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全基因组甲基化测序
其原理是用 Bisulfite 处理,将基因组中未发生甲基化的 C 碱基转换成 U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的 C 碱基区分开来,再结合高通量测序技术,与参考序列比对,即可判断 CpG/CHG/CHH 位点是否发生甲基化,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组 DNA 甲基化图谱
服务流程:
样本要求:
1、无降解、无RNA污染的DNA样本;
2、样品溶解在H20或TE (pH 8.0)中,浓度不少于50ng/ul。
结果交付:
1、提供实验的原始数据、图片、分析结果;
2、详细的实验流程及完整报告一份。
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文献和实验海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因,但是表型(药敏试验仍对该类抗生素敏感)阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序,想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢? zhujoker 我来胡说2句吧,不知道细菌基因组有没有甲基化修饰,自己不做细菌,所以不能确定(但是偶刚才查一下的确好像
发展,使得测序成本大幅度下降,也使得甲基化组(methylome)的研究成为可能。近两年,多个研究小组利用高通量测序相结合,绘制出了多张甲基化图谱。 提到基于二代测序平台的全基因组研究,首先想到的必然是“金标准”BS-seq,即全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing)。该方法的实验原理是前期用Bisulfite处理,将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,特别
欣童 最近想做外周血提取基因组DNA,然后做全基因组甲基化,芯片太贵了,希望大家提供经济实用的检测方法,最好有试剂盒,多谢 kylincom110 做Solexa 测序吧 silentdeath 测序比芯片贵得不是一点两点啊。。 limitless http://www.zymoresearch.com.cn/ 有需要站短我
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