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RNA-seq测序

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      上海达为科生物科技有限公司

    • 服务名称

      RNA-seq测序

    品牌 其他品牌 产地类别 国产
    应用领域 医疗卫生,生物产业,综合

    RNA-seq测序,也叫转录组测序技术,其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来,以此来检测它们的表达水平。转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。

    RNA-seq测序,也叫转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等等,其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来,以此来检测它们的表达水平。

    RNA-seq测序原理及过程:

    转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。

    先将样品提取总RNA,在这之后,除去rRNA(对于真核生物,用带有Oligo(dT)的磁珠富集mRNA,对于原核生物,用试剂盒去除rRNA),向得到的mRNA中加入Fragmentation Buffer使其片断成为短片段,再以片断后的mRNA为模板,用六碱基随机引物(random hexamers)合成cDNA链,并加入缓冲液、dNTPs、RNase H 和DNA polymerase I 合成cDNA第二链,经过QiaQuick PCR试剂盒纯化并加 EB缓冲液洗脱经末端修复、加碱基A,加测序接头,再经琼脂糖凝胶电泳回收目的大小片段,并进行PCR扩增,从而完成整个文库制备工作,构建好的文库用Illumina HiSeq2000进行测序。

    服务内容:大数据分析,整体课题的分解,真实的实验数据,完整的实验报告及分析。

    公司位于上海长江软件园,实验室面积600多平方米。我们拥有专业的实验室、先进的实验设备和经验丰富的科研技术人员。公司目前具备较好的生物学、医学技术服务平台,能够为广大客户提供医学科研样本检测、合作研究、开发及生产服务。
     

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    • SLAM-seq给您的不仅仅是RNA-seq

      其序列和结构影响转录的延伸、暂停和停顿,以及发挥染色体修饰结合和增强子的作用。nascent RNA- seq方法旨在区分新近转录的RNA和其它RNAs,这些方法可以分为4类:溴尿苷(BrU)免疫共沉淀深度测序分析( BRIC-seq ),4sU-seq,瞬时转录组测序( TT-seq),代谢标记法(SLAM-seq)(图2)。                                                                                    

    • DNA测序仪:454测序

      454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了测序反应体积,节省了 试剂 。这样,454测序仪做到了以极其低廉的价格进行大规模平行测序反应。 它的测序规模之大、测序费用之低

    • RNA测序简介

      NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处,但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同,并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征,并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子

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