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舒桐科技
在表观遗传学研究时代,染色质修饰位点精确鉴定已成为基因表达调控研究的关键技术支柱。作为解析组蛋白修饰、转录因子结合位点和指导表观遗传机制研究的重要工具,CUT&Tag技术能在常规ChIP-seq方法无法实现的灵敏度和分辨率水平上发现蛋白质-DNA互作位点,为精准解析基因表达调控机制、探索染色质状态变化提供科学依据。
pA/G-Tn5融合蛋白是CUT&Tag技术的核心,它能通过Protein A/Protein G与特异性抗体结合,将Tn5转座酶精确定位到目标蛋白结合位点。在Mg²⁺激活后,Tn5转座酶能够在目标位点切割DNA并同时插入测序接头,实现对特定组蛋白修饰或转录因子结合位点的高精度标记和捕获。
我们团队利用成熟的pA/G-Tn5融合蛋白技术及优化的实验流程,精心设计了包含多种组蛋白修饰和转录因子分析的完整解决方案,适用于干细胞研究、发育生物学、肿瘤表观遗传学等多种研究领域。
我们提供的CUT&Tag检测服务覆盖从样本处理、抗体孵育、pA/G-Tn5标记到数据分析的全流程解决方案,通过精确定位染色质修饰位点,揭示基因调控的分子机制,为科研工作者提供深入理解表观遗传学调控网络的关键数据支持。
图 1 CUT&Tag 建库原理
技术优势
- 超低样本需求:低至1,000个细胞,远低于传统ChIP-seq的百万级细胞需求,适用于稀有细胞和临床样本研究
- 超高信噪比:直接在原位标记目标蛋白结合位点,显著减少非特异性背景,提供更清晰的峰信号
- 高分辨率:可达到碱基级别的分辨率,精确刻画蛋白质与DNA的互作位点,识别关键调控元件
- 操作简便高效:整个实验流程可在一天内完成,省去了复杂的超声破碎和免疫沉淀步骤
- 数据质量优异:测序数据利用率高,有效测序读数比例大,获得更多有价值的信息
服务优势
- 专业pA/G-Tn5融合蛋白:自主研发生产的高活性pA/G-Tn5融合蛋白,确保标记反应高效特异
- 个性化实验设计:根据研究目标和样本特性,量身定制最佳实验方案,优化每一步实验条件
- 深度分析能力:专业的生物信息分析团队提供从基础分析到多组学整合的深度挖掘服务
技术应用场景
- 组蛋白修饰图谱构建
- 转录因子结合位点鉴定
- 表观遗传动态研究
- 染色质结构分析
- 药物干预效应评估
服务内容
| 服务项目 | 内容 | 周期 | 价格 | 交付形式 |
| CUT&Tag | 文库构建+测序分析 | 25-35个工作日 | 欢迎询价 | 原始数据+可视化结题报告 |
细胞送样要求
1)细胞数量:最低1,000个细胞,推荐50,000-100,000个以上;
2)活性要求:细胞活率≥80%;
3)运输条件:液氮冻存活细胞,干冰运输;
4)完整性:细胞形态正常,无明显破碎。
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文献和实验[1]Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019;10(1):1930. Published 2019 Apr 29.
[2]Kaya-Okur HS, Janssens DH, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. Efficient low-cost chromatin profiling with CUT&Tag. Nat Protoc. 2020;15(10):3264-3283.
of H3K4me3 Modification in Cotton Using CUT&Tag 为题发表在 Plant Methods 上。 1.研究过程 该研究以棉花为模型系统,棉花植物(棉属)带有种皮毛(棉纤维),是全世界重要的商品。由于 ChIP-Seq 对起始量需求高( 20µg 染色质),棉纤维中表观基因组修饰的概况分析比较困难。关雪莹教授团队在这次研究中使用了 CUT&Tag(Vazyme #S602/S603),仅需要常规ChIP策略所需原料的约
endosperm using CUT&RUN (PMID:30719569) 的前端处理。 2. CUT&Tag 技术公布的 Protocol 适用于活细胞,对细胞状态有要求吗?那么经过 PFA 交联过的细胞可以使用吗? CUT&Tag 在活细胞上确实成功率比较高,在准备细胞时需要保证细胞处于高细胞活性状态,若细胞活性不佳,胞内蛋白质与核酸相互作用的状态会发生改变,对于死亡的细胞,目的蛋白有可能从染色质上脱落,进而影响实验数据。在准备细胞样本时使用台盼蓝进行细胞活性的检测
,将 CUT&RUN 技术升级到单细胞水平,并应用于早期胚胎研究。 2019 年 Henikoff 等发明 CUT&Tag ,使用带有接头的 Tn5 转座酶替代 MNase ,简化实验操作,将细胞量从 104 级别降到 60 个细胞甚至单细胞。 2.蛋白质-DNA 互作技术概述 ✦染色质免疫共沉淀(ChIP): ChIP 是全基因组范围内检测蛋白-DNA 互作的标准方法,该技术由 Orlando 等于 1997 年创立[1]。 图 1:ChIP 基本原理图[1] ✦ ChIP
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