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预设计的shRNA文库

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  • 云舟生物提供高质量的针对人和小鼠基因的shRNA慢病毒文库产品(shRNA lentivirus library)。
  • 广州
  • 2026年04月20日
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    • 技术资料
    • 提供商

      云舟生物科技(广州)股份有限公司

    • 服务名称

      现货文库

    云舟生物提供高质量的针对人和小鼠基因的shRNA慢病毒文库产品(shRNA lentivirus library)。对于每个物种,我们提供了两种规格的慢病毒shRNA文库产品:全基因组大库(针对约19,000个RefSeq基因)和精华基因小库(针对PubMed Central上约2,000个最常被引用的基因),每个基因对应5-6个不同的shRNA。我们的shRNA文库已通过了NGS测序和功能验证。

     

    产品细节图片1

    功能筛选样品的下游服务

    功能筛选后,不知道如何对样品进行NGS数据分析?您可以直接将基因组DNA样品寄送给我们,我们将为您制备NGS样品、高通量测序和数据分析,并在短短几周内告知您样品的gRNA/shRNA的分布情况。
     
    产品亮点

    靶向性广和序列多样:针对人和小鼠,我们提供了两种规格的慢病毒shRNA文库产品:全基因组大库(针对约19,000个RefSeq基因)和精华基因小库(针对PubMed Central上约2,000个最常被引用的基因),每个基因对应5-6个不同的shRNA。shRNA靶点的设计规则参考RNAi consortium (TRC),筛选出来的shRNA都具有较高的干扰分值,使得干扰效果更可靠,筛选效果更明显。

    高度均一性: 通过NGS验证表明,精华库覆盖了100%的shRNA,全基因组库覆盖了97%的shRNA,每个shRNA出现的频率较均一(见图1)。

    产品细节图片2

    图1 shRNA在不同质粒DNA文库的均一性。shRNA读长分布按NGS文库大小(1000万reads)标准化,并以log2比例绘制。

    体系成熟的慢病毒载体骨架和即用型高滴度慢病毒:shRNA文库使用的骨架是第三代慢病毒载体系统,利用人U6启动子介导shRNA的表达,这一系统能在多种细胞中高效稳定地干扰靶基因,而且可以永久有效并均一地将shRNA导入细胞,所以是体外遗传筛选的理想选择。我们可以提供以上文库的即用型慢病毒(>108 TU/ml),可为您节省病毒包装和滴度测定时间。为了提高生物安全性,我们对第三代慢病毒载体系统进行了优化,使其不能进行自我复制。
     
    产品细节图片3
     
    含有双报告基因以利于筛选或追踪阳性细胞:构建文库使用的慢病毒载体骨架含有EGFP和嘌呤霉素抗性基因(Puro),可通过嘌呤霉素和绿色荧光示踪筛选阳性细胞。
    产品细节图片4
    图3 使用人类shRNA精华库(MOI = 10)转导293T细胞,利用嘌呤霉素筛选4天(1.5 μg/ml)之后,EGFP在293T细胞中的表达情况。放大倍数:200x。左:明场。右:GFP。

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