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DNA甲基化检测

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  • DNA甲基化测序RRBS,Illumina Human 甲基化450K芯片服务
  • 2026年01月15日
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      DNA甲基化检测

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      上海英拜科技生物有限公司

    (1)DNA甲基化测序RRBS
    Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法,通过酶切富集启动子及CpG岛区域,并进行Bisulfite测序,同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。
    研究结果充分证明了RRBS技术的可靠性。RRBS可作为一种更高效经济的研究方法,可应用于检测全基因组启动子和CpG岛区域DNA甲基化状态。

    (2)Illumina Human 甲基化450K芯片服务
    每张芯片包含45万个CpG 位点,24846个基因来自于CCDS,2000多个 癌症相关基因、 400 个miRNA 基因启动子区 ,300个甲基化热点区。全面覆盖基因的启动子区域、5`UTR、第一个exon、基因内部、3`UTR,全面覆盖CpG island、CpG shores、CpG shelves;并且覆盖了科学家们研究发现的一些其它重点区域,如:CpG island以外的CpG位点、在人类干细胞中观察到的非CpG岛甲基化位点、多种肿瘤样品与正常样品以及不同组织之间有差异的甲基化位点、miRNA启动子区域以及GWAS项目发现的疾病相关区域位点、FANTOM 4 启动子等。
    实验流程:
    1.基因组DNA;
    2.亚硫酸氢盐转化;
    3.VCA方式扩增、片段化;
    4.芯片杂交、洗脱、延伸、成像;
    5.数据分析.

    (3)DNA甲基化免疫沉淀测序服务(MeDIP-seq)
    DNA甲基化 免疫共沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq)先用5'-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态。
    产品细节图片1
    研究流程示例(上图)
    产品细节图片2
    MeDIP-Seq实验流程(上图)

    产品细节图片3
    MeDIP-Seq数据分析流程

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    • DNA甲基化的介绍及其抑制剂

      一、 什么是DNA甲基化在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,这常见于基因的5'-CG-3'序列。大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶,主要集中在基因5'端的非编码区,并成簇存在。甲基化位点可随DNA的复制而遗传,?因为DNA复制后,甲基化酶可将新合成的未甲基化的位点进行甲基化。DNA 甲基化是表观遗传学的重要部分,同组蛋白修饰相互作用,通过改变染色质结构,调控基因表达。在哺乳类细胞或人体细胞中,DNA 甲基化与细胞的增殖、衰老

    • DNA甲基化研究方法的回顾与评价(下)

      2.2.10 DNA微阵列法 Yan等2001年[40]将以分子杂交为基础的微阵列技术应用于DNA甲基化检测中,这种方法是基于杂交的寡核苷酸微阵列,是一种在基因组中寻找新位点的方法。包括用于整个基因组范围内扫描的差异甲基化(DMH)杂交(Huang等1999年[41])和用于检测某个位点的甲基化特异性微阵列MSO(Gitan等2002年[42])。前者类似于mRNA表达谱或cDNA微阵列,是CpG岛微阵列,后者类似于寡核苷酸微阵列,是针对CpG二核苷酸位点的甲基化特异性寡核苷酸微阵列[26

    • DNA甲基化研究方法的回顾与评价(上)

      摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲基化检测、基因特异位点甲基化的检测和新甲基化位点的寻找。本篇将主要介绍目前存在的大部分DNA甲基化研究方法,并对其相关特性进行了简要分析与总结。 关键词:表观遗传学;DNA甲基化;甲基化研究

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