泛素特异性蛋白酶25通过去泛素化NLRP3并负调控心肌细胞中NLRP3炎症小体活性来改善心肌缺血再灌注损伤

Ubiquitin-specific protease 25 improves myocardial ischemia-reperfusion injury by deubiquitinating NLRP3 and negatively regulating NLRP3 inflammasome activity in cardiomyocytes.

作者信息Bozhi Ye, Diyun Xu, Lingfeng Zhong, Yi Wang, Wei Wang, Haowen Xu, Xue Han, Julian Min, Gaojun Wu, Wenhai Huang, Guang Liang
PMID39985261
发布时间2025-02
DOI10.1002/ctm2.70243

实验完整度

文献包含体内小鼠MI/RI模型(USP25敲除与过表达)、体外心肌细胞H/R和LPS/Nig模型、临床心肌样本验证、以及分子机制实验(Co-IP、LC-MS/MS、位点突变、泛素化分析),证据层级完整。

主要模型

小鼠心肌缺血再灌注(MI/RI)模型 新生大鼠原代心肌细胞(NRPCs) HL-1心肌细胞系 人缺血性心肌病心肌样本

重点核对

MI/RI模型建立:30分钟缺血,4小时或2周再灌注,LAD结扎 USP25敲除小鼠(C57BL/6J背景)及野生型同窝对照 AAV9-cTnT-USP25过表达,尾静脉注射1×10^11 v.g./小鼠,于I/R术前4周 NLRP3−/−小鼠(C57BL/6J背景,品系号VSM40005) 体外H/R模型:缺氧4小时(1% O2)复氧6小时;LPS(1μg/mL)6小时+尼日利亚霉素(10μM)30分钟

摘要

背景:心肌缺血再灌注损伤(MI/RI)限制了心肌再灌注治疗的效果,且缺乏有效的防治方法。去泛素化酶(DUBs),特别是泛素特异性蛋白酶(USP)家族的成员,是泛素化修饰过程中的关键蛋白,在MI/RI中发挥重要作用。因此,我们旨在研究USP家族成员USP25在MI/RI中的作用及其分子机制。方法:应用转录组测序评估缺氧/复氧(H/R)期间USP家族的差异表达,并通过定量聚合酶链反应在人及小鼠心脏样本和心肌细胞中进行验证。使用野生型或USP25−/−小鼠建立MI/RI模型。采用免疫共沉淀(Co-IP)结合液相色谱-串联质谱分析筛选H/R诱导的心肌细胞损伤中USP25的潜在底物蛋白。使用TUNEL和Hoechst/碘化丙啶染色及western blot检测焦亡水平。此外,使用AAV9载体在NLRP3−/−小鼠中实现心肌细胞特异性USP25过表达,以验证USP25与NLRP3相互作用的生物学功能。结果:我们发现,在I/R诱导的小鼠心脏组织和原代心肌细胞中,USP25的表达水平呈时间依赖性显著降低。USP25缺失加重了小鼠MI/RI并加剧了I/R诱导的心脏重构。机制上,USP25直接结合NLRP3蛋白,并通过其活性位点C178在K243残基处对NLRP3进行K63连接的去泛素化,从而阻碍NLRP3-ASC相互作用和ASC寡聚化,抑制心肌细胞中NLRP3的激活和焦亡。我们进一步表明,心肌细胞中USP25的过表达改善了小鼠MI/RI,而当NLRP3被敲除时,这种保护作用消失。结论:我们的研究表明,USP25通过调节NLRP3激活及其介导的焦亡来改善MI/RI。这一发现扩展了USP25在心血管疾病中的保护作用,并为未来基于USP25的药物开发治疗MI/RI提供了实验基础。要点:-去泛素化酶USP25在心肌缺血再灌注损伤(MI/RI)心肌组织中下调。-USP25缺失加重了小鼠MI/RI,而心肌细胞中USP25过表达减轻了这种病理表型。-USP25直接与NLRP3蛋白相互作用,并通过其活性位点C178在K243残基处通过K63连接去泛素化NLRP3,从而影响NLRP3-ASC相互作用和ASC寡聚化,抑制心肌细胞中NLRP3的激活和焦亡。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
USP25在心肌缺血再灌注损伤(MI/RI)中的作用及其分子机制是什么?
核心机制
USP25通过其活性位点C178对NLRP3进行K63连接的去泛素化(在K243位点),从而抑制NLRP3-ASC相互作用和ASC寡聚化,进而抑制NLRP3炎症小体激活和心肌细胞焦亡。
主要证据
USP25敲除加重MI/RI和心脏重构,过表达改善MI/RI;Co-IP和LC-MS/MS证实USP25直接结合NLRP3;突变分析显示C178和K243是关键位点;USP25过表达在NLRP3敲除小鼠中失去保护作用。
研究意义
该研究扩展了USP25在心血管疾病中的保护作用,为基于USP25的MI/RI治疗药物开发提供了实验基础,并可能为NLRP3驱动的疾病提供新的治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

USP25表达变化检测

筛选并验证USP家族在MI/RI中的差异表达,确定USP25是否参与。

对小鼠MI/RI模型心脏组织进行转录组测序,筛选USP家族差异表达基因;通过RT-qPCR在动物模型、心肌细胞及人样本中验证USP25表达。

2

USP25功能缺失和过表达研究

评估USP25在MI/RI中的作用。

利用USP25敲除(USP25−/−)小鼠和心肌细胞特异性过表达USP25(AAV9-cTnT-USP25)的小鼠,进行MI/RI模型,检测心肌梗死面积、心功能、心肌损伤标志物、纤维化和凋亡。

3

USP25底物筛选与验证

鉴定USP25在心肌细胞中调控MI/RI的底物蛋白。

通过Co-IP结合LC-MS/MS在H/R处理的心肌细胞中筛选USP25相互作用蛋白,发现NLRP3;通过Co-IP验证USP25与NLRP3的结合及结合域。

4

USP25对NLRP3活性及焦亡的调控

探究USP25如何调控NLRP3活性及心肌细胞焦亡。

在体外和体内检测USP25对NLRP3-ASC相互作用、ASC寡聚化、caspase-1和GSDMD切割的影响,以及LDH释放和细胞活力。

5

USP25去泛素化NLRP3的机制研究

确定USP25对NLRP3去泛素化的类型、位点和关键氨基酸。

通过IP检测NLRP3的泛素化水平,使用泛素突变体确定连接类型,通过质谱和点突变鉴定泛素化位点,并验证USP25活性位点C178的重要性。

6

体内验证USP25-NLRP3轴

在体内证实USP25通过NLRP3发挥心脏保护作用。

在NLRP3−/−小鼠中过表达USP25,评估MI/RI的严重程度,以及心肌损伤标志物和焦亡相关蛋白变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
伊文思蓝Sigma-AldrichE2129
2,3,5-三苯基氯化四氮唑SolarbioT8170
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清Vazyme--
青霉素/链霉素----
5-溴脱氧尿苷MedChemExpressHY-15910
脂多糖Sigma-Aldrich--
尼日利亚霉素MedChemExpressHY-100381
Opti-MEM培养基Thermo Fisher Scientific31985070
Lipofectamine 3000转染试剂Thermo Fisher ScientificL3000-015
P3000辅助试剂Thermo Fisher Scientific--
细胞计数试剂盒-8BeyotimeC0038
乳酸脱氢酶释放检测试剂盒BeyotimeC0016
碘化丙啶染液SolarbioCA1120
NP-40裂解液BeyotimeP0013F
双琥珀酰亚胺辛二酸酯----
ASC抗体CST67824S
Alexa Fluor 594标记二抗LABSELECT33112ES60
DAPI----
TRIzol试剂Invitrogen15596018
PrimeScript RT试剂盒TakaraDRR037A
SYBR Green试剂盒Takara--
RIPA裂解液Beyotime BiotechnologyP0013C
ASC抗体CST67824S
Caspase-1抗体Santa Cruzsc-56036
泛素抗体Santa Cruzsc-8017
β-actin抗体AbbkineAC026
NLRP3抗体Adipogenag-20B-0014-C100
GSDMD抗体Abcamab215203
USP25抗体Abcamab187156
IL-1β抗体Abcamab9722
COL-1抗体Proteintech14695-1-AP
FLAG抗体Proteintech20543-1-AP
GAPDH抗体Proteintech60004-1-Ig
TGF-β抗体Proteintech21898-1-AP
HA抗体AbmartM20003S
p-P65抗体CST3033
P65抗体CST8242
P38抗体CST8690
p-P38抗体CST463190
JNK抗体CST9252
p-JNK抗体CST4668
ERK抗体CST4695
p-ERK抗体CST4370
HRP标记山羊抗兔二抗BeyotimeA0208
HRP标记山羊抗小鼠二抗BeyotimeA0216
MG132----
AAV9-cTnT-3Flag-T2A-EGFP载体GenechemGV571
Vevo 3100小动物超声成像系统FUJIFILM VisualSonics--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
MI/RI动物模型
小鼠品系(USP25−/−、NLRP3−/−)、周龄(8周)、性别(雄性)、体重(22±2g)、LAD结扎位置(距LAD约2mm)、缺血时间(30分钟)、再灌注时间(急性4小时,慢性2周)、再灌注方式、麻醉方式、随机化和盲法。
阅读提示:Methods部分:Animal experiments(2.1节)
心肌细胞特异性USP25过表达
AAV9血清型(9)、启动子(cTnT)、载体(GV571)、注射剂量(1×10^11 v.g./小鼠)、注射方式(尾静脉)、注射时间(I/R前4周)、基因构建(EV或USP25)。
阅读提示:Methods部分:Animal experiments(2.1节)
体外H/R模型
细胞类型(NRPCs、HL-1等)、缺氧条件(1% O2, 5% CO2, 94% N2)、缺氧时间(4小时)、复氧条件(21% O2)、复氧时间(6小时)、培养基(无糖无FBS DMEM用于缺氧,高糖DMEM用于复氧)。
阅读提示:Methods部分:Cell culture, transfection and viability assessment(2.6节)
焦亡诱导模型
LPS浓度(1μg/mL)、处理时间(6小时)、Nigericin浓度(10μM)、处理时间(30分钟)、溶剂对照。
阅读提示:Methods部分:Cell culture, transfection and viability assessment(2.6节)
泛素化分析
质粒转染(Flag-USP25、His-NLRP3、HA-Ub等)、MG132浓度(10μM)、IP抗体(NLRP3抗体)、检测抗体(Ub-K63抗体)、细胞处理(H/R或LPS)。
阅读提示:Methods部分:Co-IP and western blot analysis(2.12节)、NLRP3 ubiquitination site analysis(2.14节)