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HLAtyping Panel v2.0

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  • #1001952 (16 rxn) #1001951 (96 rxn)
  • 中国南京
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      HLAtyping Panel v2.0

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      纳昂达（南京）

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    订购信息

    产品名称（英文） 产品名称（中文） 货号
    HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn 白细胞抗原分型检测组套 v2.0，16 反应 1001952
    HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn 白细胞抗原分型检测组套 v2.0，96 反应 1001951

    应用背景

    人类白细胞抗原 HLA (human leukocyte antigen)，即人类的主要组织相容性复合体，其位于 6 号染色体的短臂上，是人类免疫系统的重要组成部分。不同的复合体通过其结合槽与各种外源或内源的抗原片段结合，进而与不同的 T 细胞作用，激活下游免疫反应。因此，HLA 承担的功能对其自身的多样性提出了要求：HLA 编码基因是人类基因组上多态性最高的编码区域之一。HLA 抗原多态性与多种疾病相关，也与疫苗和药物靶向人群筛选、组织和器官移植等相关。HLA 配型相合程度是器官、骨髓和干细胞移植成功的关键因素。此外，肿瘤患者的 HLA 基因型以及肿瘤中的体系突变均有可能影响免疫治疗的疗效。因此，对 HLA 基因的准确分型显得尤为重要。

    产品介绍

    HLAtyping Panel v2.0 参考数据库 (Version 3.50)，靶向 11 个 HLA 基因 (I 类：HLA-A、B、C；II 类：HLA-DPA1、DPB1、DQA1、DAQB1、DRB1/3/4/5)，探针覆盖全部等位基因的全长基因组序列，可支持到第四数段的高精度分型。

    产品细节图片1

    产品表现

    捕获表现

    fig 1

    图 1. HLAtyping Panel v2.0 的捕获表现。

    利用 HLAtyping Panel v2.0 分别对标准品进行靶向富集后，通过 Illumina® 平台进行测序。
    注：标准品为 Class I 和 Class II UCLA DNA Reference Panel。HLAtyping Panel v2.0 的捕获表现由 24 种 Class I 和 24 种 Class II 计算平均值及标准偏差。

    分型表现

    表 1. HLAtyping Panel v2.0 对 Class I 的分型结果。


    table 1

    50 ng gDNA 利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 建库，以 HLAtyping Panel v2.0 完成杂交捕获 (6 plex)，Novaseq 6000 PE150 测序，数据量 ~ 0.5 Gb。测序结果以内部工具进行 HLA 分型。
    注：标准品为 Class I UCLA DNA Reference Panel。每个标准品第一排为标准品提供的分型结果，第二排为 HLAtyping Panel v2.0 数据分型结果。


    fig 2

     

    图 2. C1-213 以 HLAtyping Panel v2.0 捕获测序，测序数据比对回分型结果显示的型别的参考序列上，不允许错配的条件下对参考序列的覆盖情况。

    HLAtyping Panel v2.0 对 Class I 的分型结果中出现个别在第二数段上存在差异的结果，经过序列比对和检验发现，HLAtyping Panel v2.0 的新的分型结果更符合：在不允许错配比对的条件下，整条参考序列连续覆盖; 而旧的结果则出现覆盖的中断，即此处的序列组成缺乏支持。

    注：C*08:02 (上) 为标准品 C1-213 提供的分型结果，覆盖不连续；C*08:01 (中) 为新的分型结果，覆盖连续；同时显示结果一致的另一个等位基因 C*12:02 的覆盖情况 (下)。

    产品细节图片2

     

    订购信息

    产品名称（英文） 产品名称（中文） 货号
    HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn 白细胞抗原分型检测组套 v2.0，16 反应 1001952
    HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn 白细胞抗原分型检测组套 v2.0，96 反应 1001951

     

    仅限研究使用，不用于临床诊断。

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