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- 2026年01月07日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
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1
- 英文名：
μCaler® HotSpot Panel v1.0
- 供应商：
纳昂达（南京）
- 保存条件：
-20℃
μCaler® HotSpot Panel v1.0 靶向肿瘤突变“热点”区域，涉及致癌和肿瘤抑制相关的 49 个热点突变基因，探针覆盖基因组约 25 Kb 区域。
该 Panel 与 μCaler® Hybrid Capture System 配套使用。基于全新的 μCaler® 靶向富集系统， μCaler® HotSpot Panel v1.0 提升了捕 获效率，捕获表现稳定优异且大幅度减少了实验所需时间，实现更高效的测序并节省成本。
基因列表
| AKT1 | ALK | APC | AR | ARAF | ATM | BRAF | CDKN2A | CHEK2 | CTNNB1 |
| DDR2 | EGFR | ERBB2 | ERBB3 | ESR1 | FBXW7 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FGFR4 |
| FLT3 | GNA11 | GNAQ | GNAS | HRAS | IDH1 | IDH2 | KIT | KRAS | MAP2K1 |
| MAP2K2 | MET | MTOR | NRAS | NTRK1 | NTRK3 | PDGFRA | PIK3CA | PTCH1 | PTEN |
| RAF1 | RET | ROS1 | SF3B1 | SMAD4 | SMO | STK11 | TP53 | TSC1 |
产品表现
捕获表现
图 1. μCaler® HotSpot Panel v1.0 的捕获表现。LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建； 500 ng/预文库投入，参照 μCaler® 杂交捕获指南。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，On-target 按照 reads 数计算。A. 捕获数据的中靶率、比对率及靶区域覆盖度；B. 靶区域覆盖均一性。
注：LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience， LDT900) 包含阴性质控品 (LDT Bioscience，LDT898) 和阳性质控品 (LDT Bioscience，LDT899) 。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。
变异分析
图 2. μCaler® HotSpot Panel v1.0 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 构建预文库，以 μCaler® HotSpot Panel v1.0 完成杂交捕获，Vardict 1.5.1 进行变异分析。测序模式：Illumina Novaseq 6000，PE150。
注：样本为 OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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文献和实验taken directly from this presentation from ABI’s website.Sequencing on the SOLiD machine starts with library preparation. In the simplest fragment library, two different adapters are ligated to sheared genomic DNA (left panel of Fig. 1). If more rigorous
drift particularly in cells known to have an unstable karyotype (i.e. CHO Prod. No. 85050302-1v1, BHK 21 Prod. No. 85011433-1v1) *Loss of cell line due to exceeding finite life-span e.g. human diploid cells such as MRC-5 (Prod. No. 84101801-1v1
dishes (e.g., Corning® CellSTACK®). 6. CO 2 incubator and biosafety cabinet. 7. Filter bottle, 0.5–1 L, 0.2-μm pore size (Corning or equivalent). 2.2. Preparation of Wnt3A CM for Fractionation 1. 20% (v/v) Triton X-100. 2. 1 M Tris-HCl, pH
