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- 2026年01月06日
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北京诺禾致源科技股份有限公司
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BS-seq（WGBS）
全面准确分析基因组甲基化
全基因组DNA甲基化测序（Whole Genome BisulfiteSequencing，WGBS）是将重亚硫酸盐处理方法和高通量测序平台相结合，对有参考基因组的物种在全基因组水平进行甲基化研究。
准确：
WGBS可以达到单碱基分辨率，准确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态，从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。
高效：
全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响，快速准确地找到差异甲基化区域。
应用方向
胚胎发育
人、小鼠、斑马鱼等胚胎细胞发育研究。
癌症疾病
肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等研究。
动物行为
动物觅食、攻击、繁殖、通讯等行为研究。
植物研究
植物胁迫、生长发育、开花、遗传育种等研究。
诺禾优势
1.样本起始量低
建库仅需DNA0.1-0.2ug
2. 周期快、质量好，稳定性高
诺禾WGBS采用先进的平台测序，并与高性能计算平台（High PerformanceComputing，HPC）结合，实现快速、稳定的测序数据分析及交付。
3.方案设计专业，质控严格
诺禾WGBS建库加入阴性对照λDNA，要求重亚硫酸盐转化效率99%以上，并采用主流软件bismark 进行分析...从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都经过科学、缜密 的设计，以保障高质量研究成果。
4. 项目文章以及物种经验丰富
诺禾致源已经成功完成对猪，大豆，食蟹猴，小鼠，扬子鳄，牛，涡虫，牡蛎、拟南芥，水稻，杨树，白菜等近百个物种进行全基因组甲基化测序分析，助力客户在Genome Biology、Nucleic Acids Research、Nature Plants等权威杂志发表多篇高水平文章。
信息分析
诺禾致源WGBS基于全基因组水平，实现单碱基分辨率的甲基化位点准确定位，快速准确找到差异位点，实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。| WGBS | 分析内容 | 解决问题 |
|---|---|---|
| 标准分析 | 测序数据质量评估 | 过滤低质量数据，保证数据质量 |
| 与参考基因组比对 | 比对率和覆盖度分析 | |
| 甲基化位点 calling | 分析甲基化位点 | |
| 甲基化分布 | 甲基化在基因组，染色体，功能与元件上的分布 | |
| 差异甲基化分析 | 寻找 DMR | |
| 相关基因分析 | 相关基因GO，KEGG 富集分析 | |
| 多样本分析 | PCA 分析多样本甲基化变化规律 |
关联分析
诺禾致源WGBS基于全基因组水平，实现单碱基分辨率的甲基化位点准确定位，快速准确找到差异位点，实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。| WGBS | 分析内容 |
|---|---|
| DNA甲基化与mRNA关联分析 | 1.整体上的关联，主要从染色体层面基因甲基化水平与表达水平分布，基因上下游层面甲基化水平与表达水平分布两个方面来展示DNA甲基化修饰与基因表达的关系 |
| 2.DMR相关基因表达与甲基化修饰，以甲基化分析得到的DMR相关基因为主体，以不同形式展示其表达与甲基化修饰的关系 | |
| 3.DMR相关基因与差异基因联合分析，将DMR相关基因与转录组分析得到的差异基因取交集，以不同的形式展示交集基因的甲基化水平和表达量及其注释信息 | |
| 4.DMR相关基因与差异基因功能分析，主要是基于基因集合间求交集并进行GO和KEGG富集分析 |
送样建议
| 组织类型 | 送样建议 |
|---|---|
|
新鲜动物组织 |
>100 mg |
|
新鲜植物组织 |
>200 mg |
|
新鲜培养细胞数量 |
10^6个 |
|
动物血（哺乳类） |
>2 mL |
|
动物血（红细胞有核类） |
>1 mL |
常见问题
1. 哪些物种可以研究WGBS?
要做全基因组甲基化分析，对物种有以下要求：
a. 物种为真核生物；
b. 物种具有参考基因组，至少拼接到scaffold水平；
c. 具有较为完整的注释。
2. 全基因组甲基化测序有哪些优势？
在全基因组水平，单碱基分辨率检出甲基化位点，不仅能够高精度发现CpG岛等常见区域的甲基化水平的变化，还能够分析genebody区，基因间区等区域的甲基化水平的差异，分析甲基化对染色体的状态以及基因结构变化的影响，从多维度分析解决生物学问题。
诺禾致源拥有专业的设计方案、严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，贴心的项目服务，确保每一个环节都能出色完成，助力您的科学研究。
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文献和实验[1] Takahashi, Yuta et al. “Transgenerational inheritance of acquired epigenetic signatures at CpG islands in mice.” Cell vol. 186,4 (2023): 715-731.e19. doi:10.1016/j.cell.2022.12.047
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