表达分析
检测GPR65在人和小鼠纤维化肝脏中的表达水平。
通过qRT-PCR和免疫组化检测人和小鼠纤维化肝脏中GPR65的表达,并分析其与炎症因子TNF-α、IL-6的相关性。
Targeting GPR65 alleviates hepatic inflammation and fibrosis by suppressing the JNK and NF-κB pathways
包含细胞模型(HMs、BMMs、RAW264.7)功能验证、体内动物模型(BDL、CCl4)及BMT实验,并明确机制验证。
小鼠BDL诱导的肝纤维化模型 小鼠CCl4诱导的肝纤维化模型 小鼠骨髓移植模型 小鼠原代肝巨噬细胞
Gpr65敲除小鼠(C57BL/6N背景) CCl4剂量0.25 ml/kg腹腔注射每周2次共8周 BDL手术21天 GPR65抑制剂ZINC62678696给药剂量10 mg/kg pH 6.6酸性刺激
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测GPR65在人和小鼠纤维化肝脏中的表达水平。
通过qRT-PCR和免疫组化检测人和小鼠纤维化肝脏中GPR65的表达,并分析其与炎症因子TNF-α、IL-6的相关性。
评估Gpr65缺失对肝纤维化的影响。
对WT和GPR65-KO小鼠进行BDL或CCl4处理,评估肝纤维化、炎症和损伤。
确定GPR65作用是否主要依赖骨髓源性巨噬细胞。
将WT或GPR65-KO小鼠的骨髓细胞移植到受致死照射的WT受体中,然后进行CCl4处理。
研究GPR65对巨噬细胞M1极化的影响。
使用GPR65敲除、过表达、激动剂和拮抗剂处理巨噬细胞,检测炎症因子表达和通路激活。
阐明GPR65下游信号通路。
检测JNK和NF-κB通路相关蛋白磷酸化水平,并使用通路抑制剂进行验证。
验证GPR65通过巨噬细胞分泌的TGF-β促进肝星状细胞活化和肝细胞损伤。
用条件培养基(CM)预处理肝星状细胞和肝细胞,加入TGF-β中和抗体检测其阻断效果。
评估GPR65抑制剂对肝纤维化的治疗潜力。
对CCl4处理的小鼠给予GPR65抑制剂ZINC62678696,评估肝纤维化程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| I型胶原 | Sigma-Aldrich | C7661 | |
| 小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 300-25 | |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | D4902 | |
| 细胞处理 | -- | Maybridge | BTB09089 |
| -- | Enamine | EN300-261362 | |
| 信号通路抑制 | NF-κB抑制剂 | MCE | HY-13453 |
| NF-κB抑制剂 | MCE | HY-18738 | |
| JNK抑制剂 | MCE | HY-12041 | |
| JNK抑制剂 | Selleck | S4901 | |
| Gαq抑制剂 | Focus Biomolecules | 10-1590 | |
| 钙离子螯合剂 | MCE | HY-100168 | |
| AMPK抑制剂 | MCE | HY-13418A | |
| 组织学 | 直接红80 | Sigma | 365548 |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | -- | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Thermo | -- | |
| BGIseq500测序平台 | BGI-Shenzhen | -- | |
| 细胞分离 | EGTA | -- | -- |
| 链霉蛋白酶E | Roche | 11459643001 | |
| IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138 | |
| 脱氧核糖核酸酶1 | Roche | 10104159001 | |
| Histodenz溶液 | Sigma-Aldrich | D2158 | |
| F4/80抗体 | Miltenyi Biotec | 130-110-443 | |
| CD146抗体 | Miltenyi Biotec | 130-092-007 | |
| 抗体 | I型胶原抗体 | Abcam | ab34710 |
| α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| TIMP1抗体 | Santa Cruz | sc-21734 | |
| MMP2抗体 | Abcam | ab92536 | |
| 波形蛋白抗体 | CST | #5741 | |
| BAX抗体 | Abcam | ab32503 | |
| 裂解的caspase-3抗体 | CST | #9661 | |
| caspase-3抗体 | CST | #9662 | |
| PCNA抗体 | CST | #13110 | |
| MCP-1抗体 | CST | #2029 | |
| CD11b抗体 | Abcam | ab133357 | |
| IL-1β抗体 | CST | #12242 | |
| LY6C抗体 | Novus | NBP2-00441 | |
| TNF-α抗体 | Santa Cruz | sc-52746 | |
| p-IKK抗体 | CST | #2697 | |
| p-p65抗体 | CST | #3033 | |
| p-IκBα抗体 | CST | #9246 | |
| IKK抗体 | Abcam | ab178870 | |
| p65抗体 | Santa Cruz | sc-8008 | |
| IκBα抗体 | CST | #4814 | |
| p-MLK3抗体 | Affinity Biosciences | AF8079 | |
| p-MKK4抗体 | CST | #9156 | |
| p-MKK7抗体 | Proteintech | 80357-1-RR | |
| p-JNK抗体 | CST | #4668 | |
| p-p44/42抗体 | CST | #4370 | |
| p-p38抗体 | CST | #4511 | |
| JNK抗体 | CST | #9252 | |
| p44/42抗体 | CST | #4695 | |
| p38抗体 | CST | #8690 | |
| p-GSK-3β抗体 | CST | #5558 | |
| p-Akt抗体 | CST | #4060 | |
| p-PDK1抗体 | CST | #3438 | |
| p-PTEN抗体 | CST | #9551 | |
| p-c-Raf抗体 | CST | #9421 | |
| Akt抗体 | CST | #4691 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内动物模型 | C57BL/6N背景的GPR65-KO小鼠,CCl4剂量0.25 ml/kg每周2次共8周,BDL手术21天,每组样本量(n=5或n=10)。 阅读提示:Methods: Animals in vivo study |
| 骨髓移植实验 | 受体小鼠接受9 Gy致死照射,骨髓细胞数量1×10^7,移植后CCl4处理方案。 阅读提示:Methods: Animals in vivo study |
| 细胞处理 | GPR65激动剂BTB09089浓度30 μmol/L,抑制剂ZINC62678696浓度30 μmol/L,pH处理(6.6、7.4、8.2),共培养条件。 阅读提示:Methods: Culture and treatments of primary cells and cell lines |
| 信号通路抑制 | JNK抑制剂(SP600125 10 μmol/L,JNK-IN-8 5 μmol/L),NF-κB抑制剂(BAY 11-7082 5 μmol/L,APDC 20 μmol/L),Gαq抑制剂YM-254890 1 μmol/L,Ca2+螯合剂BAPTA 10 μmol/L,AMPK抑制剂Compound C 10 μmol/L。 阅读提示:Methods: Culture and treatments of primary cells and cell lines, Results: Targeting GPR65... |
| 分子检测 | Western blotting抗体稀释度(如p-JNK 1:1000),qRT-PCR引物序列,ELISA试剂盒。 阅读提示:Methods: Western blotting, qRT-PCR, Additional file 1 |