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μCaler® DNA Full Screen System

(甲基化与突变共检)
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  • 中国南京
  • 2026年01月25日
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    纳昂达(南京)生物科技有限公司
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    • 英文名：

      μCaler® DNA Full Screen System

    • 供应商：

      纳昂达（南京）

    • 保存条件：

      -20℃

    μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案搭载 MSRE (Methylation Sensitive Restriction Endonuclease) 技术和独家专利超灵敏度探针的杂交捕获系统 (μCaler® Hybrid System)，仅需 1 份起始样本 + 1 个杂交反应 + 1 套捕获探针，即可简单、快速、稳定实现超高灵敏度 DNA 甲基化与全景式突变 (SNV/InDel/CNV/Fusion 等) 共检测。

    产品特色

    ● 仅需 1 份样本，通过 1 个杂交反应和 1 套捕获探针即可实现多组学分析

    ● 无需 BS 转化，充分保留原始序列丰富度，提升数据利用率

    ● 简便快速的工作流程，单日内高效完成突变与甲基化同时检测

    ● 提升低丰度甲基化与超低频突变信号的检测灵敏度

     

    方案流程

    1-流程图
     

    方案表现

    稳定高效的酶切效率

    图1

    图 1. NadPrep® Epi 酶切模块对不同类型样本的酶切效率。 A. 不同甲基化水平的模拟样本与不同起始投入量的人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)；B. 临床 FFPE 和 cfDNA 样本。

    注：甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1)，经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%，10%，50%) 。不同甲基化水平的模拟样本以及临床 FFPE 和 cfDNA 样本的起始投入量均为 10 ng。

    充分保留原始序列信息，提升甲基化检测的有效覆盖深度

    图2

    图 2. μCaler® DNA Full Screen System 可提升数倍于 BS 处理方式的 CpG 位点的有效覆盖深度。A. 10 ng 起始投入不同甲基化水平模拟样本和 B. 不同起始投入 5% 甲基化水平模拟样本的 13 个 CpG 位点的平均覆盖深度。模拟样本分别利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案 (Full Screen) 和 μCaler® 靶向甲基化捕获解决方案 (BS) 完成杂交捕获。测序模式为 Illumina® Novaseq 6000，PE150；随机选取 1 M reads pair 进行数据分析。

    精准定量甲基化水平，有效提升检测稳定性

    图3

    图 3. μCaler® DNA Full Screen System 对不同甲基化水平样本的检测结果与理论值一致。A. 不同甲基化水平的模拟样本；B. 随机选取 1 例临床结直肠癌组织样本。

    注：Traditional_BS 利用 NadPrep® Hybrid Capture Reagents (过夜杂交) 完成捕获。

    提升低丰度甲基化与超低频突变信号的检测灵敏度

    样本来源于泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (Genewell，GW-OGTM800) (Undiluted) 与人类基因组去甲基化质控品 (LDTBIO, LDT-600C) 按不同比例混合后，分别进行了 10 倍稀释 (1:10) 和 100 倍稀释 (1:100) ，从而构建了 3 种浓度梯度，旨在模拟不同水平的突变频率及不同的甲基化状态。

     

    图4

     

    图 4. μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案联合分析应用于超低频突变与低丰度甲基化同时检测的表现。80 ng 模拟样本利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案，以 μCaler® Full Screen LF Custom Panel (＜5 Kb，覆盖 31 个 CpG 位点) 完成杂交捕获，随机选取 3 Gb 进行数据分析。 A. 不同位点的突变频率与标准品标称频率一致 [预文库含 UMI 分子标签，分析过滤标准为双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences, DCS211)]；B. 支持突变位点检出的平均 unique reads 数 (DCS211)；C. 不同模拟样本的甲基化水平。

    有效区分肿瘤和健康人群

    图4

     

    图 5. μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案应用于临床结直肠癌患者和健康人 cfDNA 检测的捕获表现。A. 靶区域 CpG 位点的甲基化水平；B. Z 值分析。
    注：始投入量为 10 ng。T：临床结直肠癌患者血浆 cfDNA，其中 T-1~4 为结直肠癌早期患者，T-5 为晚期患者；N：健康人血浆 cfDNA。

     

    本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

    类别 产品名称 规格 货号
    建库模块 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2, 24 rxn 24 rxn 1002421
    NadPrep® DNA Library Preparation Module v2, 96 rxn 96 rxn 1002422
    通用截短型双端唯一
    接头模块    		 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn Index 1-12 1003240
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn Index 1-24 1003241
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn Index 25-48 1003242
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn Index 1-96 1003251
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn Index 97-192 1003252
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn Index 193-288 1003253
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn Index 289-384 1003254
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn Index 1-96 1003261
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn Index 97-192 1003262
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn Index 193-288 1003263
    NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn Index 289-384 1003264
    双端唯一接头模块 (for MGI) NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003711
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24 1003721
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48 1003722
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72 1003725
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn MDI 73-96 1003726
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-96 1003751
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn MDI 97-192 1003752
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn MDI 193-288 1003753
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn MDI 289-384 1003754
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn MDI 1-96 1003761
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn MDI 97-192 1003762
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn MDI 193-288 1003763
    NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn MDI 289-384 1003764
    分子标签接头模块
    NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003911
    NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24 1003921
    NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48 1003922
    NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72 1003925
    NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn MDI 73-96 1003926
    NadPrep® UMI Adapter Kit Set A1 (with 10 nt Index), 24 rxn 1-12 1103111
    NadPrep® UMI Adapter Kit Set B1 (with 10 nt Index), 96 rxn 1-24 1103121
    NadPrep® UMI Adapter Kit Set B2 (with 10 nt Index), 96 rxn 25-48 1103122
    Epi 酶切模块 NadPrep® Epicut Module, 24 rxn 24 rxn 1002811
    Lambda DNA 参考品 Unmethylated Lambda DNA Control, 30 ng 30 ng 1005501
    杂交捕获试剂 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 16 rxn 16 rxn 1105202
    μCaler® Hybrid Capture Reagents v2, 96 rxn 96 rxn 1105201
    封阻序列 μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 16 rxn 16 rxn 1106102
    μCaler® NanoBlockers (for Illumina®), 96 rxn 96 rxn 1106101
    μCaler® NanoBlockers (for MGI, DI), 16 rxn 16 rxn 1106212
    μCaler® NanoBlockers (for MGI, DI), 96 rxn 96 rxn 1106211

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    图标文献和实验
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