RNA-Seq 转录组测序

RNA-Seq，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，可以提供定量分析，检测基因表达水平差异。

技术优势
数字化信号：测序直接获得序列，无背景噪音，无交叉杂交；可鉴别序列间单个碱基的差异；
高通量：一次测序得到千万条以上的序列；
检测阈值宽：跨越6个数量级的宽检测阈值，从几个到数十万个拷贝精确计数；
良好的重复性：深度测序保证了抽样随机性，重复性非常好，无需重复实验；
高灵活性 ：依据客户需求，提供不同测序平台服务。

产品应用
医学上的应用方向——

农学上的应用方向 ——


研究内容
标准信息分析：
1. 基本数据统计：① 去除接头序列、低质量序列得到reads信息，② 样品相关性，③ 表达量分布，④ RNA分类；

2. 参考基因组比对；
3. mRNA鉴定；
4. mRNA定量分析；
5. mRNA差异表达分析（样本间、组间）；
6. mRNA表达/差异基因聚类；
7. mRNA差异基因GO分类、富集；
8. mRNA差异基因KEGG分类、富集。


Dr.Tom信息分析：

一）数据库注释
1. 转录因子注释（AnimalTFDB/PlantTFDB）；
2. GSEA分析；
3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释；
二）互作网络分析
1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向关系分析，② lncRNA-mRNA靶向关系分析；
2. ceRNA互作网络分析；
3. 蛋白互作网络分析；
4. 共表达互作网络分析；
三）特色分析
1. 自定义标签和自有数据上传；
2. 外部数据库信息（TCGA、ARCHS4）；
3. 关键驱动基因网络图分析；
4. 时间序列分析。

（*以上分析内容为部分物种可做。）


定制化信息分析：
1. 可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。