IL-6诱导自噬的细胞学验证
验证IL-6是否能诱导结直肠癌细胞自噬,并判断其是否依赖STAT3。
用IL-6处理SW48等细胞,通过Western blot检测LC3B-II和SQSTM1,GFP-LC3B免疫荧光计数自噬斑点,透射电镜观察自噬体,mCherry-GFP-LC3B检测自噬流;并用STAT3抑制剂Stattic或siRNA敲低STAT3验证依赖性。
IL-6 regulates autophagy and chemotherapy resistance by promoting BECN1 phosphorylation.
含细胞系、BECN1敲除细胞、动物移植瘤模型及65例临床CRC组织芯片,并完成功能与机制验证
SW48和LoVo结直肠癌细胞系 MCF-7乳腺癌细胞系 CT26小鼠结肠癌BALB/c同种移植瘤模型 65例临床CRC患者肿瘤组织芯片
IL-6处理浓度20 ng/ml,处理时间12 h或24 h(不同实验) JAK2抑制剂CHZ868 0.2 μM,STAT3抑制剂Stattic 20 μM BECN1 Y333F(磷酸化缺陷)和Y333E(磷酸化模拟)突变体在BECN1敲除细胞中的功能验证 化疗药5-Fu 800 μM、OXA 100 μM处理36 h,CQ 25 μM 动物实验:CT26细胞1×10^7皮下注射,IL-6 20 ng/g瘤内注射,CQ 25 mg/kg,OXA 5 mg/kg或5-Fu 50 mg/kg腹腔注射,每周两次,n=5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IL-6是否能诱导结直肠癌细胞自噬,并判断其是否依赖STAT3。
用IL-6处理SW48等细胞,通过Western blot检测LC3B-II和SQSTM1,GFP-LC3B免疫荧光计数自噬斑点,透射电镜观察自噬体,mCherry-GFP-LC3B检测自噬流;并用STAT3抑制剂Stattic或siRNA敲低STAT3验证依赖性。
确定JAK2是否介导IL-6诱导的自噬。
使用JAK2抑制剂CHZ868、过表达JAK2或siRNA敲低JAK2,结合Western blot和GFP-LC3B免疫荧光检测自噬水平。
验证JAK2与BECN1结合并明确磷酸化位点。
共免疫沉淀和免疫荧光验证内源性JAK2与BECN1相互作用;构建JAK2和BECN1截短体及点突变体,结合Co-IP和磷酸化检测确定JAK2的JH1结构域与BECN1的ECD结构域结合,并鉴定Y333为磷酸化位点;制备p-BECN1(Y333)特异性抗体进行验证。
验证Y333磷酸化是否必需且足以介导IL-6诱导的自噬及BECN1相互作用组变化。
在MCF-7和BECN1敲除LoVo细胞中回补BECN1 WT、Y333F或Y333E突变体,检测LC3B-II、SQSTM1和GFP-LC3B斑点;Co-IP检测BECN1与VPS34、VPS15、BCL-2、Rubicon等的相互作用。
评估IL-6及BECN1 Y333磷酸化是否影响化疗药物敏感性。
CCK-8检测细胞活力,Western blot检测cleaved caspase-3和cleaved PARP1,克隆形成实验检测细胞生长;使用自噬抑制剂CQ或JAK2抑制剂CHZ868联合化疗药物。
在动物模型中验证IL-6及BECN1 Y333磷酸化对化疗耐药的作用。
将CT26细胞或CT26-Becn1-KO细胞皮下注射至BALB/c小鼠,分别给予IL-6、CQ、化疗药物或回补Becn1 WT/Y331F/Y331E,监测肿瘤体积和重量,免疫组化检测Ki-67、LC3B、cleaved PARP和cleaved caspase-3。
评估p-BECN1(Y333)水平与CRC临床特征及预后的相关性。
对65例CRC组织芯片进行免疫组化染色,分析p-BECN1(Y333)与p-JAK2的相关性、肿瘤与癌旁组织的差异,以及与总生存期的关系;进行单因素和多因素分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Invitrogen | 12430054 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10100147 | |
| 药物处理 | 氯喹 | Sigma | C6628 |
| Stattic | MedChemExpress | HY-13818 | |
| CHZ868 | MedChemExpress | HY-18960 | |
| 5-氟尿嘧啶 | Sigma | F6627 | |
| 奥沙利铂 | Sigma | O9512 | |
| 细胞因子处理 | 白细胞介素-6 | Sigma | SRP3096 |
| 药物处理 | 二甲基亚砜 | Sigma | D2650 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Bimake | B34304 |
| 细胞凋亡检测 | PE Annexin V凋亡检测试剂盒 | Becton Dickinson and Company | 559763 |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| Western blot | 抗MAP1LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Proteintech Group | 66184-1-Ig | |
| 抗VPS34抗体 | Proteintech Group | 12452-1-AP | |
| 抗VPS15抗体 | Proteintech Group | 17894-1-AP | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071 | |
| 抗Rubicon抗体 | Cell Signaling Technology | 7151 | |
| 抗ATG14抗体 | Cell Signaling Technology | 96752 | |
| 抗UVRAG抗体 | Cell Signaling Technology | 13115 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 抗磷酸化STAT3 (Y705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗GFP抗体 | Qi dongzi Co. | 2955 | |
| 抗JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 29261 | |
| 抗磷酸化JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 74129 | |
| 抗JAK2抗体 | Cell Signaling Technology | 3230 | |
| 抗磷酸化JAK2抗体 | Abcam | ab32101 | |
| 抗BECN1抗体 | Cell Signaling Technology | 3495 | |
| 抗BECN1抗体 | Proteintech Group | 66665-1-Ig | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗Flag抗体 | Qi dongzi Co. | 14793 | |
| 抗磷酸酪氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9411 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗Ki-67抗体 | Cell Signaling Technology | 9449 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9532 | |
| 抗cleaved PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2148 | |
| p-BECN1 (Y333)特异性抗体 | Proteintech Group | -- | |
| 免疫沉淀 | 磁珠 | Bimake | B26201 |
| 磁珠 | Bimake | B26101 | |
| protein A/G琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma | 9542 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂 | Pierce | 23252 |
| ECL化学发光试剂 | Thermo Scientific | 35055 | |
| 质粒构建 | 快速定点突变系统试剂盒 | TransGen Biotech | FM111-01 |
| 组织芯片 | 临床结直肠肿瘤组织芯片 | Shanghai Outdo Biotechnology Co. | HColA180Su15 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IL-6诱导自噬的细胞实验 | IL-6浓度20 ng/ml,处理时间12 h或24 h;CQ浓度25 μM;Stattic浓度20 μM;部分实验n=2,部分n=3 阅读提示:Methods细胞培养与试剂部分;Fig. 1图注 |
| JAK2介导自噬的验证 | JAK2抑制剂CHZ868浓度0.2 μM;IL-6 20 ng/ml;处理时间12 h或24 h;n=2或3 阅读提示:Fig. 2图注;Methods细胞培养与试剂 |
| BECN1 Y333磷酸化功能验证 | BECN1敲除LoVo细胞构建(CRISPR/Cas9,gRNA序列);回补BECN1 WT、Y333F、Y333E;IL-6 20 ng/ml处理12 h 阅读提示:Methods BECN1 knockout cell line construction;Fig. 4图注 |
| 化疗耐药体外实验 | IL-6预处理8 h后,5-Fu 800 μM或OXA 100 μM处理36 h;CQ 25 μM;CCK-8检测450 nm;n=3 阅读提示:Methods CCK-8 assay;Fig. 5图注 |
| 体内移植瘤实验 | CT26细胞1×10^7皮下注射;IL-6 20 ng/g瘤内注射;CQ 25 mg/kg;OXA 5 mg/kg或5-Fu 50 mg/kg腹腔注射,每周两次;n=5小鼠/组;3周后检测 阅读提示:Methods Animal experiments;Fig. 5、Fig. 6图注 |
| 临床样本IHC分析 | Cohort-1 65例CRC组织;Cohort-2组织芯片(肿瘤与癌旁);IRS评分标准:低表达0-4,高表达6-12;生存分析n=44低表达、n=57高表达 阅读提示:Methods Immunohistochemistry;Fig. 6图注 |