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云舟生物科技(广州)股份有限公司
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定制服务
云舟生物在设计和构建高复杂性的大规模功能筛选文库方面具有丰富的经验。无论您是正在研究基因功能、CRISPR或RNAi功能筛选、调控元件还是细胞谱系分析,我们的专家团队都致力于根据您的特定研究目标提供高质量的定制文库。我们的文库产品使用了下一代测序(NGS)进行全面验证,因此您可以确切地了解您购买的文库信息。
各类定制文库欢迎咨询~
定制文库构建服务

预设计的文库产品
文库构建的一般流程

文库设计
设计一个优化后的文库对于筛选实验的成功至关重要。我们的技术团队可以为您设计具有高效且无差错克隆特点的文库载体,其中可包含各种合适的筛选标记或barcode序列,并且可产出具有高信噪比特征的稳定结果。根据您的研究需求,您可以选择我们的各种经过验证的基因递送系统,比如慢病毒、AAV、转座子、常规质粒和腺病毒。
对于CRISPR和RNAi功能筛选,如果您需要帮助针对您的基因组靶基因设计gRNA或shRNA序列,我们可以基于我们强大的计算机资源和优化流程为您设计。对于双载体系统的CRISPR文库,我们还可以根据您的筛选策略,设计和构建相应的Cas9或Cas9变体表达载体。
预制质粒DNA文库的扩增
为获得插入目的载体骨架的DNA变异体,我们可以使用从头合成、定向进化或以上方法的组合。变异体最少通过一轮PCR扩增并同时以高覆盖率克隆到目的载体骨架中。将文库质粒DNA转化大肠杆菌进行扩增培养后,取对数生长期的菌液制备成甘油菌进行保存。为了评估文库的覆盖率和均一性,在病毒包装之前对文库质粒进行NGS分析。
文库病毒包装
您可能需要通过病毒(如慢病毒或腺相关病毒)将文库转到细胞中。我们研发出了一系列专利技术和试剂,大大改进了病毒包装的滴度、纯度、活性和均一性等。我们可为您的筛选实验在短周期内提供提供预制的病毒文库。
功能筛选样品的NGS测序分析
功能筛选后,您可以直接将基因组DNA样品寄送给云舟生物,我们将为您制备NGS文库、高通量测序和数据分析,并在短短几周内告知您样品的精确读取计数(read counts)。
价格与周期

客户提供文库质粒
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文献和实验Nat Methods:陈玲玲/杨力/李劲松等开发新技术,实现环状 RNA 功能性筛选和研究
Methods 官网)前述实验结果表明 RfxCas13d 是一种高效、特异的 circRNA 敲除工具。研究团队构建了靶向 9 个人类细胞系中 2908 个高表达 circRNA 的 BSJ-gRNAs 文库,尝试使用该工具鉴定潜在的参与细胞增殖的候选 circRNA。 BSJ-gRNA 文库构建(图源:Nature Methods 官网) 研究团队将 BSJ-gRNA-RfxCas13d-HT29 细胞转移到裸鼠体内进行体内功能缺失(loss-of-function,LOF)表型筛筛选,注射 22 天后
目前慢病毒载体主要应用在以下几个方面: 细胞基因治疗(截止目前,已上市的 CAR-T 产品有 9 款采用了慢病毒载体递送 CAR 基因) 基因表达调控(过表达、RNA 干扰研究等) 基因编辑(CRlSPR/Cas9 gRNA 文库筛选、基因敲除、敲入、点突变、基因激活/抑制) 稳转细胞株构建 活体细胞成像追踪 转基因动物 图 1 慢病毒载体的主要应用方向 应用案例 案例 1:用慢病毒载体进行基因过表达,构建稳转细胞株,研究葡萄糖激酶在前列腺癌(PCa)中的作用[1] 细胞
一 miRNA成熟及作用方式(Mikhailidis DP, Athyros VG. Nat Rev Cardiol. 2014 Feb;11(2):72-4.) miRNA过表达:将miRNA前体序列构建入病毒载体中,该载体既可用于瞬时转染细胞,也可以包装成病毒用于稳定株筛选和动物水平过表达miRNA。 miRNA敲低:设计针对miRNA的TuD RNA封闭片段或海绵片段,再将该片段构建入病毒载体中。该载体除了可以直接瞬时转染细胞用于miRNA的敲低,也可以包装成慢病毒,用于动物水平敲低miRNA
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