从1×PBS中取出切片,斜置切片使液体排出;
13)每张切片滴30μl~60μl抗-卵白素抗体,加塑料盖膜,室温孵育20min;
14)去掉塑料盖膜,把切片放人含1×PBS的染色缸。1×PBS室温下洗3次,每次2min;
15)从1×PBS中取出切片,斜置切片使液体排出;
16)每张切片滴30μl~60μl抗-卵白素抗体,加塑料盖膜,室温孵育20min;
17)1×PBS室温下洗3次,每次2min。
5、细胞核染色:
1)张切片加10μl~20μl DAPI,覆盖盖玻片并在室温下孵育2~5ml;
2)尽可能快的在荧光显微镜下观察或封闭盒内保存在-20℃冰箱。切片在染色之后1h内可以在显微镜下观察。
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文献和实验体异常的识别得益于二十世纪六十年代后发展起来的胰蛋白酶-姬姆萨染色和常规显带技术,使得常规筛查全基因组染色体异常和检测染色体核型改变成为可能。染色体显带是细胞遗传学分析技术中标准和常用的方法,但耗时且依赖于获得良好的分裂相,还难于分析复杂和隐匿的异常。 PCR或荧光原位杂交(FISH,fluorescent in situ hybridization)对染色体异常的检出依赖于引物或探针与模板的结合,因此较常规显带具有更高的特异性,是高通量检测染色体异常的敏感和特异的方法。
荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)
实验原理荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一门新兴的分子细胞遗传学技术,是20世纪80年代末期在原有的放射性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非放射性原位杂交技术。目前这项技术已经广泛应用于动植物基因组结构研究、染色体精细结构变异分析、病毒感染分析、人类产前诊断、肿瘤遗传学和基因组进化研究待许多领域。FISH的基本原理是用已知的标记单链核酸为探针,按照碱基互补的原则,与待检材料中未知的单链核酸进行异性结合,形成可被检测的杂交双链核酸
1. 实验目的 通过实验了解荧光原位杂交技术的基本原理和在生物学、医学领域的应用。掌握原位杂交技术的操作方法,熟练掌握荧光显微镜的使用方法。 2. 实验原理 荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一门新兴的分子细胞遗传学技术,是20世纪80年代末期在原有放射性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非放射性原位杂交技术。目前这项技术已经广泛
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