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Hin4I

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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER1601
  • 2025年09月28日
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      大量

    • - 推荐的缓冲液 : Tango™
    • - 需要SAM
    • - 孵育温度37°C
    • - 连接效率95%
    • - Dam甲基化重叠可能影响DNA切割
    • - CpG甲基化重叠可能影响DNA切割
    • - 热失活65°C, 20 min
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer Tango™ 50X SAM
    ER1601 50 u (1-3 u/µl) 1.00 ml 0.10 ml ER1601
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    Tango™ 37°C 20-50 (+SAM) 20-50 (+SAM) 0-20 (+SAM) 0-20 (+SAM) 100 (+SAM) 0-20 (+SAM) 1X (+SAM)

    Lambda DNA (dam- )
    1.0%琼脂糖
    58 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    [1X 缓冲液Tango™] + SAM:
    [33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA] + 0.05 mM S-腺苷甲硫氨酸。
    37°C酶切。

    保存缓冲液
    Hin4I保存在:
    10 mM磷酸钾 (pH 7.4, 25°C), 100 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    10倍Hin4I过量酶切后,超过95%的酶切产物可以连接,由于识别序列甲基化,只有50%的连接产物能重新酶切。

    备注
    • Hin4I酶切活性需要Mg2+ 离子,S-腺苷甲硫氨酸可刺激Hin4I活性。0.05 mM S-腺苷甲硫氨酸将GsuI活性提升10倍。但是Hin4I仍然很难完全切割某些底物DNA分子。
    • Hin4I浓度是底物DNA分子获得最大切割水平时对应的浓度,并且要保证此浓度不会改变酶切的带型。
    • Hin4I在识别序列两端酶切。该酶的独特之处是其在识别序列3’端存在一个简并切割位点(13或14碱基)。
    • 底物为λ DNA (dam- ) (#SD0021)。
    • 重叠的Dam甲基化抑制Hin4I酶切。为了避免Dam甲基化的影响,样本DNA需要从dam-, dcm- 菌株中抽提,如GM2163 (#M0099)。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    甲基化影响
    Dam: 可能重叠 – 阻止酶切。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 可能重叠 – 部分影响。
    EcoKI: 无重叠 – 不影响。
    EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    Dam (GATC)

    5'...Gm6A TC (N)4 VTC...3'
    3'...C Tm6AG (N)4 BAG...5'

    阻止酶切
    Dam (GATC)

    5'...GAY(N)4Gm6A TC ...3'
    3'...CTR(N)4C Tm6AG ...5'

    阻止酶切
    CpG

    5'...m5C G AY(N)5 VTC...3'
    3'... Gm5C TR(N)5 BAG...5'

    部分影响
    CpG

    5'...GAY(N)5 VTm5C G ...3'
    3'...CTR(N)5 BA Gm5C ...5'

    部分影响
    CpG

    5'...m5C G AY(N)5 VTm5C G ...3'
    3'... Gm5C TR(N)5 BA Gm5C ...5'

    影响不确定
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    58 9 5 5 2 3
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    2 3 2 2 8 6

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    • 作者
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    图标文献和实验
    相关实验
    • 内切酶列表:Enzymes Cleaving DNA on Both Sides of Their Recognition Sequence

      ^(8/13)GAG(N)5 GTTC(12/7)^ PpiI ^(8/13-14)GAY(N)5 VTC(13-14/8)^ Hin4I ^(10/12)GCA(N)6 TCG(12/10)^ BcgI ^(7/12-13)GGA(N)6 GTTC(12-13/7)^ 

    • 酸碱指示剂

      酸碱滴定法所用的指示剂为酸碱指示剂。指示剂作用原理简述如下: 酸碱指示剂一般是弱的有机酸或有机碱。在溶液中存在解离平衡;若 HIn 和 In ˉ分别表示指示剂的酸式和碱式,在溶液中达到平衡: c φ =1mol · L -1 ,称为标准浓度。 比值 c ( In ˉ) /c ( HIn )与 c ( H )有关。一般 c ( In ˉ) /c ( HIn )≥ 10 ,则看到

    • Plasmid Vectors for the Analysis of Protein-Induced DNA Bending

      between the EcoRI and Hin dIII sites. pBend3 was constructed by cloning of the 236-base-pair Eco RI-Hin dIII fragment of pBend2 (4 ) into pBluescript SK (Stratagene). pBluescript is a high-copy-number plasmid and generates a large amount of DNA upon plasmid

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