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- Exosome作为活细胞分泌的含有RNA和蛋白质的微囊，大小为30-100nm，广泛分布于外周血、尿液、唾液、腹水、羊水等多种体液中。最新研究表明，体液中 exosomal RNA （特别是miRNA、piRNA和lncRNA等非编码RNA）在不同的疾病模型中存在明显的表达差异。同时，这些分子被exosomes的脂膜所包裹和保护，能保持其原有稳定性和生物学功能，有望成为液体活检的重要分子标志物。 通过exosome lncRNA测序技术，可以开发针对复杂疾病的无创早期检测标志物；指导针对复杂疾病特别是肿瘤的个性化治疗；用于疾病的预后判断，特别是循环系统疾病和肿瘤。 华银采用全球领先的exosome RNA富集和提取技术，并结合微量RNA建库和高通量测序技术，提供exosome lncRNA研究整体解决方案，为广大的生物医学研究者提供最高质量的技术服务。
- 2025年07月16日
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- 服务名称：
外泌体lncRNA测序
- 提供商：
广州华银健康科技有限公司
- 规格：
/sample
通过exosome lncRNA测序技术，可以开发针对复杂疾病的无创早期检测标志物；指导针对复杂疾病特别是肿瘤的个性化治疗；用于疾病的预后判断，特别是循环系统疾病和肿瘤。
华银采用全球领先的exosome RNA富集和提取技术，并结合微量RNA建库和高通量测序技术，提供exosome lncRNA研究整体解决方案，为广大的生物医学研究者提供最高质量的技术服务。
1、实验方案
测序策略：Illumina 平台 PE150
数据量：12G clean data
2、技术优势
（1）更佳的提取⽅法：针对客⼾样本类型，提供不同的提取⽅法（超离法或试剂盒法等），提⾼外泌体质量；
（3）更全的鉴定实验：提供外泌体透射电镜观测、粒径分析、表⾯标志蛋⽩检测共三项鉴定服务，满⾜MISEV2018指南对胞外囊泡的鉴定要求；
3.1 标准信息分析
（1）数据过滤及质量评估
（2）核糖体RNA去除率计算
（3）比对参考基因组及统计
（4）基因表达水平分析
（5）基因表达差异及聚类分析
（6）差异基因KEGG生物通路富集分析（仅限于模式物种）
（7）差异基因GO功能富集分析（仅限于模式物种）
（8）已知mRNA表达量分析
（9）已知mRNA差异表达及聚类分析
（10）已知lncRNA表达量分析
（11）已知lncRNA差异表达及聚类分析
（12）预测新lncRNA
（13）新lncRNA鉴定和表达量分析
（14）新lncRNA差异表达及聚类分析
（15）新lncRNA家族分析
（16）SNP和Indel检测与注释
（17）生物学重复样品间相关性分析
（18）蛋白互作网络分析
（19）基因融合
（20）主成份分析（PCA）
（21）特征性差异表达基因分析
（22）lncRNA保守性分析
（23）可变剪切
3.2 高级分析
（1）已知mRNA-lncRNA共表达网络构建
（2）基因结构优化及优化基因的表达值计算
（3）eQTL分析
4、技术流程
5、案例分析
案例（1）外泌体传递lncARSR以提升肾癌细胞的舒尼替尼抗药性
舒尼替尼耐药是晚期肾细胞癌（RCC）治疗的一个难点。了解这一耐药现象的机制并制定抑制舒尼替尼耐药的有效策略是目前临床应用中面对的重要问题。该研究确定了一个与舒尼替尼抵抗相关的lncRNA（命名为lncARSR）。在RCC细胞中，lncARSR通过竞争性结合miR-34/miR-449来促进AXL和c-Met表达而赋予细胞舒尼替尼抗性。此外，具有生物活性的lncARSR可以被纳入外泌体并被传输到舒尼替尼敏感性RCC细胞，从而传播舒尼替尼抗性。对舒尼替尼抗药性RCC施加舒尼替尼的同时靶向关闭lncARAR或同时施加AXL/c-MET抑制剂可以有效缓解肿瘤细胞对舒尼替尼抵抗。因此，lncARSR可用作预测和治疗舒尼替尼耐药的潜在治疗靶标。
图1 lncARSR RCC舒尼替尼抗性信号通路的作用机制
案例（2）前列腺外泌体中lncRNA富含miRNA种子序列
本研究中分析了在几组前列腺癌的外泌体和其亲代细胞系的lncRNA表达情况。研究发现，不同肿瘤细胞系来源外泌体均富含某些lncRNA。这些外泌体lncRNA本身富含miRNA种子序列，包括let-7家族成员以及miR-17，miR-18A，miR-20a，miR-93和miR-106b。并且在外泌体中同时伴随高丰度相同种类的miRNA。此外，外泌体lncRNA也含有RNA结合蛋白的结合序列，最常见的两种基序是ELAVL1和RBMX。鉴于外泌体lncRNA富含miRNA种子序列与RBP部位，其相互作用可能会在前列腺癌癌变过程中发挥重要功能。
图1 前列腺细胞外泌体中lncRNA的数量和表达差异
参考文献
[1] Qu et al. Exosome-transmitted lncARSR promotes sunitinib resistance in renal cancer by act-ing as a competing endogenous RNA. Cancer Cell, 2016.
[2] Ahadi et al. Long non-coding RNAs harboring miRNA seed regions are enriched in prostate cancer exosomes. Scientific Reports, 2016.
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文献和实验，可作为多种疾病的早期诊断标记物，也能作为靶向药物的载体进行疾病治疗。 外泌体 microRNA 测序/芯片：通过对外泌体 microRNA 的高通量分析，可以找到不同外泌体之间差异表达的 microRNA，为后续的功能学实验做准备。 外泌体 mRNA 测序/芯片：通过对外泌体转录组测序或表达谱芯片分析，可以找出不同外泌体之间差异表达的 mRNA，从而发现外泌体中哪些基因发生了变化。 外泌体 lncRNA 芯片：通过 lncRNA 芯片可以同时得到 lncRNA 和 mRNA 数据，为研究者提供更
了来自结肠直肠癌（CRC）患者和健康人血清外泌体中的 miRNA 表达有明显的差异。 作者先通过外泌体 miRNA 测序（4 个 CRC 患者和 2 个健康人）观察外泌体的 miRNA 差异表达，选取了 29 个下调 miRNAs 和 9 个上调 miRNAs 作为候选标志物。 再使用 RT-qPCR（165 个 CRC 患者和 153 个健康人）进一步验证，最后发现与健康人相比，早期 CRC 患者外泌体 miR-99b-5p 和 miR-150-5p 的表达水平显著降低，术后外泌体 miR-99b-5
恩泽康泰进军家畜外泌体研究领域——全面解锁猪/牛/羊/鸡外泌体研究
数据，6个组织外泌体共计检测到11835个genes（编码基因，已知基因11510个/新预测325个）；共计检测到1907个lncRNA（长链非编码RNA，1352个已知lncRNA/新预测555个），各样品分别与参考基因组序列比对，比对效率从65.04%到77.26%不等。长链RNA测序数据质量良好。 对比两两组织外泌体间差异表达外泌体miRNA、mRNA和lncRNA，初步得到了各个组织外泌体特异性表达的miRNA、mRNA和lncRNA，说明不同部位外泌体携带不同的miRNA/mRNA/lncRNA
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