当细胞基因组内存在两个loxP位点时,一旦有Cre重组酶出现,就会诱导两个loxP位点间的序列发生重组。首先,Cre重组酶结合到两个13bp的回文序列形成二聚体,然后这个二聚体和另外一个loxP位点上的二聚体结合,形成四聚体。LoxP位点是有方向的,形成四聚体的两个loxP位点是平行的,随后这两个loxP位点间的双链DNA被Cre重组酶切掉,然后切口在DNA连接酶的作用下重新连接。重组的结果取决于两个loxP位点的方向,主要有以下几种可能:
1.如果两个loxP位点位于一条DNA链上,且方向相同,Cre重组酶能有效敲除两个loxP位点间的序列(图1A);
2.如果两个loxP位点位于一条DNA链上,但方向相反,Cre重组酶能导致两个loxP位点间的序列翻转(图1B);
3.如果两个loxP位点分别位于两条不同的DNA链或染色体上,Cre酶能介导两条DNA链的交换或染色体易位(图1C)。











