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上海达为科生物科技有限公司
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RNA-seq实验
| 品牌 | 其他品牌 | 产地类别 | 国产 |
|---|---|---|---|
| 应用领域 | 医疗卫生,生物产业,综合 |
RNA-seq实验,也叫转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等等,其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来,以此来检测它们的表达水平。
RNA-seq实验原理及过程:
转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及**发生过程中的分子机理。
先将样品提取总RNA,在这之后,除去rRNA(对于真核生物,用带有Oligo(dT)的磁珠富集mRNA,对于原核生物,用试剂盒去除rRNA),向得到的mRNA中加入Fragmentation Buffer使其片断成为短片段,再以片断后的mRNA为模板,用六碱基随机引物(random hexamers)合成cDNA**链,并加入缓冲液、dNTPs、RNase H 和DNA polymerase I 合成cDNA第二链,经过QiaQuick PCR试剂盒纯化并加 EB缓冲液洗脱经末端修复、加碱基A,加测序接头,再经琼脂糖凝胶电泳回收目的大小片段,并进行PCR扩增,从而完成整个文库制备工作,构建好的文库用Illumina HiSeq2000进行测序。
RNA-seq实验服务内容:大数据分析,整体课题的分解,真实的实验数据,完整的实验报告及分析。

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文献和实验是因为其高稳态表达水平是通过转录本高稳定性的积累来实现的。 在ESCs中,多能状态主要由少量增强子相关的主要转录因子控制,包括Oct4、Sox2和Nanog,它们驱动维持ESC状态所必需的靶基因的表达。结果显示,在s4U-标记实验中,Oct4、Sox2和Nanog (OSN) 调控的靶基因在T > C reads中有很高的水平(图5b)。从全局来看,与4,994个近端不含OSN增强子的基因相比,含OSN增强子的2029个基因(>5 cpm)的转录本产生的 T> Creads显著增高 (Mann–
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