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表观组测序

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      北京诺禾致源科技股份有限公司

    • 服务名称

      表观组测序

    诺禾致源表观组测序

    WGBS—全面准确分析基因组甲基化

    全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome BisulfiteSequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行甲基化研究。

    • 准确:

      WGBS可以达到单碱基分辨率,准确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。
    • 高效:

      全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。

     

    ChIP-seq—DNA-蛋白质相互作用研究技术

    结合染色质免疫共沉淀技术(ChIP)和高通量测序技术,对目的蛋白结合的 DNA 片段进行测序,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的 DNA 区段。

    • 全基因组范围:

      获取全基因组范围特定目的蛋白与DNA的互作信息。
    • 抗体类型丰富:

      具有多种商品化 ChIP级抗体,高效支持实验开展。

     

    RNA IP-seq(RIP-seq)RNA-蛋白质相互作用研究技术

    • RNA IP-seq是研究细胞内 RNA 与蛋白结合情况的技术,以 RNA 免疫共沉淀(RIP)实验为基础,采用针对目标蛋白的特异性抗体把相应的 RNA 与蛋白质复合物沉淀出来,分离纯化复合物中的 RNA,通过 Illumina 测序,在全转录组范围内研究被目标蛋白特异性结合的 RNA 区域或种类,并比较样品/组间差异。
    • 抗体类型丰富:

      具有多种商品化抗体,高效支持实验开展。

     

    ATAC-seq(mini ATAC-seq)——研究开放染色质的高通量测序技术

    ATAC-seq(Assay forTransposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing):结合高通量测序对Tn5转座酶易接近性核染色质区域进行测序分析,是研究染色质开放性/可及性的测序技术。通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,即可获得在该时空下全基因组上所有的开放染色质区域信息。

    mini ATAC-seq技术是在常规ATAC-seq技术基础上进行升级优化,从而实现5000个细胞/5mg组织即可进行建库的微量ATAC-seq技术。

     

    产品细节图片1

     

    RNA甲基化(MeRIP-seq)  RNA 的 m6A 修饰

    产品细节图片2

    MeRIP-seq示意图

    热点研究:

    mRNA的m6A修饰。

     

    RRBS—经济且准确的DNA甲基化

    简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)通过酶切富集启动子及 CpG 岛区域,并进行 Bisulfite 测序,同时 实现 DNA 甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。作为一种高性价比的甲基化研究方法,简化甲基化测序在大规模 临床样本的研究中具有广泛的应用前景。

    • 准确:

      单碱基分辨率,准确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态。
    • 经济:

      性价比高,在较少的测序数据量下,针对启动子及 CpG 岛区域的DNA甲基化进行分析。

     

    CUT&Tag—DNA-蛋白质相互作用研究技术

    CUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法。该技术使用磁珠吸附活细胞,洋地黄皂苷打开细胞膜的通透性;pA-Tn5转座酶在抗体引导下精确结合靶蛋白附近的DNA序列,由于Tn5连有测序接头,可以直接在片段化的 DNA 两端添加接头,最终通过PCR扩增获得完整的文库。

    产品细节图片3

     

    Hi-C—前沿技术带你走进DNA的三维空间

    Hi-C技术是染色体构象捕获(Chromosome conformation capture,简称为3C)的一种衍生技术,是指基于高通量进行染色体构象的捕获,它能够在全基因组范围内捕捉不同基因座位之间的高分辨率空间交互信息,研究三维空间中调控基因的DNA元件。与WGS、RNA-seq、ATAC-seq、 CUT&Tag等多组学联合分析,研究不同物种基因组空间结构(compartment、TAD、loop结构),从而揭示基因组三维结构,解析肿瘤/疾病/物种进化的发生发展机制。

    全基因组范围:全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系。

    热点技术:三维基因组信息作为更高层次的生物学问题解释系统。

     

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